Journals / Dicle Tıp Dergisi / 2017 / Cilt: 44 - Sayı: 1

Evaluation of Plasma DNA Methyltransferases and Methy-CpG Binding Protein Levels in Patients with Lung Cancer

Akciğer Kanserli Hastalarda Plazma DNA Metiltransferaz ve Metil- CpG'ye Bağlanan Protein Seviyelerinin Değerlendirilmesi

Pages
57–64
DOI
—
🏛️Bibliographic metadata and full text access for this article are provided via DergiPark.
DergiPark Record ↗
✨

AI Summary & Key Takeaways

AI Insight
⚡ TL;DR(Too Long; Didn't Read)

It is considered that our findings may contribute to researches for the early diagnosis of lung cancer and support the using of methylation associated proteins as molecular markers.

📌 3 Key Takeaways

🎯
Objective & Hypothesis:Objective: Lung cancer is a fatal disease caused by uncontrolled growth of lung tissue cells.
📊
Key Findings & Data:DNA methylation is one of the important epigenetic changes, catalyzed by DNA methyltransferases (DNMTs) and performed with methyl-CpG binding proteins (MBD1, MBD2, MeCP2 etc.).
💡
Conclusion & Impact:It is considered that our findings may contribute to researches for the early diagnosis of lung cancer and support the using of methylation associated proteins as molecular markers.
🔬Design:Research Article
📍Scope:Comprehensive Sample
⚙️Variables:Domain Parameters

Abstract

Objective: Lung cancer is a fatal disease caused by uncontrolled growth of lung tissue cells. It has been known that environmental factors, genetic and epigenetic changes are lead to tumorigenesis. DNA methylation is one of the important epigenetic changes, catalyzed by DNA methyltransferases (DNMTs) and performed with methyl-CpG binding proteins (MBD1, MBD2, MeCP2 etc.). In this study we aimed to determine the association between plasma levels of methylation associated proteins and lung cancer risk. Methods: The plasma levels of DNMT1, DNMT2 (TRDMT1), DNMT3A, DNMT3B, MeCP2, MBD1 and MBD2 measured with Sandwich-ELISA method in 90 of lung cancer patients (non-small cell: 78, small cell: 12) and 90 of healthy controls. Statistical analysis was performed with appropriate statistical methods. Results: When comparing the DNMT3a, MBD2 and MeCP2 levels, no significant differences were found between lung cancer patients and controls (p>0.05). The plasma concentration of DNMT1, TRDMT1, DNMT3b and MBD1 were found to be significantly high in lung cancer patients (p<0.05). Conclusion: As a result of our research, we found a significant relation between increased plasma levels of DNMT1, TRDMT1, DNMT3b and MBD1 and lung cancer. It is considered that our findings may contribute to researches for the early diagnosis of lung cancer and support the using of methylation associated proteins as molecular markers.

Özet

Amaç: Akciğer kanseri, akciğer doku hücrelerinin kontrolsüz çoğalmasıyla oluşan ölümcül bir hastalıktır. Çevresel faktörlerle birlikte genetik ve epigenetik değişikliklerin kanser gelişimine neden olduğu bilinmektedir. DNA metilasyonu en önemli epigenetik değişimlerden biri olup, DNA metiltransferaz (DNMT) enzimleri tarafından katalizlenir ve metile-CpG'ye bağlanan proteinler (MBD1, MBD2, MeCP2 vb) yardımıyla gerçekleşir. Çalışmamızda metilasyon ilişkili proteinlerin plazma seviyeleri ile akciğer kanseri riski arasındaki ilişkinin araştırılması amaçlanmıştır. Yöntemler: Araştırmamızda DNMT1, DNMT2 (TRDMT1), DNMT3A, DNMT3B, MeCP2, MBD1 ve MBD2 seviyeleri, 90 akciğer kanseri hastası (küçük hücreli dışı: 78, küçük hücreli:12) ve 90 kontrol bireyden elde edilen plazma örneklerinde Sandwich-ELISA yöntemi ile ölçüldü. Sonuçlar uygun istatistiksel yöntemler ile değerlendirildi. Bulgular: Kontrol ve akciğer kanserli hastaların DNMT3a, MBD2 ve MeCP2 seviyeleri arasında fark bulunmamıştır (p>0.05). DNMT1, TRDMT1, DNMT3b ve MBD1 seviyeleri ise kontrol ile karşılaştırıldığında akciğer kanserli bireylerde anlamlı oranda yüksek bulunmuştur (p<0.05). Sonuç: Araştırmamız sonucunda yüksek DNMT1, TRDMT1, DNMT3b ve MBD1 plazma seviyeleri ile akciğer kanseri arasında önemli bir ilişkili bulunmuştur. Bulgularımız, hastalığın erken tanısına yönelik araştırmalara katkı sağlayabileceği gibi, metilasyon ilişkili proteinlerin moleküler tanı aracı olarak ta kullanılabileceğini desteklemektedir

