Dergiler / Türk Nöroloji Dergisi / 2006 / Cilt: 12 - Sayı: 5
Spinal müsküler atrofi hastalarında SMN geni ekzon 7 ve 8'in moleküler analizi
- Sayfa
- 353–361
- DOI
- —
Özet
Bilimsel zemin:Spinal müsküler atrofi (SMA), 6.000-10.000 canlı doğumda bir görülen, 1/40-60 oranında taşıyıcı frekansına sahip, omuriliğin ön boynuz hücrelerinde dejenerasyona neden olan otozomal. resesif kalıtılan bir hastalıktır. SMA moleküler düzeyde, SMN1 geninin exöh 7 ve 8 veya yalnızca exon 7 homozigot delesyonunun saptanması ile teşhis edilir. Amaç: SMA tanısı alan veya SMA olasılığı taşıyan 108 kişide (53 hasta ve 55 olası hasta) SMN geni ekzon 7 ve 8'in moleküler analizi amaçlanmıştır. Yöntem: PCR-RFLP yöntemi homozigot ekzon 7 ve 8 delesyonlarını belirlemek için kullanılmıştır. PCR -SSCP methodu, hem diğer intragenik mutasyonlar ve özellikle birleşik (compound) heterozigotları hem de RFLP yöntemi ile homozigot delesyon saptanan bazı'SMA hastalarının sonuçlarını konfirme etmek için kullanılmıştır.Sonuçlar: ' RFLP yöntemi ile tüm SMA hastalarının (tiplerine bakılmaksızın) %92.4 (49/53)'ünde SMN1 geni homozigot ekzon 7 ve 8 delesyonu tespit edilmiştir. Tipleri dikkate alındığında ise Tip 1 hastalarının %94,7 (18/19), Tip 2 hastalarının %91.6 (11/12), Tip 3 hastalarının %89.4 (17/19)'ünde homozigot delesyon bulunmuştur. PCR-RFLP yöntemi ile ekzon 7 ve 8'de homozigot delesyonunun olmadığı belirlenen fakat klinik olarak SMA hastası olan 4 olguda ise SSCP yöntemi kullanılmış ve sonuçlar değerlendirildiğinde ise birleşik heterozigot veya intragenik mutasyonlu hasta olabileceği sonucuna varılmıştır.
Abstract
ABSTRACT Molecular Analysis of Exon 7 and 8 of SMN Gene in Spinal Muscular Atrophy Patients Scientific background: The spinal muscular atrophy (SMA) causing degeneration of the anterior horn cells of the spinal cord is the most common autosomal recessive disease, affecting approximately 1 in 6.000- 10.000 live births and having a carrier frequency of approximately 1 in 40-60. SMA is diagnosed with detection of homozygous deletions of SMN1 (exon 7 - 8 or exon 7) gene in molecular level. Objectives: It is aimed to conduct molecular analysis of exon 7 and 8 of SMN gene in a hundred and eight subjects of SMA (53 patients and 55 suspected subjects). Materials and methods: PCR-RFLP method is used for detection of homozygous exon 7 -~8 deletions. PCR-SSCP method was used either to identify for intragenic mutations and especially compound heterozygotes or to confirm some SMA patients homozygous deletions detected by RFLP. Conclusion: In this study, 92.4% (49/53) of SMA patients including all types were found homozygous for exon 7 and 8 deletions with RFLP method. The rate of homozygous deletions determined was 94.7% (18/19) in type I patients, 91.6% (11/12) in typell and 89.4% (17/19) intype III. SSCP method was used only for 4 subjects who are clinically diagnosed as SMA patients but not confirmed with RFLP analysis. The results of SSCP analyses led to decision that patients may be of compound heterozygous or intragenic mutations.