AI Summary & Key Takeaways
AI InsightIt was concluded that AB breed is more closely related to EAR breed than to SAR breed while TG breed was determined as a distinct group from other breeds.
📌 3 Key Takeaways
Abstract
The purpose of this study was to identify the genetic relationship and variations within and between local cattle breeds of Turkey using RAPD-PCR method which needs fewer substructures when compared to other DNA fingerprinting methods. The RAPD-PCR method was performed on blood samples of 77 animals from four breeds namely Anatolian Black (AB), East Anatolian Red (EAR), South Anatolian Red (SAR) and Turkish Grey Steppe (TG). A set of ten arbitrary 10-mer primers were used to detect the DNA polymorphisms in the whole genome. Estimation of the genetic distances between the breeds was conducted through the FST Distant Estimation Method, and cluster trees were constructed by UPGMA Method. Based on the band sharing method, the average genetic variances of the breeds varied from 0.637 (in TG) to 0.809 (in SAR), AB and EAR had 0.792 and 0.787, respectively. It was concluded that AB breed is more closely related to EAR breed than to SAR breed while TG breed was determined as a distinct group from other breeds.
Özet
Bu çalışmada, diğer DNA parmak izi yöntemleri ile karşılaştırıldığında daha az alt yapıya ihtiyaç duyan RAPD-PCR metodu kullanılarak Türkiye yerli sığır ırklarında ırk içi ve ırklar arası genetik ilişki ve genetik varyasyonların belirlenmesi amaçlanmıştır. RAPD-PCR metodu Yerli Kara (YK), Doğu Anadolu Kırmızısı (DAK), Güney Anadolu Kırmızısı (GAK) ve Boz Irk’tan (BI) toplam 77 hayvandan alınan kan örnekleri kullanılarak yapılmıştır. DNA’larda polimorfizmleri belirlemek için 10 bazdan oluşan 10 primer seti kullanılmıştır. Irklar arası mesafe FST Mesafe Tahmin Metoduyla, ırklara ait gruplama ağaçları UPGMA metoduyla yapılmıştır. Bantların varlığına göre ırkların ortalama genetik varyansları 0,637 (BI)’den 0,809 (GAK)’a kadar değiştiği görülmüştür. YK ırkının DAK ırkına GAK ırkından daha yakın olduğu, BI ise her üç ırktan farklı bir kümede bulunduğu belirlenmiştir.