Journals / Bitki Koruma Bülteni / 2014 / Cilt: 54 - Sayı: 1

The identification of virus diseases in olive trees in Aydın, Balıkesir and Gzmir provinces and the determination of their present status

Aydın, Balıkesir ve Gzmir illerinde zeytin ağaçlarındaki viral hastalık etmenlerinin tanılanması ve bulunma durumlarının belirlenmesi1

Pages
45–67
Publication Date
2022-10-10
DOI
—
🏛️Bibliographic metadata and full text access for this article are provided via DergiPark.
DergiPark Record ↗
✨

AI Summary & Key Takeaways

AI Insight
⚡ TL;DR(Too Long; Didn't Read)

Other viruses including OLV-1, OLV-2, OLV-3, OLRSV and OLYaV were notdetected in all samples.

📌 3 Key Takeaways

🎯
Objective & Hypothesis:The present study was carried out to determine the presence and prevalence of the viralagents in olive production areas of Aydın, Balıkesir and Gzmir in 2009-2010.
📊
Key Findings & Data:In 2009,totally 293 samples were collected from Aydın (157) and Izmir (136) provinces.
💡
Conclusion & Impact:Other viruses including OLV-1, OLV-2, OLV-3, OLRSV and OLYaV were notdetected in all samples.
🔬Design:Lab & Field Experiment
📍Scope:2009-2010 · 293 samples
⚙️Variables:Domain Parameters

Abstract

The present study was carried out to determine the presence and prevalence of the viralagents in olive production areas of Aydın, Balıkesir and Gzmir in 2009-2010. In 2009,totally 293 samples were collected from Aydın (157) and Izmir (136) provinces. In 2010,with collected 82 samples from Balıkesir, the total sample number in the research hasreached to 375. To identify viral agents, the biological, serological and molecular methodswere applied to collected olive samples. DAS-ELISA method was used to detect Arabismosaic virus (ArMV), Cucumis mosaic virus (CMV), Cherry leafroll virus (CLRV) andStrawberry latent ringspot virus (SLRSV). Also, the existence of Olive latent-1 virus(OLV-1), Olive latent-2 virus (OLV-2), Olive latent-3 virus (OLV-3), Olive latent ringspotvirus (OLRSV) and Olive leaf yellowing-associated virus (OLYaV) in the samples wasanalysed by RT-PCR molecular method. The results of RT-PCR analyses showed that theincidence of virus infection was 55.73%in total 375 olive samples from Aydın, Balıkesirand Izmir in 2009 and 2010. According to individual provinces, it was 22.66% in Aydın,11.46 in Balıkesir and 21.60% in Izmir. DAS-ELISA results revealed that infection rate ofArMV was 12.8% in total samples and only 1 sample was found to be infected withSLRSV while other tested viruses were not present. According to the data from RT-PCRtests, infection rates in all tested samples were 22.93%, 9.60%, 10.66% and 9.06% forArMV, CMV, CLRV and SLRSV, respectively. Moreover, it was ascertained that 9samples were infected by CMV + CLRV and 4 samples by ArMV + CLRV as mixedinfections. Other viruses including OLV-1, OLV-2, OLV-3, OLRSV and OLYaV were notdetected in all samples.

Özet

Bu çalışma 2009 ve 2010 yılları arasında Aydın, Balıkesir ve İzmir illerinde yaygın olarak zeytin yetiştiriciliği yapılan üretim alanlarındaki virüs hastalıklarının belirlenmesi ve toplanan örneklerde virüslerin bulunma durumlarının ortaya konması amacıyla 2009 yılında Aydın (157) ve İzmir (136) illerinden 293 örnek, 2010 yılında ise Balıkesir ilinden 82 örnek olmak üzere toplam 375 örnek alınarak yürütülmüştür. Zeytin örneklerindeki viral etmenlerin tanılanması biyolojik, serolojik ve moleküler yöntemler kullanılarak yapılmıştır. Arabis mosaic virus (ArMV), Cucumber mosaic virus (CMV), Cherry leafroll virus (CLRV) ve Strawberry latent ringspot virus (SLRSV) adlı etmenlere ait tanı kitleri kullanılarak, örnekler DAS-ELISA yöntemine göre testlenmiştir. Bu virüslere ek olarak, örneklerde Olive latent-1 virus (OLV-1), Olive latent-2 virus (OLV-2),Olive latent-3 virus (OLV-3), Olive latent ringspot virus (OLRSV) ve Olive leaf yellowing-associated virus (OLYaV) adlı virüslerin varlığı RT-PCR yöntemi ile araştırılmıştır. RT-PCR sonuçları, 2009 ve 2010 yıllarında Aydın, Balıkesir ve İzmir illerinden toplanarak testlenen toplam 375 bitki örneğinde %55.73 oranında viral enfeksiyon bulunduğunu ve bu oranın Aydın ilinde %22.66, Balıkesir ilinde %11.46 ve İzmir ilinde ise %21.60 düzeyinde olduğunu ortaya koymuştur. DAS-ELISA sonuçlarına göre; örneklerin %12.80"inde ArMV ve sadece 1 örnekte ise SLRSV enfeksiyonunun var olduğu ve test edilen diğer virüslerin ise bulunmadığı saptanmıştır. RT-PCR testi sonucunda, örneklerin %22.93"ünde ArMV, %9.60"ında CMV, %10.66"sında CLRV ve %9.06"sında SLRSV enfeksiyonlarının var olduğu görülmüştür. Buna ek olarak, 9 örnekte CMV+ CLRV, 4 örnekte ise ArMV+CLRV karışık enfeksiyon şeklinde tespit edilirken, tüm örneklerde OLV-1, OLV-2, OLV-3, OLRSV ve OLYaV"nin bulunmadığı belirlenmiştir.

