Polimeraz zincir reaksiyonu ve restriksiyon parça uzunluğu polimorfizmi metodu kullanılarak Türk toplumunda mesane kanserli hastalarda CYP1A1 ve GSTP1 gen polimorfizmlerinin belirlenmesi

Detection of CYP1A1 and GSTP1 gene polymorphisms in bladder cancer patients in a Turkish population using a polymerase chain reaction-restriction fragment length polymorphism method

Ercan YENİ, Fuat DİLMEÇ, Kemal GÜMÜŞ, Adem ALTUNKOL, Murat SAVAŞ, İsmail KARLIDAĞ, Mehmet MAZHAR UTANĞAÇ, Deniz ABAT

Özet

Amaç: Genetik polimorfizmleri anlamak, çevresel karsinojenlerin bir sonucu olarak kanser gelişimine yatkınlığı olan bireyler arasındaki farklılıkların analizini kolaylaştırabilir. Deri, akciğer, kolon ve mesane kanseri, GSTM1, GSTT1 ve GSTP1 gen ekspresyonunda biyolojik defektlerden ortaya çıkmaktadır. Bu çalışmada, Türk popülasyonunda CYP1A1 ile GSTP1 gen polimorfizmleri ve mesane kanseri arasında bir ilişki olup olmadığını araştırmayı amaçladık. Gereç ve yöntemler: Kan örnekleri 60’ı mesane kanserli ve 60’ı sağlıklı bireyler olmak üzere toplam 120 kişiden toplandı ve DNA’ları izole edildi. Mesane kanserli hastalarda GSTP1 NM_000852.3: c.313A >G polimorfizmleri ve CYP1A1 NM_000499.3: c.*1189T > C frekanslarının tespit etmek için polimeraz zincir reaksiyonu- kısıtlama fragmanı uzunluğu polimorfizmi (PCR-RFLP) metodu kullanıldı. Bulgular: Bizim sonuçlarımız CYP1A1: c.*1189 TC genotipi ve C allelinin frekanslarının mesane kanserli hastalarla ve sağlıklı bireyler arasında anlamlı farklılıklar olduğunu göstermiştir (sırasıyla p=0,001 ve p=0,005). Ancak GSTP1: c.313 AG genotipi veya G alleli için hasta ve kontrol grubu arasında anlamlı bir farklılık bulunmamıştır (sırasıyla p=0,699 ve p=0,360). Sonuç: CYP1A1 geninin polimorfik bölgesi mesane kanseri gelişiminde rol oynayabilir. Ancak araştırılan polimorfik GSTP1 bölgesi Türk popülasyonunda mesane kanseri gelişimi için önemli bir risk faktörü oluşturmadı.

Abstract

Objective: Understanding genetic polymorphisms might facilitate the analysis of differences between individualsin their susceptibility to developing cancers as a result of environmental carcinogens. Skin, lung, colonand bladder cancers emerge from biological defects in GSTM1, GSTT1 and GSTP1 gene expressions. In thisstudy, we aimed to investigate whether there was an association between CYP1A1 and GSTP1 gene polymorphismsand bladder cancer in a Turkish population.Material and methods: Blood samples were collected from 120 individuals (60 patients with bladder cancerand 60 healthy individuals), and their DNAs were isolated. A polymerase chain reaction-restriction fragmentlength polymorphism (PCR - RFLP) method was used to detect the frequencies of CYP1A1 NM_000499.3:c.*1189T > C and GSTP1 NM_000852.3: c.313A > G polymorphisms in bladder cancer patients.Results: The frequency of the CYP1A1: c.*1189 TC genotype and C allele were significantly different betweenbladder cancer patients and healthy individuals (p=0.001 and p=0.005, respectively). However, there was nosignificant difference for the GSTP1: c.313 AG genotype or G allele between both study groups (p=0.699 andp=0.360, respectively).Conclusion: A polymorphic site of the CYP1A1 gene might be involved in the development of bladder cancer.However, the investigated GSTP1 polymorphic site did not represent an important risk factor for the developmentof bladder cancer in a Turkish population.