Dergiler / Mikrobiyoloji Bülteni / 2009 / Cilt: 43 - Sayı: 3
Bir eğitim hastanesinin çocuk kliniğinde vanA genotip Enterococcus faecium salgını
- Sayfa
- 365–372
- DOI
- —
Özet
Vankomisine dirençli enterokok (VDE) Amerika Birleşik Devletleri ve Avrupa'daki ülkelerden ilk izole edilmesinden sonra, dünyadaki çoğu ülkeden artan oranlarda bildirilmektedir. 2008 yılı Mart ayının ilk haftasında Gülhane Askeri Tıp Akademisi çocuk kliniğinde, hastane enfeksiyon kontrol komitesi tarafından vankomisine dirençli Enterococcus faecium (VDEF) salgını tespit edilmiştir. VDEF izolatlanndan biri nö-roblastomalı hastanın idrar kültüründen, diğerleri nefrotik sendromlu bir hastanın idrar kültürü, rektal sü-rüntü örneği ve odasında bulunan kapı kolundan izole edilmiştir. Bu çalışmanın amacı, çocuk kliniğinde salgına neden olan 4 VDEF izolatının antibiyotik duyarlılıklarının belirlenmesi, polimeraz zincir reaksiyonu (PCR) ile vanA, vanB ve vanC-2 direnç genlerinin tespit edilmesi, "pulsed field gel electrophoresis (PFCE)" ve repetitif-PCR (rep-PCR) yöntemleriyle (DiversiLab, Biomerieux, Fransa) izolatlar arasındaki ge-notipik ilişkinin belirlenmesidir. Tüm izolatlann, E-test (AB-Biodisk, Solna, İsveç) yöntemi ile vankomisin ve teikoplanine yüksek düzeyde dirençli [minimum inhibitor konsantrasyonu (MİK) > 256 mg/L] olduğu; Phoenix (Becton Dickinson, ABD) sistemiyle ise streptomisin, gentamisin, ampisilin, eritromisin ve penisiline dirençli, tetrasiklin ve linezolide duyarlı olduğu bulunmuştur. PCR yöntemi ile tüm izolatlarda vanA geni tespit edilmiş, vanB ve vanC-2 genleri ise saptanmamıştır. Hem PFGE hem de rep-PCR yöntemi ile enfeksiyona neden olan izolatlann tek bir klona ait olduğu gösterilmiştir. Sonuç olarak, VDE izolatlarmın erken tespiti, suşlârın horizontal yayılımının önlenmesinde büyük Önem taşımaktadır. Çalışmamızda, PFCE yöntemi ile karşılaştırıldığında, ticari rep-PCR sisteminin salgına neden olan izolatlann tespit edilmesinde daha hızlı bir yöntem olduğu belirlenmiştir.
Abstract
Vancomycin-resistant enterococci (VRE) have been increasingly reported from most countries around the world following initial isolation from patients in United States and European countries. A vancomycin-resistant Enterococcus faecium (VREF) outbreak was determined by hospital infection control committee in the pediatric unit of Gulhane Military Medical Academy, Ankara, Turkey in the first week of March 2008. While one of the 4 VREF strains was isolated from urine culture of a patient with neuroblastoma, the remaining strains were isolated from cultures of urine and rectal swab samples of a patient with nephrotic syndrome and from the hospital room doorknob of this patient. Aims of this study were to determine antibiotic susceptibilities by E-test, to investigate the presence of vanA, vanB and vanC-2 resistance genes by polymerase chain reaction (PCR), and to genotype the 4 strains by pulsed field gel electrophoresis (PFGE) and repetitive PCR (rep-PCR) (DiversiLab, bioMerieux, France). All isolates conferred high level [minimum inhibitor concentration (MIC) > 256 mg/L] vancomycin and teicoplanin resistance by E-test method. The isolates were also found resistant to gentamicin, streptomycin, ampicillin, erythromycin, penicillin and were susceptible to tetracycline and linezolid. The vanA gene was detected in all strains by PCR. It was demonstrated that the 4 VRE straiffTbelonged to a single clone as shown by both PFGE and rep-PCR methods. Prompt and accurate detection of VRE and determination of the genotypes is of crucial importance to prevent horizontal tranWer of the strains in the hospital. When compared with PFGE, the DiversiLab commercial rep-PCR seems to be a reliable and more rapid method to detect the genetic relationship between strains leading to an outbreak.