Journals / Adıyaman Üniversitesi Fen Bilimleri Dergisi / 2021 / Cilt: 11 - Sayı: 1

In-depth Profiling of N-glycans Isolated from Ostrich Egg White and Yolk Glycoproteomes by HPLC-HILIC-FLD-MS/MS

Devekuşu Yumurta Akı ve Sarısı Glikoproteomlarından İzole Edilmiş N-glikanların HPLC-HILIC-FLD-MS/MS ile Derinlemesine Profillenmesi

Pages
191–204
Publication Date
2022-10-12
DOI
—
🏛️Bibliographic metadata and full text access for this article are provided via DergiPark.
DergiPark Record ↗
✨

AI Summary & Key Takeaways

AI Insight
⚡ TL;DR(Too Long; Didn't Read)

The obtained data showed that N-glycan profiles of ostrich egg white and yolk glycoproteomes differedsignificantly.

📌 3 Key Takeaways

🎯
Objective & Hypothesis:Protein glycosylation is an essential post-translational modification and modulates criticalcellular events.
📊
Key Findings & Data:Samples were analyzed by HPLC-HILIC-FLD-MS/MS(high-performance hydrophilic interaction liquid chromatography with fluorescence and tandemmass spectrometric detection).
💡
Conclusion & Impact:The obtained data showed that N-glycan profiles of ostrich egg white and yolk glycoproteomes differedsignificantly.
🔬Design:Research Article
📍Scope:Comprehensive Sample
⚙️Variables:Domain Parameters

Abstract

Protein glycosylation is an essential post-translational modification and modulates criticalcellular events. It is known that N-glycosylated proteins from egg white and yolk are playedcrucial roles in various cellular pathways. Characterization of N-glycan structures ofglycoproteomes is required to understand these functions. Therefore, this study is aimed tocharacterize the N-glycan profiles of ostrich egg white and yolk glycoproteomes. In the study, Nglycans were released from ostrich egg white and yolk glycoproteomes by an enzymatical processand labeled with a procainamide tag. Samples were analyzed by HPLC-HILIC-FLD-MS/MS(high-performance hydrophilic interaction liquid chromatography with fluorescence and tandemmass spectrometric detection). The number of detected N-glycans obtained from ostrich egg whiteand yolk glycoproteomes was found to be 39 and 36, respectively. It was determined that Nglycans of ostrich egg white glycoproteome were highly galactosylated (96.64%). In addition,bisecting N-glycans were abundant in ostrich egg white glycoproteome (91.72%) compared toostrich egg yolk glycoproteome (6.74%). The abundance of high-mannose N-glycans wasdramatically higher in the ostrich egg yolk glycoproteome (55.84%) than the ostrich egg yolkglycoproteome (2.67%). The fucosylation ratio of N-glycans belonging to ostrich egg white andyolk glycoproteomes was detected to be 4.52% and 0.95%, respectively. The obtained data showed that N-glycan profiles of ostrich egg white and yolk glycoproteomes differedsignificantly.

Özet

Protein glikozilasyonu önemli bir post-translasyonel modifikasyondur ve kritik hücresel olayları kontrol eder. Yumurta akı ve sarısından elde edilen N-glikozile proteinlerin çeşitli hücresel yolaklarda önemli roller oynadığı bilinmektedir. Bu fonksiyonları anlamak için glikoproteomlara ait N-glikan yapılarının karakterizasyonu gereklidir. Bu nedenle, bu çalışma devekuşu yumurtası akı ve yumurta sarısı glikoproteomlarının N-glikan profillerini karakterize etmeyi amaçlamaktadır. Çalışmada, devekuşu yumurta akı ve sarısı glikoproteomlarından Nglikanlar enzimatik bir süreçle salındı ve bir prokainamid etiketi ile etiketlendi. Örnekler, HPLCHILIC-FLD-MS/MS (yüksek performanslı hidrofilik etkileşim sıvı kromatografisi ile floresans ve ikili kütle spektrometrik dedeksiyon) ile analiz edildi. Devekuşu yumurta akı ve sarısı glikoproteomlarından tespit edilen N-glikan sayıları sırasıyla 39 ve 36 olarak bulundu. Devekuşu yumurtası akı glikoproteomunun N-glikanlarının yüksek oranda galaktozile olduğu (%96,64) belirlendi. Ek olarak, bisekte N-glikanların devekuşu yumurtası akı glikoproteomunda (%91.72) devekuşu yumurta sarısı glikoproteomuna (%6.74) kıyasla bol miktarda bulunmuştur. Devekuşu yumurta sarısı glikoproteomunda yüksek mannozlu N-glikanların bolluğu (%55.84) devekuşu yumurta sarısı glikoproteomundan (%2.67) önemli ölçüde daha yüksek olduğu belirlendi. Devekuşu yumurtası akı ve sarısı glikoproteomlarına ait N-glikanların fukozlanma oranı sırasıyla %4.52 ve %0.95 olarak tespit edilmiştir. Elde edilen veriler, devekuşu yumurtası akı ve sarısı glikoproteomlarının N-glikan profillerinin önemli ölçüde farklılık gösterdiğini göstermiştir.

