Dergiler / Mikrobiyoloji Bülteni / 2020 / Cilt: 54 - Sayı: 2
Dünya Sağlık Örgütü Uluslararası Sitomegalovirüs (CMV) Standardı ile Kalibre Edilmiş İki Ticari Kantitatif CMV Polimeraz Zincir Reaksiyonu Testinin Karşılaştırılması
- Sayfa
- 257–265
- DOI
- —
Özet
Transplantasyon yapılan hastalarda sitomegalovirüs (CMV) enfeksiyonlarının tanısı, takibi ve antiviraltedavi monitörizasyonunda CMV viral yük saptanması önemlidir. Bu amaçla en yaygın olarak kantitatifpolimeraz zincir reaksiyonu kullanılmaktadır. Bu çalışmada, Dünya Sağlık Örgütü (DSÖ) CMV standardıile kalibre edilmiş ticari testler olan CMV Cobas Ampliprep/Cobas Taqman (CMV-CAP/CTM) (Roche,Almanya) testi ve Artus CMV QIASymphony-Rotorgene (CMV-QS-RGQ) (Qiagen, Almanya) testlerininsonuçlarının karşılaştırılması amaçlanmıştır. Bu amaçla 244 plazma örneğinde eş zamanlı olarak CMVCAP/CTM ve CMV-QS-RGQ testleri çalışılmıştır. Test sonuçları kopya/ml olarak ölçülmüş, üretici firmalarınbelirttikleri şekilde, CMV-CAP/CTM testi için 0.91, CMV-QS-RGQ testi için 1.64 ile çarpılarak IU/ml’yeçevrilmiştir. CMV DNA; her iki testte 174 (%71.3) örnekte saptanmış, 52 (%21.3) örnekte saptanmamış,18 (%7.4) örnekte uyumsuz sonuç elde edilmiştir. Uyumsuzluk saptanan 18 örnekten 16’sında viral yükher iki testin dinamik ölçüm aralıklarının altındadır. CMV-CAP/CTM testi ile CMV DNA saptanamayanbir örnekte CMV-QS-RGQ ile 497 kopya/ml, CMV-QS-RGQ testi ile CMV DNA saptanamayan bir diğerörnekte ise CMV-CAP/CTM testi ile 334 kopya/ml CMV DNA saptanmıştır. Her iki testin kalitatif sonuçları arasında yüksek derecede uyum saptanmıştır (kappa= 0.80, p 0.5 log10 olan örnek sayısı ise artmış ve aradaki farkistatistiksel olarak anlamlı bulunmuştur (p< 0.001). Roche CMV CAP/CTM ve Artus CMV-QS-RGQ testlerinin DSÖ uluslararası CMV standardı ile kalibre edilmesi plazma örneklerinde kantitatif sonuçlar arasındakarşılaştırılabilirliği artırmamış, aksine sonuçlar IU/ml’ye çevrildiğinde iki test sonucu arasında biyolojikolarak anlamlı viral replikasyona işaret eden ölçüm farkı saptanmıştır.
Abstract
Cytomegalovirus (CMV) viral load quantitation is important in diagnosis, follow-up, and monitoring of antiviral therapy in transplanted patients. In this study, it was aimed to compare the results of the two commercial World Health Organization (WHO) International CMV standard calibrated polymerase chain reaction tests, CMV Cobas Ampliprep/Cobas Taqman (CMV-CAP/CTM) (Roche, Germany) and Artus CMV QIASymphony-Rotorgene (CMV-QS-RGQ) (Qiagen, Germany). Both tests were performed simultaneously on 244 plasma samples. The results were measured in copies/ml and converted to IU/ml by multiplying with 0.91 for CMV-CAP/CTM and 1.64 for CMV-QS-RGQ, as specified by the manufacturers. CMV DNA was detected in 174 (71.3%) and was not detected in 52 (21.3%) of the samples and eighteen (7.4%) samples had discordant results by both of the tests. In 16 out of 18 samples with discordance, the viral load was below the dynamic measuring ranges of both tests. In one sample, CMV DNA could not be detected by CMV-CAP/CTM but detected by CMV-QS-RGQ with 497 copies/ml, and 334 copies/ ml CMV DNA was detected by CMV-CAP/CTM in another sample where it could not be detected by CMV-QS-RGQ. A high degree of agreement was found between the qualitative results of the both tests (kappa= 0.80, p 0.5 log10 increased and the difference was found as statistically significant (p< 0.001). Calibrating the Roche CMV CAP/CTM and Artus CMV-QS-RGQ tests with the WHO international CMV standard did not increase comparability between quantitative results in plasma samples, on the contrary, it was found that when the results were converted to IU/ml, a measurement difference indicating biologically significant viral replication was detected between the two test results.