Dergiler / Türk Biyokimya Dergisi / 2009 / Cilt: 34 - Sayı: 4
Taxonomic relationships in turkish Verbascum L. group A (Scrophulariaceae): Evidence from SDS-PAGE of seed proteins and a numerical taxonomic study
- Sayfa
- 234–241
- DOI
- —
Özet
Amaç: Verbascum cinsi taksonomik açıdan problemli ve Türkiye’nin en büyük ikinci bitkicinsidir. Bu çalışmanın amacı tohum protein profillerini ve nümerik taksonomik metodlarıkullanarak Türkiye’deki Verbascum Grup A türlerinin taksonomik ilişkilerini aydınlatmayaçalışmaktır. Metod: Tohum protein profilleri kullanılarak UPGMA algoritması altında ve Nei genetikbenzerlik katsayısı kullanılarak kümeleme analizi yapılmıştır. Ayrıca, taksonomik açıdanproblemli olan türler üzerine, örneğin V. brachysepalum, V. orientale, V. f labellifolium, V.trapifolium, V. dudleyanum and V. pyroliforme, onların taksonomik ilişkilerini aydınlatmakiçin nümerik taksonomik bir çalışma uygulanmıştır. Bu sebeple bu türleri temsilen 14 örnek(OTUs) seçilmiş ve onların taksonomik öneme sahip 20 karakteri ölçüldükten sonra MVSPyazılımı kullanılarak kümeleme analizi yapılmıştır.Bulgular: Bu çalışmada, morfolojik, SDS-PAGE ve numerik taksonomik metotlarkullanılarak Grup A’daki bütün Verbascum türleri incelenmiştir. Her bir türün sergilediğitoplam protein bantı sayısının 5-13 arasında olduğu gözlenmiştir. En benzer bant profili18kD-14.4 kD arasındaki bölgede gözlenmiştir. Türler arasındaki genetik uzaklıklar %0-58arasında değişmiştir. Numerik taksonomik çalışmaların sonuçları morfolojik ve SDS-PAGEanalizlerini desteklemiştir. Sonuçlar: Tohum protein profilleri, nümerik taksonomi ve morfolojik karakterlere dayanarakTürkiye’deki Verbascum Grup A türlerinin taksonomisi aydınlatılmıştır. Bu çalışmalar enson yapılan Türkiye’deki Verbascum Cinsi Grup A’nın Revizyonu başlıklı çalışmayladabüyük uyum sağlamıştır. Ayrıca çalışılan tüm türlerin genişletilmiş ve düzeltilmiş morfolojik karakterleri verilmiştir.
Abstract
Objective: The aim of this study is to clarify the taxonomic relationships of Turkish Verbascum species in Group A by means of seed protein profiles and numerical taxonomic study. Methods: Cluster analysis was carried out by UPGMA on the Nei genetic similarity coefficient using seed protein profiles. A numerical taxonomic study has been conducted on taxonomically problematic species such as V. brachysepalum, V. orientale, V. f labellifolium, V. trapifolium, V. dudleyanum and V. pyroliforme in order to elucidate their taxonomic relationships. For this reason, 14 OTUs (Operational Taxonomic Units) were investigated and scoredon the basis of 20 character states by means of using MVSP software.Results: In this study, all Verbascum species in the Group A in Turkey were investigated bymeans of morphological, SDS-PAGE and a numerical taxonomic method. The total number of protein band positions observed for each species between 5 and 13. The most similarband pattern was observed in the region of 18 kD – 14.4 kD. One band around 14 kD observed among all species studied and an 18 kD were found most of the species. Genetic distances among species were ranged between 0% and 58%. The results of the numerical taxonomic study are supported both morphologic and SDS-PAGE analysis.Conclusion: Depending on the seed protein profiles, numerical taksonomy and morphological characters, our results clarified the taxonomy of Turkish Verbascum (Group A) species.The results of the studies were in broad agreement to the arrangement of these species in Revision of the Genus Verbascum L. (Group A) in Turkey. As well as, their expanded and amplified morphological characters were given for the first time.