Dergiler / Süleyman Demirel Üniversitesi Fen Bilimleri Enstitüsü Dergisi / 2017 / Cilt: 21 - Sayı: 2
Cyclo(Tyr-Cys) ve Cyclo(Phe-Cys) Dipeptitlerinin Konformasyon Analizi
- Sayfa
- 306–310
- DOI
- —
Özet
Bu çalışmada HT-29 ve MCF-7 hücrelerine karşı servikal kanser hücrelerinde önemli antikanser etki gösteren Cyclo(Tyr-Cys) ve Cyclo(Phe-Cys) dipeptitlerinin olası sekiz kararlı konformasyonu konformasyon analizine bağlı olarak elde edilmiştir. Olası kararlı geometriler φ, Ψ ana zincir ve χ yan zincir dihedral açılarının yardımıyla belirlenmiştir. Mevcut tüm konformerler ve onların enerjileri hesaplanmıştır ve kuantum kimyasal ab-inito sonuçlarla karşılaştırılmıştır. Sistein içeren dipeptitlerin Van der Waals, elektrostatik, torsiyonal, yan ve ana zincirleri arasındaki etkileşme enerjileri ve toplam enerjileri Fortran programı kullanılarak hesaplanmıştır.
Abstract
In this study, eight possible stable conformers of the Cyclo(Tyr-Cys) and Cyclo(Phe-Cys) dipeptides, which show the most significant inhibition in cervical carcinoma cells opposite to HT-29 and MCF-7 cells, performed depending on the obtained conformational analysis. The possible stable geometries were determined with the aid of φ, Ψ backbone and χ chain dihedral angles. Available all conformers and their energies were calculated and made comparison with the quantum chemical abinitio results. The Van der Waals, electrostatic , torsional , interaction energies between side and main chains of aminoacids and total energies of cysteine containing dipeptides were computed by using Fortran program.