SavedAdd your journal

Journals / Kafkas Üniversitesi Veteriner Fakültesi Dergisi / 2018 / Cilt: 24 - Sayı: 3

Mitokondrial DNA Kullanılarak İran’daki Eski Dünya Develerinin (Camelus dromedaries ve Camelus Bactrianus) Genetik Farklılık ve Popülasyon Yapısının Araştırılması

Genetic Diversity and Population Structure of Old World Camelids (Camelus dromedaries and Camelus Bactrianus) in Iran Using Mitochondrial DNA

Nemat HEDAYAT EVRIGH
Reza KHALKHALI EVRIGH
Vahid VAHEDI
Kobra POURASAD
Reza Seyed SHARIFI
Pages
467–471
DOI
—
🏛️Bibliographic metadata and full text access for this article are provided via DergiPark.
DergiPark Record ↗
✨

AI Summary & Key Takeaways

AI Insight
⚡ TL;DR(Too Long; Didn't Read)

Filogenetik analiz develer için farklı topluluklar gösterdi.

📌 3 Key Takeaways

🎯
Objective & Hypothesis:Bu çalışma mitokondrial DNA kullanılarak İran develerinin genetik farklılığını araştırmak amacıyla yapılmıştır.
📊
Key Findings & Data:Dört deve popülasyonundan toplam 120 devede 1052 bp cyt-b segmenti amplifiye edilmiş ve sekans analizi yapılmıştır.
💡
Conclusion & Impact:Filogenetik analiz develer için farklı topluluklar gösterdi.
🔬Design:Research Article
📍Scope:Comprehensive Sample
⚙️Variables:Domain Parameters

Abstract

Bu çalışma mitokondrial DNA kullanılarak İran develerinin genetik farklılığını araştırmak amacıyla yapılmıştır. Dört deve popülasyonundan toplam 120 devede 1052 bp cyt-b segmenti amplifiye edilmiş ve sekans analizi yapılmıştır. Elde edilen sonuçlar, çift hörgüçlü develerde 30 mutasyonun tek hörgüçlü develerde ise 9 mutasyonun olduğunu ve sırasıyla dokuz ve altı mtDNA haplotipinin bulunduğunu göstermiştir. Nükleotid farklılığı, tek ve çift hörgüçlü develer için sırasıyla 0.0015 ve 0.0121 olarak hesaplandı. Çift hörgüçlü deve popülasyonunda yüksek haplotip çeşitliliği (0.886±0.145) gözlemlenirken tek hörgüçlü deve popülasyonunda düşük genetik farklılaşma tespit edildi. Filogenetik analiz develer için farklı topluluklar gösterdi.

Özet

This study was conducted to investigate the genetic diversity of Iranian camels using mitochondrial DNA. A fragment of 1052 bp cyt-b was amplified and sequenced in 120 individuals from four camel populations. The results revealed that there are 30 mutations for Bactrian camels and 9 mutations for dromedaries that lead to nine and six mtDNA haplotypes, respectively. Nucleotide diversity was calculated as 0.0015 and 0.0121 for dromedaries and Bactrian camel populations respectively. We found high haplotype diversity in Bactrian camel populations (0.886±0.145) and low genetic differentiation among dromedary populations. Phylogeny analysis showed different cluster for camelids.

🔖

Cite This Article

EVRIGH, N. H., EVRIGH, R. K., VAHEDI, V., POURASAD, K., SHARIFI, R. S. (2018). Mitokondrial DNA Kullanılarak İran’daki Eski Dünya Develerinin (Camelus dromedaries ve Camelus Bactrianus) Genetik Farklılık ve Popülasyon Yapısının Araştırılması. Kafkas Üniversitesi Veteriner Fakültesi Dergisi, Cilt: 24 - Sayı: 3, 467–471. https://ajindex.com/articles/213302

📄 Full Text PDF Viewer

📄

PDF görüntüleyici hazırlanıyor...

References (7)

  1. Crandall KA, Templeton AR: Empirical tests of some predictions from coalescent theory with applications to intraspecific phylogeny reconstruction. Genetics, 134, 959-969, 1993.
  2. Babar ME, Hussain T, Wajid A, Nawaz A, Nadeem A, Shah SA, Shahid MA, Ahmad N, Javed K, Abdullah M: Mitochondrial cytochrome-b and d-Loop sequence based genetic diversity in Mareecha and Bareela camel breeds of Pakistan. J Anim Plant Sci, 25, 591-594, 2015.
  3. Ming L, Yi L, Sa R, Wang ZX, Wang Z, Ji R: Genetic diversity and phylogeographic structure of Bactrian camels shown by mitochondrial sequence variations. Anim Genet, 48, 217-220, 2016. DOI: 10.1111/ age.12511 Almathen F, Charruau P, Mohandesan E, Mwacharo JM, OrozcoterWengel P, Pitt D, Abdussamad AM, Uerpmann M, Uerpmann HP, De Cupere B, Magee P, Alnaqeeb MA, Salim B, Raziq A, Dessie T, Abdelhadi OM, Banabazi MH, Al-Eknah M, Walzer C, Faye B, Hofreiter M, Peters J, Hanotte O, Burger PA: Ancient and modern DNA reveal dynamics of domestication and cross-continental dispersal of the dromedary. Proc Natl Acad Sci, 113, 6707-6712, 2016. DOI: 10.1073/ pnas.1519508113 Bandelt HJ, Forster P, Röhl A: Median-joining networks for inferring intraspecific phylogenies. Mol Biol Evol, 16, 37-48, 1999. DOI: 10.1093/ oxfordjournals.molbev.a026036 Rozas J, Librado P, Sanchez-Delbarrio J, Messeguer X, Rozas R: DnaSP 5.10. 00. Universitat de Barcelona, Spain 2009. Hall T: BioEdit v. 7.0. 1. Department of Microbiology, North Carolina State University. 2004.
  4. Tamura K, Stecher G, Peterson D, Filipski A, Kumar S: MEGA6: molecular evolutionary genetics analysis version 6.0. Mol Biol Evol, 30, 2725-2729, 2013. DOI: 10.1093/molbev/mst197 Barreta J, Iñiguez V, Sarno R, Gutiérrez-Gil B, Arranz J: Mitochondrial DNA (mtDNA) genetic diversity of Vicugna vicugna mensalis in Bolivia. In, Pérez-Cabal MÁ, Gutiérrez JP, Cervantes I, Alcalde MJ (Eds): Fibre Production in South American camelids and other fibre animals. 123- 130, Wageningen Academic Publishers, Wageningen, 2011.
  5. Goldstein D, Pollock D: Launching microsatellites: A review of mutation processes and methods of phylogenetic interference. J Hered, 88 (5): 335-342, 1997
  6. Sharma R, Kishore A, Mukesh M, Ahlawat S, Maitra A, Pandey AK, Tantia MS: Genetic diversity and relationship of Indian cattle inferred from microsatellite and mitochondrial DNA markers. BMC Genet, 16, 73, 2015. DOI: 10.1186/s12863-015-0221-0
  7. Lenstra J, Groeneveld L, Eding H, Kantanen J, Williams J, Taberlet P, Nicolazzi E, Sölkner J, Simianer