Journals / Muğla Sıtkı Koçman Üniversitesi Tıp Dergisi / 2025 / Volume: 12 Issue: 3

In Vitro Antibiotic Susceptibility and Species Distribution of Uropathogenic Agents Isolated from Urine Cultures

İdrar Kültürlerinden İzole Edilen Üropatojen Etkenlerinin Tür Dağılımı ve İn Vitro Antibiyotik Duyarlılıkları

Nurnehir Baltacı Bozkurt(AFYONKARAHİSAR SAĞLIK BİLİMLERİ ÜNİVERSİTESİ)0000-0001-7054-8889
Ali Öztürk(NİĞDE ÖMER HALİSDEMİR ÜNİVERSİTESİ, TIP FAKÜLTESİ)0000-0003-2428-1831
Tuğba Avan Mutlu(AHİ EVRAN ÜNİVERSİTESİ, TIP FAKÜLTESİ)0000-0001-7242-9971
Pages
—
Publication Date
2025-12-29
🏛️Bibliographic metadata and full text access for this article are provided via DergiPark.
DergiPark Record ↗
✨

AI Summary & Key Takeaways

AI Insight
⚡ TL;DR(Too Long; Didn't Read)

Therefore, regional resistance should be taken into account when selecting treatment to improve outcomes and reduce the development of resistance in UTIs.

📌 3 Key Takeaways

🎯
Objective & Hypothesis:Urinary tract infections (UTIs) are among the most common infections in all age groups.
📊
Key Findings & Data:The aim of this study was to evaluate etiologic agents, determine antimicrobial resistance rates, and review empirical treatment recommendations in urinary tract infections in a tertiary care hospital.
💡
Conclusion & Impact:Therefore, regional resistance should be taken into account when selecting treatment to improve outcomes and reduce the development of resistance in UTIs.
🔬Design:Review & Systematic Survey
📍Scope:2018 Verileri
⚙️Variables:Antimicrobial Susceptibility · Bacteriuria · Urinary Tract Infection

Abstract

Urinary tract infections (UTIs) are among the most common infections in all age groups. The aim of this study was to evaluate etiologic agents, determine antimicrobial resistance rates, and review empirical treatment recommendations in urinary tract infections in a tertiary care hospital. Among the urine samples sent to the microbiology laboratory of our hospital from various units between January 2018 and October 2021, those with pyuria and significant bacteriuria in cultures were included in the study. VITEK 2 (BioMérieux, France) was used to identify the species of bacteria, and antibiotic susceptibilities were determined. The results were evaluated according to EUCAST (European Committee on Antimicrobial Susceptibility Testing) standards. The study included 8516 patients. Escherichia coli 66.4% (n=5652), Klebsiella pneumoniae 7.8% (n=662), and Enterococcus spp. (6.5% (n=553) were isolated from urine samples, respectively. The highest antibiotic resistance was observed against E. coli with cefepime (46.7%), ampicillin (44.6%), and piperacillin (39.4%). Other Gram-negative and Gram-positive uropathogenic strains found in the study exhibited generally high susceptibility to the assessed antibiotics. The results of our research indicated that E. coli strains isolated from UTI patients exhibited a lower sensitivity to ampicillin, piperacillin, cefepime, ceftriaxone, ceftazidime, and cefuroxime axetil. Antibiotic resistance rates of UTI agents vary according to regions. Therefore, regional resistance should be taken into account when selecting treatment to improve outcomes and reduce the development of resistance in UTIs.

