Distribution of HCV Genotypes in Patients of with Chronic Hepatitis C in the Eastern Anatolia Region

Doğu Anadolu Bölgesindeki Kronik Hepatit C Hastalarında HCV Genotiplerinin Dağılımı

Özet

Amaç: Hepatit C virüsü (HCV) kan yoluyla bulaşan, tüm dünyada geniş kitleleri etkileyen, kronik hepatit, siroz ve hepatoselüler karsinom gibi hastalıkların önemli etkenlerinden biridir. Hepatit C virüsünün genotipik değişkenliği hepatit C hastalarının takibinde ve tedavisinde yol gösterici olmaktadır. Daha önce Doğu ve Kuzey-Doğu Anadolu bölgesi hastalarında hepatit C virüs genotiplendirilmesiyle ilişkili bir sonuç verilmemiştir. Bu çalışma, yöremizdeki hastalarda hepatit C virüs genotip prevalansının belirlenmesi amacıyla planlanmıştır. Gereç ve Yöntemler: Bu çalışma Doğu Anadolu bölge illerinden Ocak 2011-Şubat 2014 tarihleri arasında Atatürk Üniversitesi Araştırma Hastanesine başvuran kronik hepatit C hastalarının serum örnekleri üzerinde gerçekleştirilmiştir. Anti- HCV antikorları enzim immunoassay kitleri (Dia. Pro Diagnostic Bioprobes Srl, Milano, Italy) ile otomatik analizörde (Radim/Alisei®, Calenzano-Firenze, Italy); HCV-RNA yükü kantitatif PCR (Qiagen©, Germany) ile araştırıldı. HCV genotipleri pirosekanslama yöntemi ile (Pyromark Q24 kit, Qiagen©, Germany) kitleri ve otomatik analizörü kullanılarak araştırılmıştır. Bulgular: Bu çalışmada, Doğu Anadolu bölgesi sınırları içindeki yedi farklı ilde yaşayan kronik hepatit Cli olgularda 1b (%87,0), 1a (%8,3), 3a (%3,7) ve 4d (%1) olmak üzere dört farklı HCV subgenotipi tespit edilmiştir. Bölgemizde en yaygın ana genotipin genotip 1 olduğu görülmüştür. Sonuç: Doğu Anadolu illerindeki kronik hepatit Cli hastalarda HCV genotiplerinin prevalansı ilk kez bildirilmiştir. Bu çalışmanın, HCV genotiplerine ilişkin bölgesel epidemiyolojik verilere ve bölgemizdeki HCVli hastaların tedavi stratejilerinin belirlenmesine katkı sağlayacağını düşünüyoruz.

Abstract

Objectives: Hepatitis C is a blood-borne virus affecting a large number of people all over the world. Hepatitis C virus (HCV) is one of the important causative agents of chronic hepatitis, cirrhosis, and hepatocellular carcinoma. Its viral genotypes variability affects response to interferon treatment. Therefore, identification of viral genotypes is key to management and treatment of hepatitis C infection. In our region, there has been no study on genotyping of the virus yet. This study was designed to determine the prevalence of HCV genotypes in our region. Materials and Methods: This study was conducted on the serum specimens of patients with chronic hepatitis C in the provinces of the Eastern Anatolia Region who attended Atatürk University between January 2011 and February 2014. Anti-HCV antibodies in the serum specimens were identified using an enzyme immunoassay kit (Dia. Pro Diagnostic Bioprobes Srl, Milan, Italy) and automatic analyzer, (Radim/ Alisei®, Calenzano-Firenze, Italy). HCV-RNA load was detected by quantitative PCR (Qiagen©, Germany). HCV genotypes were determined by pyrosequencing method using Pyromark Q24 kit and automatic analyzer (Qiagen©, Germany). Results: Four different HCV subgenotypes including 1b (87.0%), 1a (8.3%), 3a (3.7%) and 4d (1%) have been identified in seven different provinces within the Eastern Anatolia Region. Genotype 1 was found to be the most common major genotype. Conclusion: The prevalence of HCV genotypes in patients in the Eastern Anatolia Region was reported for the first time. We assume that the results obtained from this study may contribute to regional epidemiological data on HCV genotypes and to the treatment strategies for patients with hepatitis C in our region.