Dergiler / Afyon Kocatepe Üniversitesi Fen ve Mühendislik Bilimleri Dergisi / 2018 / Cilt: 18 - Sayı: 3

Tiyadiazol Halkası İçeren‘‘5-(2-Kloro-6-Florobenziltiyo)-1,3,4-Tiyadiazol- 2-Amin’’ TekKristalinin Moleküler YapısınınDeneysel ve Teorik Yöntemlerle İncelenmesi

Investigation of The Crystal and Molecular Structure Of ‘‘5-(2-Chloro-6- Fluorobenzylthio)-1,3,4-Thiadiazol-2-Amine’’ Single Crystal Containing ThiadiazolRingby Experimental and Theoretical Methods

Sayfa
1158–1166
DOI
—

Özet

Bu çalışmada, tiyadiazol halka içeren5-(2-kloro-6-florobenziltiyo)-1,3,4-tiyadiazol-2-amin tek kristalisentezlenmiştir. Sentezlenen kristalin yapısı, 1 H-NMR, 13 C-NMR ve X-ışını analiz teknikleri ileaydınlatılmıştır. Deneysel sonuçlara destek olması amacıyla da teorik hesaplamalar yapılmıştır. Bununiçinde bileşiğin geometrik parametreleri gaussian 09paket programı kullanılarak, yoğunluk fonksiyonelteorisi (DFT) B3LYP/6-31G(d) metodu ile optimize edildi ve yapısal parametreleri (bağ açıları, bağuzunlukları ve dihedral açıları), 1 H- ve 13 C-NMR spektrumları vesınır moleküler orbitalleri (HOMO-LUMO)teorik olarak hesaplanmıştır. Son olarak, sentezlenen tek kristalin inhibitör aktivite çalışması için, 2WQYreseptör hedef yapısını inhibe etmek amacıyla moleküler doking simülasyonu yapılmıştır.

Abstract

In this work, a single crystal of 5-(2-chloro-6-fluorobenzylthio)-1,3,4-thiadiazol-2-aminecontaining thiadiazole ring was synthesized. The structure of the synthesized crystal was confirmed by 1 H-NMR, 13 C-NMR and X-ray analysis techniques. Theoretical calculations have been made in order to support experimental results. In this, the geometric parameters of the compound were optimized by the density functional theory(DFT) B3LYP/6-31G(d) method using the gaussian 09 packet program and structural parameters (bond angles, bond lengths and dihedral angles), 1 H- and 13 C-NMR spectra and frontier molecular orbitals (HOMO-LUMO) of the single crystal have been calculatedtheoretically. Finally, the molecular doking simulation was carried out to inhibit the 2WQY receptor target structure for inhibitor activity study of the synthesized single crystal.