Özet

İdrar yolu enfeksiyonları (İYE) her yaş grubunda en sık karşılaşılan enfeksiyonlar arasındadır. Bu çalışma ile üçüncü basamak bir hastanede idrar yolu enfeksiyonlarında etiyolojik ajanların değerlendirilmesi, antimikrobiyal direnç oranlarının belirlenmesi, ampirik tedavi önerilerinin gözden geçirilmesi amaçlanmıştır. Ocak 2018-Ekim 2021 tarihleri arasında hastanemiz mikrobiyoloji laboratuvarına çeşitli birimlerden gönderilen idrarlardan pyüri saptanan ve kültürlerinde anlamlı bakteriüri olanlar çalışmaya dahil edilmiştir. VITEK 2 (BioMérieux, Fransa), kullanılarak bakterilerin tür tanımı yapılmıştır ve antibiyotik duyarlılıkları saptanmıştır. Sonuçlar EUCAST (European Committee on Antimicrobial Susceptibility Testing) standartlarına göre değerlendirilmiştir. Çalışmaya 8516 hasta dahil edilmiştir. İdrar örneklerinden en çok sırasıyla örnekten % 66,4 (n=5652) Escherichia coli, % 7,8 (n=662) Klebsiella pneumoniae, ve %6,5 (n=553) Enterococcus spp., izole edilmiştir. En yüksek antibiyotik direnci E. coli’ ye karşı sefepim (%46,7), ampisilin (%%44,6) ve piperasilin (%39,4) antibiyotiklerinde görülmüştür. Çalışmada üropatojen olarak belirlenen diğer Gram negatif ve Gram pozitif türlerin değerlendirilen antibiyotiklere karşı genel olarak yüksek duyarlılık gösterdiği tespit edilmiştir. Araştırmamızın sonucunda, İYE hastalarından izole edilen E. coli suşlarının ampisilin, piperasilin, sefepim, seftriakson, seftazidim ve sefuroksim aksetile karşı daha düşük bir duyarlılık sergilediğini göstermiştir. İYE etkenlerinin antibiyotik direnç oranları bölgelere göre değişmektedir. Bu nedenle, İYE’lerde sonuçları iyileştirmek ve direnç gelişimini azaltmak için tedaviyi seçerken bölgesel direnç dikkate alınmalıdır.

🔖

Cite This Article

Bozkurt, N. B., Öztürk, A., Mutlu, T. A. (2025). In Vitro Antibiotic Susceptibility and Species Distribution of Uropathogenic Agents Isolated from Urine Cultures. Muğla Sıtkı Koçman Üniversitesi Tıp Dergisi, Volume: 12 Issue: 3. https://doi.org/10.47572/muskutd.1694414

📄 Full Text PDF Viewer

📄

PDF görüntüleyici hazırlanıyor...

References (27)

