Journals / Flora İnfeksiyon Hastalıkları ve Klinik Mikrobiyoloji Dergisi / 2017 / Cilt: 22 - Sayı: 4

Metagenomik Havabiyomu Çalışmalarına Dair Gelişmeler

Progresses on Metagenomic Airbiome Studies

Pages
139–147
DOI
—
🏛️Bibliographic metadata and full text access for this article are provided via DergiPark.
DergiPark Record ↗
✨

AI Summary & Key Takeaways

AI Insight
⚡ TL;DR(Too Long; Didn't Read)

Atmosferik biyomun ve bioaerosollerin kaynakları, bulunma sıklıkları, kompozisyonu ve etkileri henüz iyi bir şekilde karakterize edilememiştir ancak, sayısal olarak son yıllarda

📌 3 Key Takeaways

🎯
Objective & Hypothesis:Mikrobiyom terimi çeşitli çevrelerde/habitatlarda yaşayan mikrobiyal komünitelerin kollektif genomuna karşılık gelmekte olup, anlaşılması, önemli ölçüde metagenomik çalışmalarla son zamanlarda artmaktadır.
📊
Key Findings & Data:Denizel ve karasal mikrobiyal komünitelerin hakkındaki mevcut bilgi, tipik olarak kolonize edilmeyen havasal çevrelerden daha fazladır ve mevcut yayınların sayısı da oldukça belirgin bir farklılık göstermektedir.
💡
Conclusion & Impact:Atmosferik biyomun ve bioaerosollerin kaynakları, bulunma sıklıkları, kompozisyonu ve etkileri henüz iyi bir şekilde karakterize edilememiştir ancak, sayısal olarak son yıllarda
🔬Design:Research Article
📍Scope:Comprehensive Sample
⚙️Variables:Domain Parameters

Abstract

Mikrobiyom terimi çeşitli çevrelerde/habitatlarda yaşayan mikrobiyal komünitelerin kollektif genomuna karşılık gelmekte olup, anlaşılması, önemli ölçüde metagenomik çalışmalarla son zamanlarda artmaktadır. Denizel ve karasal mikrobiyal komünitelerin hakkındaki mevcut bilgi, tipik olarak kolonize edilmeyen havasal çevrelerden daha fazladır ve mevcut yayınların sayısı da oldukça belirgin bir farklılık göstermektedir. Biyolojik kökenli aerosoller (bioaerosoller) atmosferik partikül maddesi (PM)’nin bir alt bileşeni olup, biyosferden atmosfere doğrudan yayılıp dünya sisteminde özellikle de atmosfer, biyosfer, iklim ve halk sağlığı ile ilişkili olarak hayati bir rol oynamaktadır. Bununla birlikte, bu partiküller infeksiyöz veya infeksiyöz olmayan hastalıkların direkt etmeni de olabilmektedir. İnsanlar tarafından da tekrar yayılan veya iç çevrelerde süspande olan bu partiküller, infeksiyon kontrolü ve güvenlik için de zorluk çıkarmaktadır. Bir insanın oturma pozisyonunda çevresine, saat başı 106 partikül yaydığı tahmin edilmektedir. Atmosferik biyomun ve bioaerosollerin kaynakları, bulunma sıklıkları, kompozisyonu ve etkileri henüz iyi bir şekilde karakterize edilememiştir ancak, sayısal olarak son yıllarda

Özet

The term microbiome refers to the collective genome of the microbial communities living in various environments/habitats, and recently, the understanding of microbiome have been significantly enhanced by metagenomic studies. The data at hand regarding marine and soil-related microbial communities is much more than that of the air, which is typically not colonized, and the number of publica-tions sharp contrasts to those of air. Aerosols of biological origin (bioaerosols) are a subset of atmospheric particulate matter (PM), which are emitted directly from the biosphere into the atmosphere, and play a vital role in the system of theEarth, particularly in the interactions between atmosphere, biosphere, climate and public health. However, these particles could either be the direct cause of epidemics of infectious diseases or noninfectious diseases (e.g. hypersensitivity to aeroallergens). These bioparticles emitted by humans or re-suspended from surfaces in indoor environments are also challenging for infection control and safety. It is estimated that humans emit approximately 106 particles per hour into the surrounding air under seated conditions. The sources, abundance, composition and effects of bioaerosols and the atmospheric microbiome are not yet well characterized; however, there is a continually increasing number of published studies. In this review, current progresses and conducted studies on airborne metagenomics were described and the health effects of aerosols to global perspective were overviewed.

