Culiseta longiareolata’daki Sitokrom Oksidaz I ve Internal Transcribed Spacer 2’nin Moleküler Karakterizasyonu

Molecular Characterisation of Cytochrome Oxidase I and Internal Transcribed Spacer 2 Fragments of Culiseta longiareolata

Shadiyeh SOLTANBEİGLU, Mozaffar VAHEDİ, Mulood Mohammadi Bavani, Ali Reza CHAVSİN

Özet

Amaç: Sivrisinekler arasında Culiseta longiareolata, Batı Nil humması da dahil olmak üzere kuş sıtması, tularemi ve arbovirüs enfeksiyonlarının bulaşmasında önemli bir rol oynamaktadır. Bu çalışma, Cs. longiareolata’nın Sitokrom Oksidaz I (COI) ve Internal Transcribed Spacer 2 (ITS2) fragmanlarını karakterize etmek için İran’ın kuzeybatısında yapıldı.Yöntemler:Cs. longiareolata’nın altı popülasyonundaki COI ve ITS2 fragmanları amplifiye edildi, sekans dizimi yapıldı ve analiz edildi. Filogenetik analiz için evrimsel tarih, Tamura-Nei tabanlı maksimum olabilirlik yaklaşımı kullanılarak tahmin edildi. Bulgular: On üç sekans (ITS 2 için 6 ve COI için 7) elde edildi ve Genbank’ta saklandı. Filogenetik analiz, mevcut çalışmadaki Cs. longiareolata’nın COI dizilerinin, dünyanın diğer bölgelerinden gelen aynı türlerle birlikte kümelendiğini gösterdi. Buna ek olarak, çalışmadaki 6 Cs. longiareolata popülasyonunun ITS2 dizileri ve genbank formundan elde edilen diziler, tür içi varyasyonlara rağmen, kabul edilebilirön yükleme değerlerine sahip ayrı bir diziye yerleştirilmiştir. Sonuç:Cs. longiareolata popülasyonları arasında ITS2 ve COI’ya bağlı olarak dikkate değer çeşitlilikte genetik varyasyon bulunmuştur. Bu sonuçlar, Cs. longiareolata’nın farklı popülasyonlarının daha büyük örneklem boyutlarıyla daha geniş ölçekte yapılacak daha ileri çalışmalar için bir başlangıç olabilir. Bu tür çalışmalar yapmak, bu türlerin kesin sınıflandırmasını belirleyebilir.

Abstract

Objective: Among the mosquitoes, Culiseta longiareolata plays a notable role in the transmission of avian malaria, tularemia and arboviral diseases, including West Nile fever. We conducted this study to characterise the cytochrome oxidase I (COI) and internal transcribed spacer 2 (ITS2) fragments of Cs. longiareolata in northwestern Iran to determine the classification status of this species.Methods: The COI and ITS2 fragments from six populations of Cs. longiareolata were amplified, sequenced and analysed. For phylogenetic analysis, the evolutionary history was estimated using the Tamura-Nei-based Maximum Likelihood approach.Results: Thirteen sequences (six for ITS2 and seven for COI) from six populations of Cs. longiareolata were acquired and deposited into the GenBank. Phylogenetic analysis showed that the COI sequences from the current study cluster together with the same species from other parts of the world. Moreover, the ITS2 sequences of the current study and sequences retrieved from the GenBank, despite intraspecies variation, fall into a distinct clade with acceptable bootstrap values.Conclusion: Notable genetic variations were observed between various Cs. longiareolata populations based on the evaluations of ITS2 and COI fragments. By conducting such studies, the exact classification status of this species can be determined.