Journals / Tüberküloz ve Toraks / 2011 / Cilt: 59 - Sayı: 1

Çocukluk çağı tüberkülozunda genetik yatkınlık

Polymorphisms in NRAMP1 and MBL2 genes and their relations with tuberculosis in Turkish children

Pages
48–54
Publication Date
2022-11-05
DOI
—
🏛️Bibliographic metadata and full text access for this article are provided via DergiPark.
DergiPark Record ↗
✨

AI Summary & Key Takeaways

AI Insight
⚡ TL;DR(Too Long; Didn't Read)

These results shed light on the role of NRAMP1 in susceptibility to tuberculosis disease and provide a plausible explanation for NRAMP1 and MBL genetic heterogeneity in tuberculosis susceptibility.

📌 3 Key Takeaways

🎯
Objective & Hypothesis:In this study, we aimed to determine genetic susceptibility of children group who are under follow up at outpatient and inpatient clinics or newly diagnosed pediatric tuberculosis according to healthy control group.
📊
Key Findings & Data:Patient group consists of 50 cases aged between 0-18 years who are under follow up at outpatient and inpatient clinics or newly diagnosed pediatric tuberculosis between 1996-2009 in Cukurova University, Faculty of Medicine, Department of Pediatrics and the control group consists of 50 healthy cases aged between 0-18 years who have neither chronic nor acute diseases and have no history of tuberculosis contact.
💡
Conclusion & Impact:These results shed light on the role of NRAMP1 in susceptibility to tuberculosis disease and provide a plausible explanation for NRAMP1 and MBL genetic heterogeneity in tuberculosis susceptibility.
🔬Design:Research Article
📍Scope:2009 Verileri
⚙️Variables:Domain Parameters

Abstract

In this study, we aimed to determine genetic susceptibility of children group who are under follow up at outpatient and inpatient clinics or newly diagnosed pediatric tuberculosis according to healthy control group. Patient group consists of 50 cases aged between 0-18 years who are under follow up at outpatient and inpatient clinics or newly diagnosed pediatric tuberculosis between 1996-2009 in Cukurova University, Faculty of Medicine, Department of Pediatrics and the control group consists of 50 healthy cases aged between 0-18 years who have neither chronic nor acute diseases and have no history of tuberculosis contact. Analysis of NRAMP1 (D543N, 3’-UTR and INT4 loci) and MBL (codon 54 and 57) gene polymorphisms carried out in Cukurova University, Faculty of Medicine, Department of Medical Biology and Genetics. In this study comprising in total 50 individuals we did not observe any significant association with microsatellite polymorphisms at the INT4, G543A and 3-UTR loci situated in the NRAMP1 gene (p> 0.005). There was no significant difference of MBL gen frequency polimorphisms of codon 54 and 57 polimorphisms between patient and control group statistically (p> 0.05). We reported that the INT4, G543A and 3-UTR loci microsatellite polymorphisms in the NRAMP1 gene were not associated with tuberculosis. No significant associations were also observed for codons 54 and 57 in the MBL2 gene. These results shed light on the role of NRAMP1 in susceptibility to tuberculosis disease and provide a plausible explanation for NRAMP1 and MBL genetic heterogeneity in tuberculosis susceptibility.

Özet

Bu çalışmada Çukurova Üniversitesi Çocuk Sağlığı ve Hastalıkları servisinde yatarak veya polikliniğinde ayaktan takip altında olan veya yeni tanı alan, 0-18 yaş arası pediatrik tüberküloz tanısı almış hasta grubunun, kontrol grubuna oranla tüberküloza genetik yatkınlığının belirlenmesi amaçlanmıştır. 1996-2009 yılları arasında Çukurova Üniversitesi Çocuk Sağlığı ve Hastalıkları servisinde yatarak veya polikliniğinde ayaktan takip altında olan veya yeni tanı alan, 0-18 yaş arası pediatrik tüberküloz tanısı almış 50 olgu hasta grubu, altta yatan herhangi bir kronik hastalığı ve akut hastalık tablosu söz konusu olmayan, daha önceden tüberküloz temas öyküsü bulunmayan, sağlıklı 0-18 yaş arası bireylerden seçilen 50 olgu kontrol grubu olarak belirlendi. NRAMP1 ve MBL gen polimorfizmlerinin belirlenmesi için hasta ve kontrol grubundaki bireylerden 4’er cc periferik venöz kan örneği alınarak Çukurova Üniversitesi, Tıp Fakültesi, Tıbbi Biyoloji Anabilim Dalı genetik laboratuvarına analiz için gönderildi. Elde edilen verilerle; Çukurova Üniversitesi, Tıp Fakültesi Biyoistatistik Anabilim Dalında istatistiksel analiz yapıldı. NRAMP1 genin sık görülen polimorfizmlerinden; D543N, 3'-UTR ve INT4 polimorfizmleri açısından hasta grubu ve kontrol grubu olgular arasında istatistiksel bir farklılık saptanmamıştır. MBL geninin sık görülen polimorfizmlerinden KODON 54 ve KODON 57 polimorfizmleri açısından hasta grubu ve kontrol grubu arasında istatistiksel bir farklılık saptanmamıştır. Bu değerler göz önünde bulundurulduğunda her iki grup arasında; NRAMP1 ve MBL gen polimorfizmleri açısından istatistiksel açıdan belirgin farklılık saptanmamıştır. Bu çalışmada hasta grubu ve kontrol grubu arasında NRAMP1 ve MBL gen polimorfizmleri açısından belirgin istatistiksel farklılık saptanmamıştır. Literatürdeki diğer benzer çalışmalardaki pozitif sonuçlar; bu çalışmalardaki olgu sayısı yüksekliği ya da sosyoekonomik, ırksal, çevresel ve coğrafi faktörlerin farklılığını düşündürmektedir. Bu açıdan özellikle olgu sayısının artırılması ve bu etkenlerin daha spesifiye edilebilmesi açısından çalışmanın devamına karar verilmiştir.