🔖

Cite This Article

ERKAN, S., ERİLMEZ, S. (2022). The identification of virus diseases in olive trees in Aydın, Balıkesir and Gzmir provinces and the determination of their present status. Bitki Koruma Bülteni, Cilt: 54 - Sayı: 1, 45–67. https://ajindex.com/articles/466365

📄 Full Text PDF Viewer

📄

PDF görüntüleyici hazırlanıyor...

References (6)

  1. Alabdullah A., El Beaino T., Saponari M., Hallak H. and Digiaro M., 2005. Preliminary evaluation of the status of olive-infecting viruses in Syria. EPPO Bulletin, 35 (2): 249-252.
  2. Alabdullah A., Elbeaino T., Minafra A., Digiaro M. and Martelli G.P., 2009. Detection and variability of olive latent virus 3 in the mediterranean region. J. Plant Pathol., 91 (3): 521-525. Anonim 2010. http://www.tuik.gov.tr. (EriGim Tarihi: 01 Temmuz 2012) Anonymous 2010. http://faostat.fao.org/site/567/DesktopDefault.aspx?PageID=567#ancor (EriGim Tarihi: 05 Nisan 2012) Beler Ö. ve Açıkgöz S., 2005. Ege ve Marmara Bölgelerindeki zeytin fidanlıkları ve ağaçlarında görülen bazı virüs hastalıklarının Elisa testi ile saptanması. ADÜ Ziraat Fakültesi Dergisi, 2(1): 79-84. Bora T. ve Karaca G., 1970. Kültür Bitkilerinde Hastalığın ve Zararın Ölçülmesi. Ege Üniv. Ziraat Fak., Yardımcı Ders Kitabı, No: 167, 43 p. Brunt A.A., Crabtree K., Dallwitz M.J., Gibbs A.J., Watson L. and Zurcher E.J., 1996. `Plant Viruses Online: Descriptions and Lists from the VIDE Database. Version: 20 th August 1996. URL http://biology.anu.edu.au/Groups/MES/vide/ (EriGim tarihi: 25 Ağustos 2012)
  3. Candresse T., Lannneau T., Revers F., Grasseau N., Macquaire G., German S., Malinowsky T. and Dunez J. 1995. An Immunocapture PCR assay adapted to the detection and the analysis of the moleculer varibality of apple chlorotic leafspotvirus. Acta Hortic., 386: 136-147.
  4. Cardoso J.M.S., Felix M.R.,Clara M.I.E and Oliveira S. 2005. The complete genome sequence of a new necrovirus isolated from Olea europea L. Archives of Virology, 150: 815-823. Clark M.F. and Adams A.N., 1977. Characteristics of the Microplate Method of EnzymeLinked Immunosorbent Assay for the Detection of Plant Viruses. J. Gen. Virology, 34, 475-483. Clark M.F.1981. Immunosorbent Assays in Plant Pathology. Ann. Rev. Phytopathol.,19, 83-106.
  5. Çağlayan K., Faggioli F. and Barba M. 2011. Viruses, phytoplasmas and diseases of unknown etiology of olive viruses. In: Virus and Virus-like Diseases of Pome and Stone Fruits (Eds. A. Hadidi, M. Barba, T. Candresse, W. Jelkmann). APS Press. p. 289-297.
  6. Çağlayan K., Fidan U., Tarla G., and Gazel M. 2004, First report of olive viruses in Turkey. J. Plant Pathol., 86 (1): 89-90. ÇavuGoğlu A., 1980. Ege Bölgesinin Belli BaGlı Yerli ve Yabancı Zeytin ÇeGitlerinin Pomolojik Özellikleri Üzerinde AraGtırmalar. Sonuç Raporu. Zeytincilik AraGtırma Enstitüsü, Gzmir. Demirci M. ve BölükbaGı B., 2003. Akdeniz Beslenme Tarzında Ze