Dergiler / Ankara Üniversitesi Tıp Fakültesi Mecmuası / 2009 / Cilt: 62 - Sayı: 2
Çeşitli klinik enfeksiyonlardan elde edilen Staphylococcus aureus izolatlarında insersiyon sekansı IS256’nın biofilm oluşumu üzerine etkisi
- Sayfa
- 53–57
- DOI
- —
Özet
Ica (intersellüler adezyon) operonunu kodlayan enzimler tarafından polisakkarit intersellüler adezin (PIA) üretimi, stafilokoklardaki biofilm gelişiminin şu ana kadar en iyi anlaşılmış mekanizmasıdır. IS256, ica operonuna geri dönüşümlü olarak eklenmek suretiyle ica operonu ekspresyonunu ve sonrasında da biyofilm oluşumunu etkileme kapasitesine sahip mobil bir elemandır. Bu çalışmanın amacı 1998-2004 yılları arasında çeşitli klinik örneklerden elde edilen 207 Staphylococcus aureus izolatında insersiyon sekansı IS256’nın biofilm oluşumu üzerine etkisini araştırmaktır. 1998-2004 yılları arasında Ankara ve Hacettepe Üniversitelerinde yatan hastalara ait çeşitli klinik örneklerden elde edilen 207 S. aureus izolatı (kan, kateter, solunum yolu örnekleri, steril vucut sıvıları, yara, balgam, idrar, püy) çalışmaya dahil edildi. Çalışılan suşların 28’i (%13.5) metisilin duyarlı (MSSA),133’ü (%64.2) metisilin dirençli (MRSA), 46’sı (%22.2) ise hetero-VISA (vankomisine heterojen olarak orta duyarlı S. aureus) suşlarını içeren izolatlar idi. Stafilokok kültürlerinden genomik DNA ekstrakte edildikten sonra amplifikasyon kalıbı olarak kullanıldı. Biyofilm genleri (icaA, icaD) ve IS256 yı saptamak amacıyla simpleks PCR lar yapıldı. 207 suş içinde icaA pozitifliği %89.4 (185 izolat), icaD pozitifliği %97.1 (201 izolat), biofilm genlerinin her ikisinin de pozitifliği: %88.9 (184 izolat), sadece birinin pozitifliği %8.7 (18 izolat) oranında bulundu.Biyofilm genleri (ica) MRSA ve hVISA izolatlarında, MSSA izolatlarına göre daha yüksek oranda saptandı(p< 0.001). IS256 pozitifliği hVISA suşlarında MRSA’dan, MRSA suşlarında ise MSSA’dan daha yüksek oranda tesbit edildi (p
Abstract
Biofilms consist of a cell-multilayer embedded in a slime matrix and they are the basis for production of polysaccharide adhesion by ica-operon-encoded enzymes is currently the best understood mechanism of biofilm development in staphylococci. The insertion sequence IS256, a mobile element frequently associated to transposons has the capacity to influence expression of the ica operon and subsequent biofilm formation by reversible insertion into the ica operon. We aimed to elucidate the role of insertion sequence IS256 in biofilm formation among various Staphylococcus aureus isolates from clinical specimens of hospitalized patients at Ankara and Hacettepe Universities. A total of 207 S. aureus strains isolated between 1998 and 2004 from clinical specimens were included in the study. A total of 28 of the S. aureus isolates studied were methicillin-susceptible S. aureus (MSSA), 133 were methicillin-resistant S. aureus (MRSA), and 46 were vancomycin-intermediate S. aureus (hetero-VISA) isolates. Genomic DNA was extracted from staphylococcal cultures and used as an amplification template with the primers in simplex PCRs for detection of biofilm genes (icaA, icaD), IS256. Of all S. aureus isolates studied 185 (89.4%) were positive for icaA, 201 (97.1%) were positive for icaD, 184 (88.9%) were positive for both whereas 18 (8.7%) strains were positive for only one of them. We found the positivity rates of biofilm genes (ica genes) among MRSA and hetero-VISA isolates were significantly higher than those among MSSA isolates (p< 0.001). IS256 positivity among MRSA and hetero-VISA isolates were also significantly higher than those among MSSA isolates (p