Dergiler / Mikrobiyoloji Bülteni / 2009 / Cilt: 43 - Sayı: 2
Helicobacter pylori izolatlarının antibiyotik direnç oranları ve klaritromisine dirençli suşların saptanmasında E-test ve floresan in situ hibridizasyon yöntemlerinin karşılaştırılması
- Sayfa
- 227–234
- DOI
- —
Özet
Helicobacter pylori enfeksiyonu, dünyada yaygın olarak görülen kronik bakteriyel enfeksiyonlardan biri olup kronik gastrit, peptik ülser ve gastrik kanser ile ilişkilidir. H.pylori eradikasyonunda geçerli tedavi rejimi, proton pompa inhibitörü (PPI) ile amoksisilin, klaritromisin ve metronidazolü içeren iki antibakteriyel ajanın kombinasyonudur. Son yıllarda H.pylori'de antibiyotiklere karşı giderek artan direnç oranı tedavide başarısızlığa neden olmaktadır. Bu çalışmada, dispeptik yakınmaları nedeniyle Uludağ Üniversitesi Tıp Fakültesi Hastanesi, Gastroenteroloji Kliniğine başvuran 31 hastaya (yaş aralığı: 24-65 yıl; yaş ortalaması: 48.3 ± 11.3 yıl) ait gastrik biyopsi örneklerinden izole edilen H.pylori izolatlarının antibiyotik direnç oranları incelenmiş ve klaritromisin direncinin saptanmasında E-test (AB Biodisk, isveç) ve floresan in situ hibridizasyon (FISH; SeaFAST® Hemakim, Macaristan) yöntemleri karşılaştırılmıştır. Çalışılan 31 H.pylori izolatının klaritromisin, amoksisilin, metronidazol, tetrasiklin ve siprofloksasine karşı duyarlılığı E- test yöntemi ile çalışılmış ve direnç oranları sırasıyla %41.9, %3.2, %41.9, %3.2 ve %45.2 olarak saptanmıştır. izolatların %32.2'sinde tek antibiyotiğe karşı direnç, %45.2'sinde ise çoklu antibiyotik direnci belirlenmiştir. Hibridizasyonda, biri 16S rRNA'ya özgül ve "fluorescein" boyası ile işaretli, diğerleri 23S rRNA'daki mutasyonlara özgül ve Cy3 boyası ile işaretli problar kullanılmış; yeşil ışımanın saptanması H.pylori varlığı açısından, kırmızı ışımanın saptanması ise klaritromisine dirençli H.pylori varlığı açısından pozitif olarak değerlendirilmiştir. Sonuç olarak FISH yönteminde izolatların tamamı yeşil ışıma vermiş, E- test ile klaritromisin direnci saptanan 13 izolatın hepsinde kırmızı ışıma gözlenmiş ve klaritromisin direncini saptamada her iki yöntem arasında bir fark saptanmamıştır. Bizim çalışmamız, suş sayımızın az olmasına rağmen, bölgemizdeki H.pylori antibiyotik duyarlılık oranlarının bildirildiği öncü çalışma olup daha fazla sayıda izolatın incelendiği çok merkezli geniş araştırmalara ihtiyaç vardır.
Abstract
Helicobacter pylori which is one of the commonly seen chronic bacterial infections in the world, has been demonstrated to have a relationship with chronic gastritis, peptic ulcer disease and gastric cancer. Current management of H.pylori infection involves the use of a proton pump inhibitor (PPI) and any two of amoxicillin, clarithromycin and metronidazole in combination. Antibiotic resistance which is in an increasing trend in H.pylori since the recent years, is the main cause of treatment failure. This study was conducted to determine the susceptibility of 31 H.pylori strains to several antibiotics by using E-test method (AB Biodisk, Sweden) and also to detect clarithromycin resistance by fluorescent in situ hybridization (FISH; SeaFAST®, Hungary). The strains were isolated from the gastric biopsy specimens of patients who were admitted to Uludağ University Hospital, Bursa, Turkey with dyspeptic complaints. Clarithromycin, amoxycillin, metronidazole, tetracycline and ciprofloxacin resistance rates were as 41.9%, 3.2%, 41.9%, 3.2% and 45.2%, respectively. Resistance to single antibiotic was detected in 32.2% of the isolates whereas multiresistance was seen in 45.2%. For the hybridization process one probe specific for 16S rRNA and labeled with a fluorescein dye and the other probe specific for the mutations in 23S rRNA and labeled with Cy3 stain were used. Green signalling denoted presence of H.pylori in the specimen and red signalling was associated with clarithromycin resistance. All of the isolates yielded green signalling and the 13 isolates found to be resistant to clarithromycin by E-test, gave red signalling. No difference was detected between the two methods in terms of clarithromycin resistance determination. This was a preliminary study reporting the H.pylori resistance rates in our region, however, further larger scale studies are required for obtaining countrywide data.