Türkiye’nin Samsun İlindeki Bazı Yabani Baklagil Türlerini Nodüle Eden Mesorhizobium Türlerinin Çeşitliliği

Diversity of Mesorhizobium Species Nodulating Some Wild Legumes in Samsun Province of Turkey

Özet

Bu çalışmada Türkiye’nin Samsun ilinden toplanan iki yabani Baklagil türünün (Argyrolobium biebersteinii (Ball in Feddes) and Lotus angustissimus L.,) mikrosimbiyontları geleneksel ve moleküler yöntemler kullanılarak incelenmiştir. Toplamda orijinal konakçıları üzerinde aktif kök nodülleri oluşturan beş adet rizobiyal izolat incelenmiştir. Bu izolatların teşhisleri 16S rDNA ve recA olmak üzere iki genin filogenetik analizleri ile yapılmıştır. Filogenetik analizler sonucunda tüm izolatlar Mesorhizobium soy hattı içerisinde yer almıştır. Bu izolatlardan OKN-1 ve OKN-4 Mesorhizobium tarimense ve OKN-3 M. japonicum olarak teşhis edilmişlerdir. Diğer taraftan diğer iki izolatımız OKN-7 ve OKN-10, bilinen hiçbir Mesorhizobium türü ile eşleşmemiştir. Sonuç olarak bu çalışmada Türkiye’den Mesorhizobium cinsine ait ilk moleküler olarak tanımlanmış örnekleri sunmaktayız. Ayrıca M. tarimense ve M. japonicum türleri için Türkiye’den ve Avrupa’dan ilk kayıtları da vermekteyiz. Ek olarak bu çalışmadaki yeni M. tarimense ve M. japonicum izolatları, bu iki türün orijinal konaklarından ve lokalitelerinden tanımlanmasından sonra bildirilen ilk izolatlardır. Bu çalışmada iki yeni Mesorhizobium türü için de moleküler kanıtlar sunuyoruz, fakat bu ön görünün daha fazla araştırılması gerekmektedir.

Abstract

In this study, microsymbionts of two wild legumes, Argyrolobium biebersteinii (Ball in Feddes) and Lotus angustissimus L.,collected from Samsun province of Turkey were investigated using conventional and molecular methods. A total of five rhizobial isolates whichproduced active root nodules on their original hosts were considered. Identifications of the isolates were depending on the phylogenetic analysesof two housekeeping genes, 16S rDNA and recA. As a result of phylogenetic analyses, all isolates appeared within Mesorhizobium lineage. Ofthese isolates, OKN-1 and OKN-4 identified as Mesorhizobium tarimense and OKN-3 identified as M. japonicum. On the other hand, other twoisolates, OKN-7 and OKN-10 did not match up with any known Mesorhizobium species. In this study we present the first Mesorhizobiumisolates identified using valid molecular methods from Turkey. We also give the first reports of M. tarimense and M. japonicum from Turkeyand Europe. Additionally, the new M. tarimense and M. japonicum isolates in this study are the first isolates reported after the description ofthese two species from their original hosts and locations. In this study we also present molecular evidences for two new Mesorhizobium species,but this presumption needs further investigations.