Gen tanımı (Gen ekspresyon) analizlerinde mikrodizi tekniği

Özet

DNA mikrodizi, binlerce genin ekspresyonunu eş zamanlı olarak ölçebilen bir teknolojidir. Mikrodiziler hücreden veya dokudan RNA izolasyonu, tümleyici nükleotidler (cDNA) kullanılarak hedef üretimi, işaretlenen hedefin cam/naylon matrikse (dizi) sabitlenen gene özel problarla hibridizasyonuyla oluşturulmaktadırlar. Gen tanımı farklılıkları kontrolle karşılaştırılarak gen analiz yazılımlarıyla analiz edilmektedir. Mikrodizi teknolojisinin, DNA baz dizisi analizi, mutasyon ve polimorfizm saptama, ilaç hedefleri tanımlama, gen tanımı profillerinin oluşturulması, normal ve patolojik durumlarda gen ekspresyon farklılıklarının incelenmesi gibi çok geniş uygulama alanı bulunmaktadır.

Abstract

DNA microarray is a technology that can measure the expressions of thousands of genes simultaneously. Microarray is applied with isolation mRNA from the cell or tissue, creation of complementary nucleotide (cDNA) target and hybridization of the labeled target to gene spesific probe affixed to glass or nylon matrix (array). In order to analyze the existing variations, special gene analysis software is used to determine changes in expression relative to a control. Microarray technology is used for a wide scope of applications, including sequencing, detection of mutations or polimorphisms, identification of drug targets, gene expression profiling, gene expression patterns normal versus pathological conditions.