Örtüaltında yetiştirilen marulda sclerotınıa sclerotıorum populasyonunda genetik çeşitliliğin mikrosatelit markörler ile belirlenmesi

Determination of gen etic variation in the population of sclerotinia sclerotiorum in greenhouse grown lettuce by microsatellite markers

Özet

Sclerotinia sclerotiorum sebze yetiştiriciliğinde en yıkıcı patojenlerden biridir.Çanakkalede marul Kasımdan Mart ayına kadar örtü altında yetiştirilmekte, bu dönemlerdışındaki zamanlarda ise hıyar tarımı yapılmaktadır. Her iki bitki türü de hastalık etmenindenetkilenmekte ve yıl boyunca hastalık simptomlarını görmek mümkün olmaktadır. Bu çalışmanınamacı örtüaltında yetiştiriciliği yapılan marul seralarında, S. sclerotiorum un hastalıksimptomlarını gösteren bitkilerden etmeni izole etmek ve izolatlar arasında genetik çeşitliliği PCRyoluyla saptamaktır. Bu çalışmada 18 patojen izolatı, bu izolatlar arasında farklılığı saptamak içinise 8 mikrosatelit primeri kullanılmıştır. (TACA) 10 primeri kullanıldığında tüm izolatlardan aynıbüyüklükte PCR ürünü elde edilmiştir. (GT) 8 primeri kullanıldığında popülasyonda 2 farklıbüyüklükte, (GA)9 , (TATG) 9, ve (GT)10 locuslarında ise 3 farklı büyüklükte allel saptanmıştır.(CATA)25 ve (TTA)9 primerleri kullaınldığında 5er allel saptanırken, (AGAT) 14(AAGC) 4locusunda toplam 6 polimorfik banda rastlanmıştır. Marul populasyonunda yapılan bu çalışmada,izolatlar arasında yüksek oranda polimorfizm olduğu saptanmıştır.

Abstract

Sclerotinia sclerotiorum is one of the most destructive pathogens of vegetable crops. inÇanakkale, lettuce is cultivated under greenhouses between November until end of March.Afterwards, lettuce is replaced with cucumber. Both are important hosts of the pathogen andinfected plants can be found throughout the year. Here, we tested if polymorphism exists in theis olates collected from the greenhouses. Eighteen isolates were employed in the research. Eightmicrosatellite primer sets were used for this purpose. One of them ((TACA) 10) did not showpolymorphism among the isolates. We found 2 alleles at (GT) 8, 3 alleles at (GA) 9, (TATG)9 , and(GT)10 loci. Five loci were observed at (CATA) 25 and (TTA) 9 alleles. The most obviouspolymorphism existed at (AGAT) 14(AAGC) 4 loci revealing 6 alleles. A high level ofpolymorphism was found in lettuce populations originating from different locations but also withinpopulations from the same greenhouse.