  1. Wagenlehner FME, Bjerklund Johansen TE, Cai T, et al. Epidemiology, definition and treatment of complicated urinary tract infections. Nat Rev Urol. 2020;17(10):586-600.
  2. Karamanlıoğlu D, Aysert-Yıldız P, Kaya M, et al. İdrar kültürlerinden izole edilen enterik bakterilerde genişlemiş spektrumlu β-laktamaz oluşturma sıklığı ve antibiyotik duyarlılıkları. Klimik Derg. 2019;32(3):233-9.
  3. Kömürlüoğlu A, Aykaç K, Özsürekçi Y, et al. Antibiotic Resistance Distribution of Gram-Negative Urinary Tract Infectious Agents: Single Center Experience. Türkiye Çocuk Hast Derg. 2018;12(1):10-7.
  4. Sher EK, Džidić-Krivić A, Sesar A, et al. Current state and novel outlook on prevention and treatment of rising antibiotic resistance in urinary tract infections. Pharmacol Ther. 2024;261:108688.
  5. Bermudez T, Schmitz JE, Boswell M, et al. Novel technologies for the diagnosis of urinary tract infections. J Clin Microbiol. 2025;63(2):e00306-24.
  6. Eroğlu A, Alaşehir EA. Evaluation of treatment applications and antibiotic resistance rates for community acquired urinary tract infections in Turkey and a review of the literature. J Urol Surg. 2020;7(2): 114-119.
  7. Timm MR, Russell SK, Hultgren SJ. Urinary tract infections: pathogenesis, host susceptibility and emerging therapeutics. Nat Rev Microbiol. 2025;23(2):72-86.
  8. Zhu H, Chen Y, Hang Y, et al. Impact of inappropriate empirical antibiotic treatment on clinical outcomes of urinary tract infections caused by Escherichia coli: a retrospective cohort study. J Glob Antimicrob Resist. 2021;26:148-53.
  9. Kalyoncu BN, Koçoğlu E, Özekinci T, et al. İstanbul’da bir şehir hastanesinde izole edilen üriner sistem patojenleri ve antibiyotik direnç profillerinin değerlendirilmesi. ANKEM Dergisi. 2023;37(1):18-27.
  10. Aydın FN, Özdemir M. İdrar Yolu Enfeksiyonlarında Escherichia coli Sıklığı ve Antibiyotik Direnci: Bir Sistematik Derleme. Mev Med Sci. 2024;4(3):143-7.
  11. Çilburunoğlu M, Kirişci Ö, Yerlikaya H, et al. Bir üniversite hastanesine gönderilen idrar kültürlerinde üreyen izolatların dağılımı ve antimikrobiyal duyarlılık profilinin incelenmesi. Sakarya Tıp Dergisi. 2020;10(4):677-83.
  12. Urinary tract infection (lower): antimicrobial prescribing. National Institute for Health and Care Excellence 2018. Erişim tarihi: 02.02.2025 https://www.nice.org.uk/guidance/ng109.
  13. The European Committee on Antimicrobial Susceptibility Testing (EUCAST). EUCAST disk diffusion method. 2021. Erişim tarihi: 26/01/2025, https://www.eucast.org/fileadmin/src/media/PDFs/EUCAST_files/Disk_test_documents/2021_manuals/Manual_v_9.0_EUCAST_Disk_Test_2021.pdf.
  14. Polo JM, Sánchez JLA, Arca-Suárez J, et al. The importance of antimicrobial strategies associated with clinical cure and ıncreased microbiological eradication in patients with complicated urinary tract ınfections and high risk of relapse. Eur Urol Open Sci. 2025;71:165-71.
  15. Global Action Plan on Antimicrobial Resistance. World Health Organization. Erişim tarihi 26.01.2025 https://www.emro.who.int/health-topics/drug-resistance/global-action-plan.html.
  16. Baimakhanova B, Sadanov A, Trenozhnikova L, et al. Understanding the burden and management of urinary tract ınfections in women. Diseases. 2025;13(2).
  17. Öner SZ, Yaprak E, Okur A. Çocuklarda idrar yolu enfeksiyonu tanısında mikroskobik idrar analizi ve tam idrar tetkikinin tanısal performansının karşılaştırılması. Hitit Medical Journal. 2021;3(1):13-8.
  18. Anton C-I, Ștefan I, Zamfir M, et al. Etiology and risk factors of recurrent urinary tract ınfections in women in a multidisciplinary hospital in Romania. Microorganisms. 2025;13(3):626.
  19. Şencan İ, Karabay O, Altay FA, et al. Multidrug resistance in pathogens of community-acquired urinary tract infections in Turkey: a multicentre prospective observational study. Turk. J. Med. Sci. 2023;53(3):780-90.
  20. Çakır A, Acar H. Acil serviste idrar yolu enfeksiyonu için başlanan ampirik antibiyotik ile kültür antibiyogram duyarlılığının karşılaştırılması. Turk J Clin Lab. 2023;14(2):285-93.
  21. Duran H, Çeken N, Atik TK. İdrar kültüründen izole edilen Escherichia coli ve Klebsiella pneumoniae suşlarının antibiyotik direnç oranları: Dört yıllık analiz. ANKEM Dergisi. 2020;34(2):41-7.
  22. Mert D, Çeken S, Ertek M. İdrar yolu enfeksiyonlarında kültürden izole edilen bakteriler ve antibiyotik duyarlılıkları. Turk Hij. ve Deney. Biyol. Derg. 2020;77(1):25-32.
  23. Kılıç FE, Küçükkelepçe O. Evaluating antibiotic resistance in pediatric utıs: five-year data from a tertiary hospital in turkey. medicina. 2025;61(3):402.
  24. Konca C, Tekin M, Uckardes F, et al. Antibacterial resistance patterns of pediatric community-acquired urinary infection: Overview. Pediatr. Int. 2017;59(3):309-15.
  25. Baran C, Küçükcan A. Antimicrobial susceptibility of bacteria isolated from urine cultures in Southern Turkey. Curr. Urol. 2022;16(3).
  26. Yüksek G, Memiş N, Öksüz Ş. İdrar örneklerinden izole edilen Escherichia coli kökenlerinin antibiyotik duyarlılığı. DÜ Sağlık Bil Enst Derg. 2021;11(2):137-42.
  27. Tuna A, Arslan F, Akkuş İ, et al. İdrar kültürlerinden izole edilen Escherichia coli suşlarının klinikte sıkça kullanılan antibiyotiklere karşı direnç oranlarının araştırılması. Kırıkkale Üni Tıp Derg. 2024;26(1):1-4.