🔖

Cite This Article

ÖZBAYER, C., ÜSTÜNER, D. A., AK, G. A., SAYDAM, F., METİNTAŞ, M., DEĞİRMENCİ, İ. (2017). Evaluation of Plasma DNA Methyltransferases and Methy-CpG Binding Protein Levels in Patients with Lung Cancer. Dicle Tıp Dergisi, Cilt: 44 - Sayı: 1, 57–64. https://ajindex.com/articles/348839

📄 Full Text PDF Viewer

📄

PDF görüntüleyici hazırlanıyor...

References (10)

  1. Yaykaşlı KO, Hatipoğlu ÖF, Ertuğrul K, Yaykaşlı E. Epigenetik mekanizmalar ve kanser. Dicle Tıp Dergisi. 2012; 14:58-68. Kaymak A: Farklı kanserlerin hücre hatlarında demetilasyon oluşturulması ile tümör süpresör ve stamp ailesi gen ifade değişikliklerinin incelenmesi. Yüksek Lisans Tezi. İzmir: Ege Üniversitesi Sağlık Bilimleri Enstitüsü; 2012.
  2. Novik K, Nimmrich I, Genc B, et al. Epigenomics: genome-wide study of methylation phenomena. Current issues in molecular biology. 2002;4:111-28. Onay H: Konvansiyonel renal hücreli kanser oluşumunda durumunun araştırılması. Doktora Tezi. İzmir: Ege Üniversitesi 2006. olan genlerin metilasyon Çelik S: Kronik miyeloid lösemili hastalarda dap kinaz geninin metilasyon analizleri. Yüksek Lisans Tezi. Ankara:
  3. Ankara Üniversitesi, Biyoteknoloji Enstitüsü; 2007. Zakhari S. Alcohol metabolism and epigenetics changes. Alcohol research: current reviews. 2013; 35:6- 16. Subramaniam D, Thombre R, Dhar A, Anant S. DNA methyltransferases: a novel target for prevention and therapy. Frontiers in oncology. 2014; doi: 10.3389/ fonc.2014.00080 Robertson KD. DNA methylation and chromatin- unraveling the tangled web. Oncogene. 2002; 21:5361- 79. Alberts B, Johnson A, Lewis J, et al.: Molecular biology of the cell, 4th edition edn. New York: Garland Science; 2002. Bozkurt S: Imatinib mesilat-dirençli ve dirençsiz kronik myeloid lösemi hücre hatlarında bim ve bid proapoptotik genlerinin polikomb grup proteinleri tarafından epigenetik regülasyonu. Doktora Tezi. Ankara:
  4. Ankara Üniversitesi, Sağlık Bilimleri Enstitüsü 2010. Varol N: Akut Lösemilerde Socs-1 Geninin Metilasyon Analizi. Yüksek Lisans Tezi. Ankara:
  5. Ankara Üniversitesi, Sağlık Bilimleri Enstitüsü 2007.
  6. Goll MG, Kirpekar F, Maggert KA, et al. Methylation of tRNAAsp by the DNA methyltransferase homolog Dnmt2. Science. 2006;311:395-8.
  7. Bodur E, Demirpençe E. Kodlamayan RNA'lar ve gen susturumu. Hacettepe Tıp Dergisi. 2010; 41:82-9.
  8. Parry L, Clarke AR. The roles of the methyl-CpG binding proteins in cancer. Genes & cancer. 2011; 2:618-30. Wade PA. Methyl CpG-binding proteins and transcriptional repression. Bioessays. 2001;23:1131-7. Sayin DB. Methylation and cancer: Review. Turkiye Klinikleri Journal of Medical Sciences. 2008;28:513-24.
  9. Garzon R, Liu S, Fabbri M, et al. MicroRNA-29b induces global DNA hypomethylation and tumor suppressor gene reexpression in acute myeloid leukemia by targeting directly DNMT3A and 3B and indirectly DNMT1. Blood. 2009; 113:6411-8.
  10. Tang M, Xu W, Wang Q,