🔖

Cite This Article

ÖZKALE, E. (2017). Metagenomik Havabiyomu Çalışmalarına Dair Gelişmeler. Flora İnfeksiyon Hastalıkları ve Klinik Mikrobiyoloji Dergisi, Cilt: 22 - Sayı: 4, 139–147. https://ajindex.com/articles/196157

📄 Full Text PDF Viewer

📄

PDF görüntüleyici hazırlanıyor...

References (1)

  1. Cha S, Srinivasan S, Jang J-H, Lee D, Lim S, Kim KS, et al. Metagenomic analysis of airborne bacterial community and diversity in Seoul, Korea during December 2014, Asian dust event. PloS One 2017;12:1-12. 44. Edwards RA, Rohwer F. Viral metagenomics. Nat Rev Micro-biol 2005;3:504–10. 43. Blomström AL. Viral metagenomics as an emerging and pow-erful tool in veterinary medicine. Vet Q 2011;31:107–14. 42. Delwart EL. Viral metagenomics. Rev Med Virol 2007;17:115–31. 41. Woong Whon T, Kim MS, Roh SW, Shin NR, Lee HW Bae JW. Metagenomic characterization of airborne viral DNA diversi-ty in the near-surface atmosphere. J Virol 2012;86:8221-31. 40. Mbarache H, Brisebois E, Veillette M, Duchaine C. Bioaero-sol sampling and detection methods based on molecular approaches: no pain no gain. Sci Total Environ 2017;599-600:2095-104. 39. Bowers RM, McCubbin IB, Hallar AG, Fierer N. Seasonal variability in airborne bacterial communities at a high ele-vation site. Atmos Environ 2012;50:41-9. 38. Kawamura Y, Li Y, Liu H, Huang X, Li Z, et al. Bacterial pop-ulaton in Russian space station ‘Mir’. Microbiol Immunol 2001;45:819-28. 37. Lax S, Smith DP, Hampton-Marcell J, Owens SM, Handley KM, et al. Longitudinal analysis of microbial interaction between humans and the indoor environment. Science 2014;345:1048-52. 36. Reinmuth- Selzle K, Kampf C, Lucas K, Pöschl Ü, Lang-Yona N, Fröchlich-Nowoisky J, et al. Air pollution and climate change effects on allergies in the Anthropocene: abun-dance, interaction and modification of allergens and ad-juvants. Environ Sci and Technol 2017 DOI: 10.1021/act. est.6b04908. 35. Koch AM, Nilsen RM, Dalheim A, Cox RJ, Harthug S. Need for more targeted measures - Only less severe hospital-as-sociated infections declined afer introduction of an infection control program. J Infect Public Health 2015;8:282-90. 34. Fröchlich Nowoisky J, Pöschl U. Fungal diversity, biogeog-raphy and new species of ice nucleating fungi in air. AIP Conference Proceedings 2013;1527:595-7. 33. Handelsman J. Metagenomics: application of genom-ics to uncultured microorganisms. Microbiol Mol Biol Rev 2004;68:669–85. 32. Yooseph S, Andrews Pfannkoch C, Tenney A, McQuaid J, Williamson S, Thiagarajan, M, et al. A metagenomic frame-work for the study of airborne microbial communities. PLoS One 2013;8. doi:10.1371/journal.pone. 0081862. 31. Methe BA, Nelson KE, Pop M, Crasy HH, Giglio MG, Hut-tenhower C, et al. A framework for human microbiome re-search. Nature 2012;486:215-21