🔖

Cite This Article

DEMİRHAN, O., AKSARAY, N., SOLĞUN, H. A., İNAN, İ., TAŞDEMİR, D. (2022). Çocukluk çağı tüberkülozunda genetik yatkınlık. Tüberküloz ve Toraks, Cilt: 59 - Sayı: 1, 48–54. https://ajindex.com/articles/619394

📄 Full Text PDF Viewer

📄

PDF görüntüleyici hazırlanıyor...

References (16)

  1. World Health Organization. Global tuberculosis control. Surveillance, planning, financing. WHO report; 2004
  2. Lavebratt C, Apt AS, Nikonenko BV, et al. Severity of tuberculosis in mice is linked to distal chromosome 3 and proximal chromosome 9. J Infect Dis 1999; 180: 150-5
  3. Kramnik I, Dietrich WF, Demant P, Bloom BR. Genetic control of resistance to experimental infection with virulent Mycobacterium tuberculosis. Proc Natl Acad Sci USA 2000; 97: 8560-5
  4. Mitsos LM, Cardon LR, Fortin A, et al. Genetic control of susceptibility to infection with Mycobacterium tuberculosis in mice. Genes Immun 2000; 1: 467-77
  5. Sanchez F, Radaeva TV, Nikonenko BV, et al. Multigenic control of disease severity after virulent Mycobacterium tuberculosis infection in mice. Infect Immun 2003; 71: 126-31
  6. Pan H, Yan BS, Rojas M, et al. Ipr 1 gene mediates innate immunity to tuberculosis. Nature 2005; 434: 767-72
  7. Stead WW, Senner JW, Reddick WT, Lofgren JP. Racial differences in susceptibility to infection by Mycobacterium tuberculosis. N Engl J Med 1990; 322: 422-7
  8. Kallmann FJ, Reisner D. Am Rev Tuberc 1943; 47: 549-74
  9. Comstock GW. Tuberculosis in twins: a re-analysis of the prophit survey. Am Rev Respir Dis 1978; 117: 621-4
  10. Marquet S, Schurr E. Genetics of susceptibility to infectious diseases: tuberculosis and leprosy as examples. Drug Metab Dispos 2001; 29: 479-83
  11. Casanova JL, Abel L. Genetic dissection of immunity to mycobacteria: the human model. Annu Rev Immunol 2002; 20; 581-620
  12. Hoal EG, Lewis LA, Jamieson SE, et al. SLC11A1 (NRAMP1) but not SLC11A2 (NRAMP2) polymorphisms are associated with susceptibility to tuberculosis in a high-incidence community in South Africa. Int J Tuberc Lung Dis 2004; 8; 1464- 71
  13. Gros P, Schurr E. In: Bellamy R (ed). Susceptibility to Infectious Diseases. Cambridge: Cambridge Univ Press, 2004: 221- 58, 507-12
  14. Greenwood CM, Fujiwara TM, Boothroyd LJ, et al. Linkage of tuberculosis to chromosome 2q35 loci, including NRAMP1, in a large aboriginal Canadian family. Am. J. Hum Genet 2000; 67: 405-16
  15. Shaw MA, Collins A, Peacock CS, et al. Evidence that genetic susceptibility to Mycobacterium tuberculosis in a Brazilian population is under oligogenic control: linkage study of the candidate genes NRAMP1 and TNFA. Tuber Lung Dis 1997; 78: 35-45
  16. Gao PS, Fujishima S, Mao XQ, et al. Genetic variants of NRAMP1 and active tuberculosis in Japanese populations. International Tuberculosis Genetics Team.