Dergiler / Türkiye Parazitoloji Dergisi / 2020 / Cilt: 44 - Sayı: 1
İnsan Naso-pharyngeal Myiasis’ine Neden Olan Oestrus ovis Larvalarının CO1 Barkod Sekanslarına Göre Moleküler Karakterizasyonu ve Filogenetik Analizi
- Sayfa
- 43–47
- DOI
- —
Özet
Amaç: Bu çalışmada, naso-pharyngeal myiasis ile enfekte bir insandan elde edilmiş bot sineği larvalarının identifikasyonu ve moleküler karakterizasyonu amaçlanmıştır. Yöntemler: Adana bölgesinde naso-pharyngeal myiasis enfeksiyonu olan 49 yaşındaki bir kadından elde edilen sekiz adet bot sineği larvası çalışmanın materyalini oluşturmuştur. Larvaların teşhis anahtarlarına göre morfolojik teşhisleri yapılmıştır. Larva örneklerinin genomik DNA ekstraktlarında barkod CO1 geni amplifiye edilmiştir. CO1 sekanslarında haplotip ve genetik farklılık analizleri yapılmış ve ilişkileri göstermek için filogenetik ağaç oluşturulmuştur. Bulgular: Morfolojik özelliklerine göre tüm bot sineği larvaları O. ovis’in ikinci dönem larvası olarak teşhis edilmiştir. İzolatların CO1 sekansları arasında polimorfizm belirlenmemiş olup bu sonuç O. ovis için yeni bir haplotipin varlığını ortaya çıkarmıştır. Çalışmada yeni karakterize edilen haplotip Bosna-Hersek, Hırvatistan, Brezilya ve İran’dan rapor edilmiş O. ovis haplotipleriyle ortalama %99,5 identiklik göstererek kümelenme göstermiştir. Oestridae alt aileleri arasındaki interspesifik genetik farklılıklar %19,8-%30,8 olarak belirlenmiştir. Sonuç: Bu çalışma Türkiye’de rastlantısal bir insan konakta belirlenen O. ovis larvaları üzerine CO1 barkod sekansları temelinde ilk moleküler karakterizasyon verilerini sağlamıştır.
Abstract
Objective: The identification and molecular characterization of the bot fly larvae from an infected human with naso-pharyngealmyiasis in Turkey were aimed in this study.Methods: A total of 8 bot fly larvae from a 49-year-old woman with naso-pharyngeal infection in Adana province constituted thematerials of this study. Morphological identification was performed on the larvae according to described keys. The barcode regionof the CO1 gene from the genomic DNA extracts of the larvae was amplified and sequence analyses were utilized. Haplotype andgenetic distance analyses were performed in CO1 sequences and a phylogenetic tree was built revealing phylogenetic relationships.Results: All bot fly larvae were identified as second stage larvae of Oestrus ovis in terms of morphologic characteristics. Therewas no polymorphism among the CO1 sequences of all isolates leading to detection of a single novel haplotype. The newlycharacterized haplotype in this study clustered with the O. ovis haplotypes from Bosnia and Herzegovina, Croatia, Brazil, and Iranin a monophyletic clade with an overall identity of 99.5%. Interspecific genetic differences among the subfamilies of Oestridaewere in the range of 19.8% to 30.8%.Conclusion: This study has provided the first molecular characterization data on O. ovis larvae from an accidental human hostin Turkey based on CO1 barcode sequences.