Dergiler / Mikrobiyoloji Bülteni / 2010 / Cilt: 44 - Sayı: 4
Klinik örneklerden izole edilen karbapeneme dirençli Acinetobacter Baumannıı suşlarında sınıf 1integron taşıyıcılığının araştırılması
- Sayfa
- 547–552
- DOI
- —
Özet
Acinetobacter türleri, özellikle Acinetobacter baumannii, çeşitli hastane enfeksiyonlarından da sorumlu olan, önemli fırsatçı patojenlerdir. Sıklıkla geniş spektrumlu beta-laktam antibiyotikler, aminoglikozidler ve kinolonları da içeren birçok antibiyotiğe direnç geliştirme eğilimindedirler. Bu çalışmada hastane enfeksiyonu etkeni olan A.baumannii izolatlarında sınıf 1 integron taşıyıcılığı sıklığının saptanması amaçlanmıştır. Bunun için SB Ankara Numune Eğitim ve Araştırma Hastanesinde Eylül 2006-Ağustos 2007 tarihleri arasını kapsayan bir yıllık dönemde farklı klinik örneklerden hastane enfeksiyonu etkeni olarak izole edilen karbapeneme dirençli toplam 89 adet A.baumannii suşu değerlendirilmiştir. İzolatların sınıf 1 integron taşıyıcılıkları 5’CS ve 3’CS primerleri kullanılarak, korunmuş bölgelerle sınırlanmış değişken bölgeleri içeren kromozomal DNA bölümü amplifiye edilerek araştırılmıştır. Bunun sonucunda suşların %93.3 (83/89)’ünün sınıf 1 integron yapısı taşıdıkları ortaya konulmuştur. Araya giren gen kasetlerinin boyutlarının 100-3000 baz çift arasında değiştiği izlenmiştir. Bugüne kadar yapılan çalışmalarda Acinetobacter türlerinde sınıf 1 integron yapısının yaygın olduğu bildirilmiştir. Bizim çalışmamızda da %93.3 oranı ile sınıf 1 integron pozitifliği yüksek olarak bulunmuştur. İzolatların “pulsed-field” jel elektroforezi (PFGE) yöntemi ile tiplendirilmeleri sonucunda 13 farklı gruba ayrıldıkları ve iki grupta yoğunlaşma olduğu izlenmiştir (grup A: 29; grup C: 21 izolat). Sınıf 1 integron yapısını taşımayan toplam 6 izolatın (6/89; %6.7) 5’inin aynı PFGE paternini (grup C) gösterdikleri saptanmıştır. İntegronlar antibiyotik direnç genlerinin dağılımında ve suşların nozokomiyal yayılımında önemli rol oynamaktadır. İntegronların polimeraz zincir reaksiyonu yöntemi ile araştırılması, A.baumannii izolatlarının epidemik potansiyelini ortaya koymada hızlı ve basit bir teknik olarak görünmektedir.
Abstract
Acinetobacter species, particularly Acinetobacter baumannii, are important opportunistic pathogens responsible for nosocomial infections. They are often resistant to a wide range of antibiotics, including broad-spectrum beta-lactams, aminoglycosides and quinolones. This study was aimed to investigate the presence of class 1 integrons in nosocomial A.baumannii isolates. Eighty-nine carbapenem resistant nosocomial A.baumannii strains recovered from various clinical samples at Ankara Numune Teaching and Research Hospital during September 2006-August 2007, were included in the study. To determine the presence of integrons in Acinetobacter isolates, a chromosomal DNA region that consists of internal variable gene sequences restricted to two conserved regions, was amplified by using 5’CS and 3’CS primers. Class 1 integrons were demonstrated in 93.3% (83/89) of the strains. The range of inserted gene cassette sizes detected varied from 100 to 3000 base pairs. Recent studies have shown that the majority of integrons belong to class 1 among Acinetobacter species. This study also indicated that class I integrons were present in 93.3% of the A.baumannii isolates. The isolates were genotyped by pulsed-field gel electrophoresis (PFGE) and found to be distributed into 13 different groups, two of the groups predominated the isolates (group A: 29, group C: 21 isolates). Five of 6 isolates that did not have the class 1 integron (6/89; 6.7%) exhibited the same PFGE pattern (group C). Since integrons are important for the dissemination of antibioticresistance genes among nosocomial Acinetobacter species, the investigation of integrons by polymerase chain reaction method seems to be a rapid and simple technique for revealing the epidemic potential of A.baumannii isolates.