Mycobacterium tuberculosis complex' in adlandırılmasında DNA--prob ( AccuProbe ) hibridizasyon yöntemi ile alışılagelmiş biyokimyasal yöntemlerin başarılarının karşılaştırılması

Nucleic acid probes versus conventional biochemical testing for identification of Mycobacterium tuberculosis complex

Özet

Bu çalışma Mycobacterium tuberculosis complex adlandırılmasında kullanılan biyokimyasal yöntemlerden niyasin birikme ve nitrat indirgenme testleri ile akridinyum ester işaretli DNA problarının (AccuProbe, Gen-Probe, SanDiego, Calif.) rutin laboratuvar kullanımlarını değerlendirmek için planlanmıştır. Ege Üniversitesi Tıp Fakültesi Mikrobiyoloji ve Klinik Mikrobiyoloji Anabilim Dalı Mikobakteriyoloji Laboratuvarı'nda klinik örneklerden izole edilen 162 mikobakteri kökeni çalışmaya alındı. Kökenler üretici firmanın önerdiği şekilde uygulanan DNA hibridizasyon testi ile CDC Level III klavuzunda önerildiği şekilde yapılan niyasin birikim, nitrat indirgenme ve diğer biyokimyasal testlerle test edilerek adlandırıldı. Kökenlerin 148 tanesinin M. tuberculosis (Mycobacterium tuberculosis complex) ve 14 tanesinin M. tuberculosis complex dışı mikobakteri olduğu saptandı. Mycobacterium tuberculosis kökenleri arasında niyasin birikim testi kökenlerin % 95.3'ünde, nitrat indirgenme testi % 91.2'sinde, DNA hibridizasyon testi ise tümünde (%100) olumlu olarak bulundu. DNA hibridizasyon testi M. tuberculosis kökenlerinin adlandırılmasında biyokimyasal testlerin yerini alabilecek, rutin laboratuvarlarda kullanılabilme özelliğine sahip, hızlı, standart, güvenilir ve kolay uygulanabilir bir yöntem olarak değerlendirilmiştir.

Abstract

In this study, several methods (niacin accumulation, nitrate reduction and DNA-Probe hybridization (AccuProbe, Gen-Probe, SanDiego, Calif.) for identification of Mycobacterium tuberculosis (M. tuberculosis complex) in clinical mycobacteriology laboratory were evaluated. A total of 162 mycobacteria isolated from clinical specimens were included in the study. Further identification of these mycobacteria yielded 148 of M. tuberculosis complex and 14 of mycobacteria other than tuberculosis. AccuProbe was performed according to manufacturer's instructions and the biochemical tests were applied according to Reference 9. The sensitivity of niacin accumulation test, nitrate reduction, and AccuProbe testing for identification of M. tuberculosis complex was 95.3%, 91.2%, and 100%, respectively. As a result, the AccuProbe test is determined to be a rapid, standard, and reliable method which can be replace biochemical testing of identification of M. tuberculosis complex in routine laboratory.