Trabzon Hurması (Diospyros kaki L.) ve Artvin Hurması (Diospyros lotus L.) Çöğür Populasyonlarının Genom Hacmi Farklılıklarının Hücre Akış Sitometrisi ile Karşılaştırılması

Comparison of Genome Sizes of Persimmon (Diospyros kaki L.) and Caucasian Persimmon (Diospyros lotus L.) Seedling Populations by Using Flow Cytometry

Özet

Hücre Akış Sitometrisi (Flow Cytometry) hücre döngüsünün izlenmesi, ploidi seviyesinin belirlenmesi, genom hacminin ortaya çıkarılması ve ıslah çalışmalarında erken seleksiyon yapılmasına imkân tanıyan gelişmiş bir tekniktir. Trabzon hurması çeşitlerinin çoğaltılmasında genel olarak Diospyros lotus (Artvin hurması) türünden elde edilen çöğür anaçları kullanılmaktadır. Ayrıca, Diospyros kaki türüne ait bazı çeşitlerin de tohumları değişik fidanlıklarda kullanılmaktadır. Bu çalışmada, D. kaki ve D. lotus türlerine ait çöğür populasyonlarında bulunan bitkilerin taze yaprak dokularından elde edilen hücre çekirdekleri propidyum iyodür (DAPI) ile boyanmış ve hücre akış sitometrisi tekniği ile floresant yoğunlukları ölçülmüştür. D. lotus türü D. kaki bitkilerinden daha küçük genom hacmine sahip olmuş ayrıca tür içi varyasyon D. lotus bitkilerinde daha düşük seviyede gerçekleşmiştir. D. kaki bitkilerinde yüksek seviyede varyasyon izlenmiştir. Özellikle buruk olmayan çeşitler (PCNA ve PVNA grubu çeşitler) için anaç olarak kullanılması gereken D. kaki türünde birörnek çöğür oluşturan genotiplere ihtiyaç bulunduğu vurgulanmıştır.

Abstract

Flow cytometry is an improved technique for following cell cycle, determination of ploidy levels, calculationof genome sizes and early selection of candidates in plant breeding studies. Persimmon is generally propagated by usingDiospyros lotus seedlings in Turkey. Moreover some persimmon varieties can be used for propagation as rootstock seedsources. In this study, fresh leaf tissues of Diospyros kaki and Diospyros lotus seedlings were used for obtaining of cellnuclei then stained by propidium iodide and were used for estimation of floresence intensities. According to the obtainedresults caucasian persimmon seedlings were had smaller genome sizes compare to the persimmon genomes and had lessvariation than persimmons. The relative ploidy level of caucasian persimmon seedlings were diploid where as hexploidsin persimmon seedlings. By this experiment it was emphasized that new genotypes which have uniform rootstockcharateristics for PCNA (Pollination Constant Non Astringent) and PVNA (Pollination Variant Non Astringent)persimmon varieties are needed for better performance in persimmon growing.