Nucleic acid stability in thermophilic prokaryotes: A review

Özet

60°C ve üzerindeki sıcaklıklarda, termofilik prokaryotlar (Archaea ve Eubacteria) farklı stratejiler uygularlar. Kodlayan dizinlerde CG içeriği, purin - purin ve pirimidin - pirimidinlerin nükleotiotid düzenlenmesi, nükleotidlerin metilasyonu, histon / histon benzeri proteinler, ters giraz, katyonlar v.b. stratejiler genoma termal kararlılık sağlarlar. DNA seviyesinde uygulanan stratejiler, doğal olarak, universal olmamasına rağmen, termofillerde RNA ya yansır. Artan purin yüklemesi (özellikle adenin), tercihli kodon kullanımı, post - transkripsiyonel modifikasyonlar termal kararlılığı sağlarlar. Bütün bu faktörler, tek olarak veya bir arada nükleik asitlere termal kararlılık sağlayabileceğinden durumdan duruma farklılık gösterebilirler.

Abstract

In order to survive at temperatures of >60°C, thermophilic prokaryotes (Archaea and Eubacteria) have adopted different strategies. These strategies include high ÇG content in the coding sequences, nucleotide arrangement of purine-purine and pyrimidine-pyrimidine, methylation of nucleotides, histone/histone like proteins, reverse gyrase, cations, etc., also provide thermal stability to genome. Strategies adopted at the level of DNA are naturally, though not universally, reflected in RNA in thermophiles. Increased purine load (particularly of adenine), preferential codon usage, post-transcriptional modifications etc. provide thennal stability. All these factors may differ from taxa to taxa as no single or all the factors together can be universally attributed for providing thermal stability to nucleic acids.