PER3 VNTR GENOTİPLERİ, TÜRKİYE POPÜLASYONUNDA MESANE KANSERİ HASTALARINDA GENEL SAĞKALIMI TAHMİN EDEBİLİR

PER3 VNTR GENOTYPES MAY PREDICT OVERALL SURVIVAL IN BLADDER CANCER PATIENTS IN THE TURKISH POPULATION

İbrahim Halil YILDIRIM, Asıf YILDIRIM, Zeynep YEĞİN, Filiz ÖZEN, Yasin ALTINIŞIK

Özet

Sirkadiyen genlerin, çeşitli hücresel süreçleri koordine ederek tümör gelişimi ve ilerlemesinde önemli roller oynadığı kanıtlanmıştır. Her ne kadar hem ekspresyon seviyesi hem de genetik varyant analizi üzerindeki sirkadiyen ritim bozuklukları birçok kanser tipi için artmış riskle ilişkili olsa da, mesane tümörü oluşumunda PER3 VNTR'nin potansiyel etkisi henüz araştırılmamıştır. Bu çalışmada PER3 VNTR'nin mesane karsinomu oluşumuna duyarlılık yaratma açısından etkisini değerlendirmeyi amaçladık. İkinci hedefimiz mesane karsinomu kohortunda PER3 genotipleri ile klinikopatolojik korelasyonlar arasındaki olası ilişkileri aydınlatmak ve böylece mesane karsinomu prognozundaki sonuçları değerlendirmektir. Bu vaka-kontrol çalışmasına 116 hasta ve 120 sağlıklı kontrol dahil edildi. DNA, standart tuzla çöktürme prosedürü kullanılarak periferik kandan izole edildi ve 5-tekrarlı alleli (401 bp) 4-tekrarlı allelden (347 bp) ayırt etmek için PCR tekniği ile PER3 VNTR varyantları (ins/del polimorfizm) belirlendi. Bu araştırmanın sonuçlarının analizi, mesane karsinomunun başlangıcında PER3 VNTR'nin rolünü destekleyen kanıt sağlamamasına rağmen, mesane kanseri hastalarının prognozu için bir risk değerlendirmesi yapmamızı sağladı. Hastaların sağkalım süreleri hasta grubunda PER3 4/4 genotipi (progresyon ve sistektomi pozitif) ve PER3 4/5 genotipi (rekürens, progresyon ve sistektomi pozitif) için azalmıştır. Bu çalışmadan çıkan sonuçlar, potansiyel klinik faydayı genelleştirmek için farklı popülasyonlarda ve etnik kökenlerde, daha büyük örneklerde araştırılması ve doğrulanması gerektiğini belirgin şekilde göstermektedir.

Abstract

Circadian genes were proven to play significant roles in tumor development and progression via coordinating various cellular processes. Though circadian rhythm disturbances both on the level of expression and genetic variant analysis have been associated with increased risk for many cancer types, none has investigated the potential effect of PER3 VNTR in bladder tumorigenesis yet. In this study, we aimed to assess PER3 VNTR’s effect in terms of creating susceptibility to bladder carcinoma formation. Our second target was to enlighten the possible associations between PER3 genotypes and clinicopathological correlations in bladder carcinoma cohort and thus evaluate outcomes in bladder carcinoma prognosis. In this case-control study, 116 patients and 120 healthy controls were recruited. DNA was isolated from peripheral blood using the standard salting-out procedure and PER3 VNTR variants (ins/del polymorphism) were determined with PCR technique to distinguish the 5-repeats allele (401 bp) from the 4-repeats allele (347 bp). Though this exploratory analysis did not provide evidence supporting the role of PER3 VNTR in the onset of bladder carcinoma, it enabled us to make a risk assessment for the prognosis of bladder carcinoma patients. The survival times of patients decreased in the patient group (progression and cystectomy positive) for PER3 4/4 genotype and (recurrence, progression and cystectomy positive) for PER3 4/5 genotype. Results presented in this study are highly recommended to be investigated and validated in larger samples in different populations and ethnicities to generalize potential clinical utility.