SavedAdd your journal

Journals / Turkish Journal of Agricultural Engineering Research / 2020 / Volume: 1 Issue: 2

Molecular Identification of Arabis mosaic virus, Grapevine fleck virus and Grapevine Syrah virus-1 in Grapevine Fields in Tokat Province

Tokat İli Bağ Alanlarında Arabis mosaic virus, Grapevine fleck virus ve Grapevine Syrah virus-1 Etmenlerinin Varlığının Moleküler Olarak Belirlenmesi

Vildan Kilinç(TOKAT GAZİOSMANPAŞA ÜNİVERSİTESİ)0000-0002-2581-5957
Şerife Topkaya(TOKAT GAZİOSMANPAŞA ÜNİVERSİTESİ)0000-0002-0095-474X
Pages
—
Publication Date
2020-12-31
DOI
—
🏛️Bibliographic metadata and full text access for this article are provided via DergiPark.
DergiPark Record ↗
✨

AI Summary & Key Takeaways

AI Insight
⚡ TL;DR(Too Long; Didn't Read)

While ArMV was mostly observed in Erbaa district, GFkV was observed only in Tokat center, and GSyV-1 was observed mostly in Pazar district, but not in Center and Erbaa.

📌 3 Key Takeaways

🎯
Objective & Hypothesis:This study was carried out to detect viral factors that cause loss of yield in grapevine produced in Tokat province, where bond cultivation is very important.
📊
Key Findings & Data:The existence of Grapevine fleck virus (GFkV), Grapevine Syrah virus-1 (GSyV-1) and Arabis mosaic virus (ArMV) factors causing yield loss in 196 grapevine samples from Tokat districts were investigated by RT-PCR methods.
💡
Conclusion & Impact:While ArMV was mostly observed in Erbaa district, GFkV was observed only in Tokat center, and GSyV-1 was observed mostly in Pazar district, but not in Center and Erbaa.
🔬Design:Research Article
📍Scope:Comprehensive Sample
⚙️Variables:Arabis mosaic virus · Grapevine fleck virus · Grapevine Syrah virus-1

Abstract

This study was carried out to detect viral factors that cause loss of yield in grapevine produced in Tokat province, where bond cultivation is very important. The existence of Grapevine fleck virus (GFkV), Grapevine Syrah virus-1 (GSyV-1) and Arabis mosaic virus (ArMV) factors causing yield loss in 196 grapevine samples from Tokat districts were investigated by RT-PCR methods. As a result of testing the grapevine samples taken from Tokat province by RT-PCR method, expected levels of DNA amplifications were observed for ArMV (429 bp), GFkV (714 bp), GSyV-1 (611bp). As a result of RT-PCR analyses, ArMV (9.7%), GSyV-1 (6.6%). GFkV (0.5%) were determined respectively. While ArMV was mostly observed in Erbaa district, GFkV was observed only in Tokat center, and GSyV-1 was observed mostly in Pazar district, but not in Center and Erbaa.

Özet

Bu çalışma, bağ yetiştiriciliğinin oldukça önemli olduğu Tokat ilinde üretilen asmalarda verim kaybına neden olan bazı viral etmenleri tespit etmek için yürütülmüştür. Tokat Merkez ve ilçelerinden alınan 196 asma örneği, Grapevine fleck virus (GFkV), Grapevine Syrah virus-1 (GSyV-1) ve Arabis mosaic virus (ArMV) etmenlerinin varlığını tespit etmek için, virüslere spesifik primerlerle RT-PCR yöntemi uygulanmıştır. Yapılan RT-PCR analizleri sonucunda ArMV (429 bp), GFkV (714 bp) ve GSyV-1 (611 bp) için beklenen düzeyde DNA amplifikasyonları gözlenmiştir. RT-PCR sonucunda, sırası ile ArMV (% 9.7), GSyV-1 (%6.6), GFkV (%0.5) etmenleri tespit edilmiştir. ArMV en çok Erbaa ilçesinde gözlemlenirken, GFkV sadece Tokat Merkez’de, GSyV-1 ise en çok Pazar ilçesinde tespit edilmiş ve Merkez ve Erbaa’da tespit edilmemiştir.

