Özbek hastalarda ATFB5 geninin rs2200733 polimorfizmi ile atriyal fibrilasyon arasindaki ilişki

Interrelation between the rs2200733 polymorphism of the ATFB5 gene and atrial fibrillation in Uzbek patients

Guzal Abdullaeva, Alisher Abdullaev, Amayak Kevorkov, Guzal Abduvaliyeva, Nodir Zakirov, Ravshanbek Kurbanov

Özet

Amaç: Atriyal fibrilasyon (AF), en yaygın kardiyak aritmilerden biridir ve morbidite ve mortalitenin önemli bir prediktörüdür. AF, poligenik ve çok nedenli bir hastalıktır. Çeşitli etnik gruplarda, AF gelişimi ile en güçlü ve en bağımsız ilişki, ATFB5 geninin bulunduğu 4q25 lokusu ile bulunmuştur. Literatür verilerinin analizinde, rs2200733 ATFB5 gen polimorfizminin TT genotipinin taşınmasının, AF gelişimi için en uygunsuz genotip olduğu gösterildi. Çalışmanın amacı, Özbek AF hastalarında ATFB5 geninin rs2200733 polimorfizminin genotip ve alellerinin prevalansını belirlemekti. Yöntemler: Çalışmaya paroksismal (n=20) ve persistan AF’si (n=49) olan 69 Özbek hasta dahil edildi. Kontrol grubu (n=30) AF’si olmayan Özbek hastalardan oluşturuldu. ATFB5 geninin rs2200733 polimorfizminin alelik varyantlarının taşınması için genotipleme, Polimeraz Zincir Reaksiyonu-Restriksiyon Parçacık Uzunluk Polimorfizmi (PCR-RFLP) yöntemi kullanılarak gerçekleştirildi. AF hastalarında ve kontrollerde ATFB5 geninin rs2200733 polimorfizminin CC, CT ve TT genotipleri ve C ve T allellerinin dağılımı karşılaştırıldı. Bulgular: AF’li 69 hastanın genotiplendirilmesinden sonra, ATFB5 gen rs2200733 polimorfizminin aşağıdaki dağılımı ortaya çıktı: CC genotipi 35 hastada (%50.72), CT genotipi 25 hastada (%36.23) ve TT genotipi 9 (%13.05) hastada bulundu, p

Abstract

Objective: Atrial fibrillation (AF) is one of the most common cardiac arrhythmias and a major predictor of morbidity and mortality. AF is a polygenic and polyetiological disease. In various ethnic groups, the strongest and most independent relationship with the development of AF was found with the 4q25 locus, where the ATFB5 gene is located. An analysis of the literature data showed that the carriage of the TT genotype of the rs2200733 ATFB5 gene polymorphism is the most unfavorable genotype for the development of AF. The purpose of the study was to identify the prevalence of genotypes and alleles of the rs2200733 polymorphism of the ATFB5 gene in Uzbek patients with AF. Methods: The study included 69 Uzbek patients with paroxysmal (n=20) and persistent AF (n=49). The control group (n=30) was composed of Uzbek patients without AF. Genotyping for the carriage of allelic variants of the rs2200733 polymorphism of the ATFB5 gene was performed using the Polymerase Chain Reaction-Restriction Length Polymorphism (PCR-RFLP) method. The distribution of the C and T alleles and the CC, CT, and TT genotypes of the rs2200733 polymorphism of the ATFB5 gene in patients with AF and controls were compared. Results: After genotyping 69 patients with AF, the following distribution of the ATFB5 gene polymorphism rs2200733 was revealed: the CC genotype was detected in 35 (50.72%) patients, the CT genotype in 25 (36.23%) patients, and the TT genotype in 9 (13.05%) patients (p