Eritropoetin'in Nöron Benzeri SH-SY5Y Hücrelerinde İndüklediği Değişikliklerin Proteomik Analizi

Proteomic analysis of erythropoietininduced changes in neuron-like SH-SY5Y cells

Özet

Giriş ve Amaç: Eritropoetin (EPO) çeşitli hastalıklar ile ilişkili aneminin tedavisinde yaygın kullanılmaktadır, ancak yan etkileri nedeniyle klinikteki kullanımı sınırlıdır. Bu nedenle, tedavi rejimlerini düzenlemek ve hematopoetik olmayan EPO derivelerini geliştirmek için EPO'nun moleküler ve hücresel düzeydeki etkilerini anlamak çok önemlidir. Bu çalışmada, proteomik yaklaşımla EPO tedavisinin hücresel proteomları nasıl etkilediğini tanımlamayı amaçladık.Yöntem ve Gereçler: EPO'nun farklı zamanlardaki (24 h ve 48 h) etkisini analiz etmek için sistem model olarak SH-SY5Y nöroblastom hücreleri kullanıldı. EPO tedavisinden sonra değişiklik izlenen 74 protein proteomik analiz ile gösterildi. Proteomik analizden sonra yapılan Reaktom Yolak Analizi ile de etkilenmiş olan hücresel yolaklar tanımlandı.Bulgular: EPO 74 protein türünün düzeyini değiştirmiştir (40'ı artmış, 34'ü azalmış). 24 saatlik EPO inkübasyonu sonunda 35 proteinin düzeyi değişmiş, 48 saatlik EPO inkübasyonu sonunda ise 17 proteinin düzeyi değişmiştir. 22 protein türünün düzeyi ise her iki inkübasyon süresinde de değişmiştir (24 h ve 48 h).Tartışma ve Sonuç: EPO'nun başlıca glukoz metabolizmasındaki, protein ve RNA metabolizmasındaki protein türlerini, hücre iskeleti proteinlerini ve mitokondrial protein türlerini etkilediği gösterilmiştir

Abstract

Objective: Erythropoietin (EPO) is widely used for treatment of anemia associated with different diseases; however, its adverse effects limit its use in clinical practice. Therefore, understanding the effects of EPO at the molecular and cellular level is crucial to adjust treatment regimes, and to develop non-hematopoietic EPO derivatives. In this study, we used a proteomics approach to identify how EPO treatment modifies the cellular proteome.Methods: SH-SY5Y neuroblastoma cells were used as the model system to analyze the effects of EPO treatment at different time points (24 h and 48 h). Proteomic analysis revealed changes in 74 proteins after EPO treatment. Following proteomics analysis, Reactome pathway analysis were carried out to identify the affected cellular pathways.Results: According to results, EPO alters the levels of 74 protein species (40 were increased, 34 were decreased). The levels of 35 proteins were changed by 24 h EPO incubation, whereas 17 protein species were altered by 48 h EPO incubation. Levels of 22 protein species were altered by both of the incubation periods (24 h and 48 h) Conclusion: Overall, our results suggest that EPO mainly affects protein species in glucose metabolism, protein and RNA metabolism, cytoskeletal proteins, and mitochondrial protein species.