Dergiler / Mikrobiyoloji Bülteni / 2003 / Cilt: 37 - Sayı: 1
Candida dubliniensis suşlarının sıcaklık toleransı testi, morfolojik özellikler ve moleküler yöntemlerle tanımlanması
- Sayfa
- 49–57
- DOI
- —
Özet
Candida dubliniensis, germ tüp oluşturma özelliği nedeniyle rutin laboratuvarlarda kullanılan testlerle Candida albicans'dan ayırımı yapılamayan, 1995 yılında tanımlanmış bir Candida türüdür. Bu çalışmada, daha önce germ tüp oluşturduğu saptanarak C. albicans olarak tanımlanmış 213 sus, C.dubliniensis yönünden retrospektif olarak incelenmiştir. Bu amaçla suşlar, başlangıçta tarama amacıyla mısır unlu tween 80 besiyerindeki morfolojik görünüm, 45°C'de ürememe ve asimilasyon profili (İD 32C, bioMerieux, Fransa) yönünden incelenmiştir. Bu incelemeler sonucunda 2 suşun (%0.9), C.dubliniensis ile uyumlu olarak 45°C'de üremediği ve mısır unlu tween 80 besiyerinde zincir şeklinde çok miktarda klamidospor oluşturduğu görülmüş, bu suşların asimilasyon profilleri C.dubliniensis tanısını desteklemiştir. Tanımlamanın kesinleştirilmesi ve doğrulanması amacıyla bu iki suş, C.dubliniensis'e özgül DUBF ve DUBR primer çifti kullanılarak polimeraz zincir reaksiyonu (PZR) ile incelenmiş ve agaroz jel elektroforezi ile 288 bazçiftlik amplifikasyon ürünü saptanarak C.dubliniensis tanımlaması moleküler düzeyde doğrulanmıştır. Bu suşlarin, flukönazol, itrakonazol ve amfoterisin B'ye in-vitro duyarlılığı NCCLS M27-A2 yöntemiyle araştırılmış, her ikisinin de flukönazol ve itrakonazole duyarlı olduğu saptanmıştır. Suşların amfoterisin B minimum inhibitör konsantrasyon ($mu$g/ml) değerleri 0.5 ve 1 $mu$g/ml olarak bulunmuştur. Bu veriler değerlendirildiğinde, hastanemizde C. dubliniensis izolasyon oranının düşük olduğu, mısır unlu tween 80 besiyerinde morfolojik görünüm ve 45°C'de ürememe özelliklerinin tarama testi olarak ön tanımlama için kullanılabilecek özgül, pratik ve ucuz yöntemler olduğu sonucuna varılmıştır.
Abstract
Described in 1995, Candida dubliniensis is a novel Candida species closely related to Candida albicans due primarily to its ability to producegerm tube and chlamydospores. Given these phenotypic similarities between the two species, C.dubliniensis cannot be readily distinguished from Candida albicans by routine laboratory work-up. We explored the frequency of isolation of C.dubliniensis among 213 strains previously defined as C.albicans based on their ability to produce germ tube. The test isolates vvere initially examined for their morphological features on cornmeal tween 80 agar, inability to grow at 45°C, and the biochemical assimilation profile (ID 32C system; bioMerieux, France). Among all, 2 (0.9%) of the isolates were identified as C.dubliniensis based on the production of numerous chlamydospores in chains on cornmeal tween 80 agar was found to be in accordance with this Identification, in an effort to confirm the identification, polymerase chain reaction (PCR) studies were carried out by using the C.dubliniensis specific primer set, DUBF and DUBR. Both of the isolates yielded C.dubliniensis-spectilc 288 base with the initial screening tests. The isolates were found to be susceptible to fluconazole and itraconazole, and generated amphotericin B minimal inhibitory concentrations of 0.5-1 $mu$g/ml by NCCLS M27-A2 microdilution method. These data suggest that the isolation rate of C.dubliniensis among our clinical isolates is low. The morphological features on cornmeal tween 80 agar and the lack of ability to grow at 45°C appear as reliable, cheap, and practical screening tests in initial identification of C.dubliniensis among germ tube-producing Candida strains.