Dergiler / Anadolu Üniversitesi Bilim ve Teknoloji Dergisi :C-Yaşam Bilimleri ve Biyoteknoloji / 2017 / Cilt: 6 - Sayı: 1

DETECTION OF CRYPTOSPORIDIUMOOCYSTS BY LOOP MEDIATED ISOTHERMAL AMPLIFICATION (LAMP) IN SURFACE WATER FROM RIVER YEŞİLIRMAK AND STREAM TERSAKAN (SAMSUN-AMASYA)

YEŞİLIRMAK NEHRİ VE TERSAKAN ÇAYI'NDAN (SAMSUN-AMASYA) ALINAN YÜZEYSEL SU ÖRNEKLERİNDE CRYPTOSPORİDİUMOOKİSTLERİNİNİLMİĞE DAYALI İZOTERMAL AMPLİFİKASYON (LAMP)YÖNTEMİYLE ARAŞTIRILMASI

Sayfa
31–37
DOI
—

Özet

Amasya ve Samsun illerinde, Tersakan Çayı'nın geçtiği Havza, Suluova-Çeltek, Kanlıdere, Boğazköy, Karasu, Tersakan-son olarak adlandırılan altı istasyondan ve Yeşilırmak Nehri'nin geçtiği Amasya Köprüsü, Yassıçal, Durucasu, Taşova, Kumköy, Çarsamba girişi, Çarsamba Köprüsü, Hacıömer olarak adlandırılan sekiz istasyondan alınan su örneklerinde Cryptosporidium ookistleri İlmiğe Dayalı İzotermal Amplifikasyon (LAMP) yöntemi kullanılarak araştırılmıştır. 2010 Aralık-2011 Kasım döneminde 14 istasyondan her ay düzenli su örnekleri alınarak bu örneklere LAMP testi uygulanmıştır. On dört istasyonun 10'unda Cryptosporidium ookistlerine LAMP yöntemiyle rastlanılmıştır. Cryptosporidium ookistleriyle kontamine olmuş istasyonlar: Tersakan-Havza; Tersakan-Suluova, Çeltek; Tersakan-Kanlıdere; Tersakan-Boğazköy; Tersakan-Karasu; Tersakan-son; Yeşilırmak-Amasya Köprüsü; Yeşilırmak-Yassıçal; Yeşilırmak-Durucasu; Yeşilırmak-Taşova'dır. Araştırılan tüm istasyonların içinde Tersakan-Suluova, Celtek ve Tersakan-Boğazköy istasyonları Cryptosporidium ookistleri açısından en kirli istasyonlar olarak belirlenmiştir. Bununla beraber Amasya ve Samsun'dan geçen Yeşilırmak Nehri'nin Tersakan Çayı'na oranla daha temiz olduğu saptanmıştır. Tersakan Çayı'ndaki Cryptosporidium kontaminasyonun fazlalığı, hayvan besiciliğinin Havza and Suluova ilçelerinde yerleşim yerlerine çok yakın mesafelerde yapılmasına; evsel ve tarımsal atık suların hiçbir işleme tabi tutulmadan direk olarak Tersakan Çayı'na deşarj edilmesine bağlanmaktadır

Abstract

The water samples collected from six stations of Stream Tersakan which include Havza; Suluova-Celtek, Kanlıdere, Bogazkoy, Karasu, Tersakan-Last and eight stations of River Yesilirmak which include Amasya Bridge, Yassıcal, Durucasu, Tasova, Kumkoy, Carsamba entrance, Carsamba Bridge, Hacıomer in Amasya and Samsun Provinces were investigated for detection of Cryptosporidium oocystsby Loop Mediated Isothermal Amplification (LAMP).The water samples were regularly collected in every month from the 14 stations in investigated area between 2010 December to 2011 November for LAMP tests.Ten of 14 investigated stations were found contaminated with Cryptosporidium oocyst by LAMP. The pollution with Cryptosporidium oocysts were determined in stations which are Tersakan-Havza; Tersakan-Suluova, Celtek; Tersakan-Kanlıdere; Tersakan-Bogazkoy; Tersakan-Karasu Tersakan-Last, Yesilirmak-Amasya Bridge, Yesilirmak-Yassıcal, Yesilirmak-Durucasu, Yesilirmak-Tasova. The high contamination rate of Cryptosporidiumoocysts were found in Tersakan-Suluova, Celtek and Tersakan-Bogazkoy stations inthe all investigated stations. However, River Yesilirmak which is last in Samsun more clean than Stream Tersakan which is last in Amasya in terms of the Cryptosporidium oocysts contamination. The reason in excess of the rate of Cryptosporidiumcontamination in Stream Tersakan are more animal husbandry in Havza and Suluova Boroughs and no processing domestic and agricultural waste water mixing to surface water