🔖

Cite This Article

Kilinç, V., Topkaya, Ş. (2020). Molecular Identification of Arabis mosaic virus, Grapevine fleck virus and Grapevine Syrah virus-1 in Grapevine Fields in Tokat Province. Turkish Journal of Agricultural Engineering Research, Volume: 1 Issue: 2. https://ajindex.com/articles/1555081

📄 Full Text PDF Viewer

📄

PDF görüntüleyici hazırlanıyor...

References (30)

  1. Akbaş B. and Erdiller G. 1993. Researches on grapevine virus diseases and determination of their incidences in Ankara. The Journal of Turkish Phytopathology, 22(2-3): 5564
  2. Akbaş B., 1998. Karaman, Konya ve Nevşehir ili bağ alanlarında görülen virüs hastalıkları. Türkiye VIII. Fitopatoloji Kongresi Bildirileri, 21-25 Eylül 1998, 149-157 s., Ankara.
  3. Akbaş B., Kunter B. and İlhan D. 2007. Occurence and distribution of Grapevine Leafroll Associated Viruses 1,2,3, and 7 in Turkey. J. Phytopathol. 155:122-124
  4. Al Rwahnih M, Daubert S, Golino DA, Rowhani A. 2009. Deep sequencing analysis of rnas from a grapevine showing Syrah Decline symptoms reveals a multiple virus infection that included a novel virus. Virology., 387(2):395-401.
  5. Azeri T. 1983. Ülkemiz bağcılığında virus sorunu ve virüssüz bağ üretim programı. Bornova Zir. Müc. Araş. Enst. Müdürlüğü, Yıllık, 1(1): 61-69.
  6. Azeri T. ve Çiçek Y. 1995. Introdüksiyon ve klon seleksiyonuyla elde edilmiş bazı bağ çeşitleri ve anaçlarındaki virus ve virus benzeri hastalıkların saptanmasına yönelik araştırmalar. VII. Türkiye Fitopatoloji Kongresi, Bildiriler, s.374-377, Adana.
  7. Boscia, D., Elicio, V., Savino, V. & Martelli, G. P. (1995). Production of monoclonal antibodies to grapevine fleck virus. Plant Pathology 44, 160–163.
  8. Boulila, M., Boscia, D., Di Terlizzi, B., Castellano, M. A., Minafra, A., Savino, V. & Martelli, G. P. (1990). Some properties of a phloem-limited non mechanically-transmissible grapevine virus. Journal of Phytopathology 129, 151–158.
  9. Buzkan N., Karadağ S., Öztekin V., Kaya A., Minafra A. and Ben-Dov Y. 2010. First report of the occurence of Grapevine Leafroll Associated Virus-5 in Turkish vineyards. J. Phytopathol. 158: 448-449.
  10. Çağlayan K., Gazel M., Kocabag H.D., 2017. First report of Grapevine syrah virus 1 in grapevine in Turkey. Journal of Plant Pathology, 99 (1), 303.
  11. Çağlayan K. ve Gazel M.H. 1998. Asma virüslerinin saptanmasında F (Ab’) 2 Antibadi fragmentlerinin kullanımı. Türkiye VIII. Fitopatoloji Kongresi, 21-25 Eylül, Ankara. 158-161
  12. Çığşar, İ., 2002. Güneydoğu Anadolu Bölgesi ve Nevşehir İlinde Bağlarda Zararlı Virüs ve Virüs Benzeri Hastalıkların Biyolojik ve Serolojik Yöntemlerle Saptanması ve İki Yeni Nepovirusün Karakterizasyonu.(Doktora Tezi), Ç.Ü. Fen Bilimleri Enstitüsü, Adana
  13. Erdiller G. 1982. Kısaboğum hastalığı etmeni (Grapevine Fan Leaf Virus Hewitt)’nin morfolojik, serolojik özellikleri ve standart ırklarla karşılaştırılması üzerinde araştırmalar. Ankara Üniv. Zir. Fak. Yayınları: 834, pp 58
