Deneysel Çalışmalarda Çevresel Değişikliğe Maruz Kalan Fasciola hepatica'nın Salgıladığı Protein Miktarlarının Bir İleri Proteomik Yaklaşımla İncelenmesi

Investigation of the Abundance of Proteins Secreted by Fasciola hepatica, Which is Exposed to Environmental Change in Experimental Studies, with an Advanced Proteomic Approach

Özet

Amaç: Ana konakçıdan çıkarıldıktan sonra çevresel değişikliğe maruz kalan Fasciola hepatica'nın salgıladığı protein miktarlarını bir ileri proteomik yaklaşımla incelemek.Yöntemler: Son konakçıdan toplanan ergin F. hepatica parazitleri doğrudan fosfat tamponlu su (FTS, oda sıcaklığında) içerisine konuldu ve 37°C'de 2 saat bekletildi (Enstitü'ye 1 saat içerisinde getirildikten sonra). Daha sonra, FTS, bir revize F. hepatica protein veri bankası (Universal Protein Resource; UniProt) ve veri bağımsız edinim yöntemi ile ileri bir proteomik yöntem (yüksek başarımlı sıvı kromatografisine bağlı, elektriksel püskürtme ile iyonlaştırma ve dört kutup zaman bazlı ölçüm içeren kütle spektrometresi sistemi; nanoUPLC-ESI-QTOF-MS) kullanılarak incelendi.Bulgular: Parazitlerle bekletilme sonrası FTS'nin proteomik analizinde, cathepsin L protease 1, fatty acid binding protein 1 ve 2, thioredoxin peroxidase (TPx), ve kunitz type proteinase inhibitor tanımlandı. Fasciola hepatica TPx miktarı, bu çalışmada tanımlanan diğer proteinlerin miktarlarına göre yaklaşık olarak 2-6 kat daha fazla bulundu (p

Abstract

Objective: Investigation of the abundance of proteins secreted by Fasciola hepatica, which is exposed to environmental change after it is removed from the main host, with an advanced proteomic approach.Methods: Adult Fasciola hepatica parasites, obtained from the main host, were directly placed in phosphate-buffered saline (PBS, at room temperature) and incubated at 37°C for 2 hours (after arrival at the Institute within 1 hour). After this, without applying extra procedures, such as washing the parasites, secreted parasite proteins in PBS were investigated using an advanced proteomic method [a mass spectrometry system with electrospray ionization and quadrupole time-of-flight source coupled to ultra performance liquid chromatography, nano UPLC-ESI-QTOF-MS] with a reviewed F. hepatica protein database (Universal Protein Resource; UniProt) and data-independent acquisition method.Results: With the proteomic analysis of the PBS, after incubation with the parasites, cathepsin L protease 1, fatty acid-binding protein 1 and 2, thioredoxin peroxidase (TPx), and kunitz-type proteinase inhibitor were identified. The abundance of Fasciola hepatica TPx was approximately 2-6 times higher than that of the other proteins identified in this study (p