🔖

Cite This Article

KAYILI, H. M. (2022). In-depth Profiling of N-glycans Isolated from Ostrich Egg White and Yolk Glycoproteomes by HPLC-HILIC-FLD-MS/MS. Adıyaman Üniversitesi Fen Bilimleri Dergisi, Cilt: 11 - Sayı: 1, 191–204. https://ajindex.com/articles/428400

📄 Full Text PDF Viewer

📄

PDF görüntüleyici hazırlanıyor...

References (14)

  1. Başaran, E., Aras, S., Cansaran-Duman, D., Genomik, proteomik, metabolomik kavramlarına genel bakış ve uygulama alanları, Türk Hijyen ve Deneysel Biyoloji Dergisi, 67, 85-96, 2010
  2. Vu, L.D., Gevaert, K., De Smet, I., Protein language: post-translational modifications talking to each other, Trends in Plant Science, 23, 1068-1080, 2018
  3. Oliveira-Ferrer, L., Legler, K., Milde-Langosch, K., Role of protein glycosylation in cancer metastasis, Seminars in Cancer Biology, 44, 141-152, 2017
  4. Mathew, M.P., Donaldson, J.G., Glycosylation and glycan interactions can serve as extracellular machinery facilitating clathrin- independent endocytosis, Traffic, 20, 295-300, 2019
  5. Özaydin, E., Yalçin, F., Gündüz, M., Köse, G., Konjenital glikozilasyon bozukluğu tip II, Türkiye Çocuk Hastalıkları Dergisi, 6, 47-53, 2012
  6. Omana, D.A., Wang, J., Wu, J., Ovomucin - a glycoprotein with promising potential. Trends Food Sci Technol., 21, 455-463, 2010
  7. Kobayashi, K., Hattori, M., Hara-Kudo, Y., Okubo, T., Yamamoto, S., Takita, T., Sugita-Konishi, Y., Glycopeptide derived from hen egg ovomucin has the ability to bind enterohemorrhagic Escherichia coli O157:H7, J Agric Food Chemistry, 52, 5740-5746, 2004
  8. Sharif, M.K., Saleem, M., Javed, K., Chapter 15 - Food materials science in egg powder industry, Role of Materials Science in Food Bioengineering, Elsevier press, 505-537, 2018
  9. Kovacs-Nolan, J., Phillips, M., Mine, Y., Advances in the value of eggs and egg components for human health, Journal of Agricultural and Food Chemistry, 53, 8421-8431, 2005
  10. Smith, D.F., Cummings, R.D., Song, X., History and future of shotgun glycomics, Biochemical Society Transactions, 1, 1-11, 2019
  11. Dong, X., Huang, Y., Cho, B.G., et al., Advances in mass spectrometry- based glycomics, Electrophoresıs, 39, 3063-3081, 2018
  12. Keser, T., Pavić, T., Lauc, G., Gornik, O., Comparison of 2-Aminobenzamide, Procainamide and RapiFluor-MS as derivatizing agents for High-Throughput HILIC-UPLCFLR-MS N-Glycan analysis, Frontiers in Chemistry, 6, 324, 2018
  13. Kayili, H.M., Avci, İ., Salih, B., A new Titania Glyco-Purification Tip for the fast enrichment and efficient analysis of glycopeptides and glycans by MALDI-TOF-MS, Journal of Pharmaceutical and Biomedical Analysis, 174, 191–197, 2019
  14. Kayili, H.M., Barlas, N., Atakay, M., Salih, B., Fast purification of glycans and glycopeptides using silk-packed micropipette tip for matrix-assisted laser desorption/ionizati