Koyun ve sığır abortlarında ihmal edilen enfeksiyöz ajanların moleküler tanısı: bir bakışta Coxiella burnetii, Francisella tularensis ve Chlamydophila abortus prevalansları

Molecular diagnosis of neglected infectious agents of heep and attle abortions: the prevalences of Coxiella burnetii, Francisella tularensis and Chlamydophila abortus at a glance

Özet

Brucella spp., Salmonella spp., Campylobacter spp., Listeria spp. gibi bakteriyel atık etkenleri sığır ve koyun yetiştiriciliğinde önemli ekonomik kayıplara yol açan infeksiyonlar oluşturmaktadır. Bu etkenler in vitro laboratuvar koşullarında kolaylıkla kültüre edilebilmektedirler. Coxiella burnetii (C. burnetii), Chlamydophila abortus (C. abortus), Francisella tularensis (F. tularensis) gibi intrasellüler etkenlerden kaynaklanan atık olguları ise daha az sıklıktadır. Kültürel analizleri için çoğunun hücre kültürüne ihtiyaç duymaları ve güvenli çalışma için biyogüvenlik seviyesi-3 laboratuar gereksinimleri nedeniyle bu etkenlerin teşhisi genellikle PCR ile yapılmaktadır. Bu çalışmada, Türkiye’nin farklı bölgelerinden toplanan, atık yapmış sığır ve koyun örneklerinden, teşhiste göz ardı edilen, C. burnetii, C. abortus ve F. tularensis etkenlerinin moleküler prevalanslarının belirlenmesi amaçlandı. Toplam 395 klinik materyal, etken spesifik ticari Real-Time PCR ile analiz edildi. Çalışma sonucunda, atık olgularında F. tularensis, C. burnetii ve C. abortus moleküler prevalansları sırasıyla %14, %2,9 ve %2,28 olarak belirlenirken, sığır klinik örneklerinden F. tularensis ve koyun klinik örneklerinden C. burnetii etken varlığına rastlanılmadı. Bu, F. tularensis'in Türkiye'de abort materyalinde etken olarak bulunduğuna dair ilk rapordur. Yaygınlık açısından farklılık gösterse de rutin teşhiste göz ardı edilen bu etkenlerin bulaş riski oluşturabilecek şekilde atık materyalleri ile özellikle de vajinal ekstretleri ile saçılabilecekleri belirlenmiştir.

Abstract

Bacterial abortive agents such as Brucella spp., Salmonella spp., Campylobacter spp., Listeria spp. cause serious infections that lead to significant economic losses in cattle and sheep breeding. These bacteria can be easily cultured under in vitro laboratory conditions. Abortions caused by intracellular bacteria such as Coxiella burnetii (C. burnetii), Chlamydophila abortus (C. abortus) and Francisella tularensis (F. tularensis) are less prevalent in abortive cases and the diagnosis of these bacteria, many of which need to cell culture for cultivation and biosafety level-3 laboratory facilities for safe working, can be made by PCR. In this study, it was aimed to determine the molecular prevalence of C. burnetii, C. abortus and F. tularensis agents, which were neglected during the diagnosis of abortions, in cattle and sheep collected from different regions of Türkiye. A total of 395 clinical materials were analyzed via agent-specific commercial Real-Time PCR. As a result, the molecular prevalence of F. tularensis, C. burnetii and C. abortus was determined as 14%, 2.9% and 2.28%, respectively. F. tularensis in cattle clinical samples and C. burnetii in sheep clinical samples were not found. This is the first report that F. tularensis was found as an agent in an abortive material in Türkiye. Although it differs in terms of prevalence, it has been determined that these microorganisms, which are neglected in routine diagnosis, can be spread with aborted materials, especially vaginal discharge, which may pose a risk of transmission.