An Analysis of Polymorphism Lymphotoxin Alpha +252 A>G in South Indian Breast Cancer Patients

Güney Hindistanda Meme Kanseri Hastalarında Bir Polimorfizm Lenfotoksin Alfa +252 A>G Analizi

Özet

Sitokin tümör nekrozis faktörü, inflamasyon, immünomodülatör ve apoptotik aktiviteler gibi geniş bir fonksiyon yelpazesine katkıda bulunur. Amacımız, primer invaziv meme kanserli hastalarda, plazma lenfotoksin alfa (LTA) düzeyinin +252A>G'de polimorfizm rs909253 ile ilişkisini araştırmaktı. Çalışmaya toplam 146 hasta ve yaş-uyarlı 150 sağlıklı kontrol alındı. Genotipleme, polimeraz zincir reaksiyonu ve kısıtlama fragmanı uzunluğu polimorfizmiyle gerçekleştirildi. Plazma seviyeleri, MILLIPLEX® MAP İnsan Sitokin / Chemokine Panel manyetik boncuk kitleri tarafından tahmin edilmiştir. Verilerin istatistiksel analizi R software version 3.3.1. ile yapılmıştır. Plazma LTA düzeyleri, kontrol grubuna göre anlamlı düzeyde arttı. Ancak, düzeyler polimorfik alt tiplere göre analiz edildiğinde anlamlı fark yoktu. Polimorfizm, vakalar ve kontroller için X2 değerleri sırasıyla 2.3 (p= 0.13) ve 2.02 (p= 0.15) idi ve Hardy Weinberg (HW) dengesiyle tutarlıydı. Odds ratio (OR), polimorfizmin meme kanseri ile anlamlı bir şekilde ilişkili olmadığını gösterdi. Plazma LTA seviyeleri, hastalar ve kontrollerde polimorfizm nedeniyle değişmedi. Yüksek grade'li ve hormon reseptör negatif olguların tümörlerinde G allel frekansı daha yüksekti, bu da G allel hastalarının daha kötü prognoza sahip olabileceğini göstermektedir. Bu çalışma, LTA +252A>G gen polimorfizminin meme kanseri için belirgin bir risk faktörü olmadığını göstermektedir

Abstract

Cytokine tumor necrosis factor contributes to a wide range of functions like inflammation, immunomodulatory and apoptotic activities. Our aim was to investigate the association of plasma levels of lymphotoxin alpha (LTA) with polymorphism rs909253 at +252A>G in primary invasive breast cancer(BC) patients. A total of 146 patients and 150 age matched healthy controls were included in the study. Genotyping was carried out by polymerase chain reaction and restriction fragment length polymorphism. Plasma levels were estimated by The MILLIPLEX® MAP Human Cytokine / Chemokine Panel magnetic bead kits. Data was statistically analysed by R software version 3.3.1. Plasma levels of LTA was significantly increased in cases when compared to controls. However, when levels was analyzed according to polymorphic subtypes there was no significant difference. The polymorphism was in consistent with the Hardy Weinberg(HW) equilibrium, showing X2 values of 2.3 (p= 0.13) and 2.02(p= 0.15) for cases and controls respectively. Odds ratio (OR) indicated that polymorphism was not significantly associated with breast cancer. Plasma levels of LTA were not altered due to polymorphism in patients and controls. Tumors of high- grade and hormone receptor negative cases showed higher frequency of the G allele, indicating that G allele patients may have worse prognosis. This study suggests that LTA +252A>G gene polymorphism is not a prominent risk factor for BC