AI Summary & Key Takeaways
AI InsightIt will help prevent resistance development by avoiding the use of unnecessary antibiotics.
📌 3 Key Takeaways
Abstract
Introduction: In clinical microbiology laboratories, urine specimens are the most frequently analysed specimens. Rapid and reliable methods are needed especially for no growth culture. In this study, the performance of the Sysmex UF-1000i instrument was compared with the culture results for the purpose of fast and reliable evaluation of the urine specimens. Materials and Methods: 9525 urine samples sent for urine culture to the Central Laboratory between February 2018-April 2018 were evaluated retrospectively. The culture results and the leukocyte and bacterial results obtained from the fluorescence flow cytometer were matched and statistical analysis was performed by applying SPSS 15.00. ROC curves were plotted to determine the cut-off in 100% negative predictive value and 100% sensitivity to be used for leukocyte and bacterial screening. Results: 9.6% of the urine specimens were reported to have shown growth, 33.4% were contaminated, and 57% did not show growth. The cut off value with 100% negative predictive value and the highest elimination rate in male and pediatric patients in this study were as follows: bacteria < 50/μL, leukocytes 15/μL, and in female patients as < 50/μL of bacteria and 10/μL. It was determined that 63.63% of the cases in male patients, 52.54% in pediatric patients and 19.06% in female patients did not require a culture study. Conclusion: The flow cytometry system allows pre-culture screening to be accomplished in significant quantities without being subjected to culture. It will help prevent resistance development by avoiding the use of unnecessary antibiotics.
Özet
Giriş: Mikrobiyoloji laboratuvarlarında idrar örnekleri en sık değerlendirilen örnek türüdür. Özellikle üremesiz örnekler için hızlı ve güvenilir yöntemlere ihtiyaç vardır. Çalışmamızda idrar örneklerinde sitometrik (Sysmex UF-1000i cihazı ile) olarak belirlenen bakteri ve lökosit sayısı ile kültür sonuçları karşılaştırılmıştır. Yaş ve cinsiyete göre %100 negatif öngörü değeri belirleyeceğimiz eşik değerlerini saptayarak hızlı bir tarama algoritması oluşturmak amaçlandı. Materyal ve Metod: Laboratuvarımıza Şubat 2018- Nisan 2018 tarihleri arasında idrar kültürü ve tam idrar tetkiki için eş zamanlı gönderilen 9525 idrar örneğinin sonuçları geriye dönük olarak incelenmiştir. Kültür sonuçları ve floresan akım sitometriden alınan mikrolitredeki lökosit ve bakteri sonuçları SPSS 15.00 uygulanarak değerlendirilmiştir. ROC Curve eğrisi çizilerek lökosit ve bakteri taramasında kullanılacak %100 negatif öngörü değeri ve %100 duyarlılıktaki eşik değerler belirlenmiştir. Bulgular: İdrar örneklerinin kültürü sonucunda %9.6’sı etken üreyen, %33.4’sı kontaminasyon, %57’si üremesi olmayan olarak raporlanmıştır. Çalışmamızda %100 negatif öngörü değerine sahip ve eliminasyon oranı en yüksek eşik değer; erkek ve çocuk hastalarda bakteri < 50/µL, lökosit 15/µL, kadın hastalarda bakteri < 50/µL, lökosit 10/µL alınmıştır. Erkek hastalarda örneklerin %63.6’sı, çocuk hastalarda %52.5’i, kadın hastalarda %19’unda kültüre gerek olmadığı saptanmıştır. Sonuç: Akım sitometri sistemi ile kültür öncesi tarama yapılması önemli miktarda örneğin kültür işlemine alınmadan sonuçlandırılmasını sağlamaktadır. Bu yöntemin kültür ekimlerinden önce tarama amaçlı kullanılması gereksiz antibiyotik kullanımının önüne geçerek direnç gelişimini engellemeye yardımcı olacaktır.