  14. Gürsoy Y.Z. 1991. Asma Yaprak Kıvrılma Virüsü (Grapevine Leafroll Virus Tip I ve III)’nun bazı üzüm çeşitlerinde ELISA ile saptanması. VI. Türkiye Fitapatoloji Kongresi, 7-11 Ekim 1991, İzmir, 397-400.
  15. Gürsoy Y.Z., Yorgancı Ü. ve Erkan S. 1988. Horozköy ve çevresindeki bağlarda görülen virüs hastalıkları üzerinde ön çalışmalar. III. Bağcılık ve Şarapçılık Sempozyumu, Bildiri Özetleri, 1988, Bursa.
  16. Karadeniz H, Yağcı A, Topkaya Ş, Yanar Y. 2018. Tokat İli ve İlçelerinde Bazı Bağ Virüs Hastalıklarının Serolojik Yöntemlerle Belirlenmesi. Bitki Koruma Bülteni. Cilt 58, Sayı 2, Sayfa 103-110
  17. Kaya A., Erilmez S., 2014. Detection of viruses in Aegean Region grapevines. Journal of Turkish Phytopathology, 43 (1-3), 45-57.
  18. Kepsutlu İ., Özekmekçi E., Özek B. ve Uğur A. 1962. Ege bağcılığında Bulaşık Soysuzlaşma (Kısaboğum) üzerinde çalışmalar. Tarım Bakanlığı Mesleki Kitaplar Serisi, D/35.
  19. Köklü G. 1999. Trakya Bölgesi bağlarında Asma Yaprak Kıvrılma hastalığının karakterizasyonu ve surveyi. Ç.Ü. Fen Bilimleri Enstitüsü, Doktora Tezi, 142s.
  20. Köklü G. and Baloğlu S. 2000. Determination of incidence of Grapevine Leafroll Associated Viruses in some grapevine varieties grown in Thrace Region. The Journalo of Turkish Phytopathology, 29(2-3), 85-94
  21. Martelli G.P., 1987. Virus and virus-like diseases of grapevine in Turkey. A report to the Government of Turkey. Published by FAO: 32, Rome.
  22. Martelli G.P., Boudon-Padieu E., 2006. Directory of infectious diseases of grapevines and viroses and virus-like diseases of the grapevine: bibliographic report 1998-2004, Chiam.
  23. Özaslan M., 2001. Bağlara zarar veren virüs hastalıklarının moleküler tanı ve yöntemleriyle saptanması üzerine araştırmalar. Proje no: (TOGTAK 1557), TÜBİTAK, Gaziantep
  24. Özaslan M., Baloğlu S., Yılmaz M.A., 1991. Kahramanmaraş Bölgesinde lokal olarak yetiştirilen üzüm çeşitlerinde virüs hastalıkları. VI. Türkiye Fitopatoloji Kongresi, Bildiriler, 401-406.
  25. Özaslan M.,Yılmaz M.A., 1994. Virus diseases of grapevine in Southeastern Anatolian Region in Türkiye. 9th. Congress of the Mediterranean Phytopathological Union, Kuşadası-Aydın, Türkiye, 425-427 p.
  26. Özaslan M., Yılmaz M.A., 1995. Adana, Tarsus, Şanlıurfa ve Adıyaman bölgelerinde yetiştirilen bağlara zarar veren virüs hastalıkları. Türkiye VII. Fitopatoloji Kongresi, Adana, 306-312.
  27. Tekinel N., Dolar M. S., Nas Z., Bilgin N., Salih H. ve Salcan Y. 1972. Akdeniz Bölgesi bağlarında Bulaşık Soysuzlaşma (Fanleaf)’nın araştırılması. Bitki Koruma Bülteni, 11: (4) 225-246
  28. TÜİK, 2018. Bitkisel Üretim İstatistikleri. https://www.tuik.gov.tr.
  29. Yılmaz M.A., Yurtmen M.İ., Çığsar İ. and Özaslan M. 1997. A Survey of grapevine viruses in Turkey. 12th Meeting of the ICVG. Extended Abstracts, Lisbon, Portugal, 113.
  30. Azeri T. 1983. Ülkemiz bağcılığında virus sorunu ve virüssüz bağ üretim programı. Bornova Zir. Müc. Araş. Enst. Müdürlüğü, Yıllık, 1(1): 61-69.