Enterokok suşlarının antimikrobiyal duyarlılıklarının belirlenmesinde mikrodilüsyon yöntemi ile phoenix otomatize sisteminin karşılaştırılması

Comparison of microdilution method and phoenix automated system for testing antimicrobial susceptibilities of enterococcus strains

Özet

Enterokoklar aminoglikozidler ve sefalosporinler gibi yaygın olarak kullanılan antibiyotiklere dirençli olan önemli patojenlerdir. Uygun antimikrobiyal tedavinin verilebilmesi için direncin doğru olarak belirlenmesi önemlidir. Bu çalışmanın amacı, enterokokların antimikrobiyal duyarlılıklarının saptanmasında Phoenix sisteminin (Becton Dickinson, ABD), referans mikrodilüsyon yöntemiyle karşılaştırılmasıdır. Çalışmaya, 2005-2007 tarihleri arasında Hacettepe Üniversitesi Hastanesi rutin mikrobiyoloji laboratuvarında klinik örneklerden izole edilen 1248 Enterococcus spp. (903 Enterococcus faecalis, 345 Enterococcus faecium) suşu alınmıştır. Suşlar Phoenix sistemi tarafından tanımlanmış; ampisilin, teikoplanin, vankomisin, gentamisin ve streptomisin duyarlılıkları Phoenix sistemi ve mikrodilüsyon yöntemiyle çalışılmıştır. İki yöntem arasındaki kategori uyumu oranları tüm antibiyotiklerde %97’nin üzerinde hesaplanmıştır. Çalışılan 1248 suştan 76 tanesinde uyumsuz sonuçlar gözlenmiştir. Çok büyük hata oranları ampisilinde %1.5, gentamisinde %1.3, streptomisinde ise %0.9 olarak belirlenmiştir. Büyük hata oranlarının streptomisin için %1.4, ampisilin ve vankomisin için %0.6, gentamisin için %0.3 olduğu görülmüş; küçük hata oranları ise vankomisinde %0.2, teikoplaninde %0.1 olarak saptanmıştır. Mikrodilüsyonla elde edilen direnç oranları; streptomisin için %44, gentamisin için %29.7, ampisilin için %25.6, vankomisin için %2.2 ve teikoplanin için %2.2 olarak bulunmuştur. E.faecium’da direnç oranlarının E.faecalis’e göre daha yüksek olduğu görülmüştür. Vankomisine dirençli enterokokların %96.4’ü E.faecium olarak tanımlanmıştır. Sonuç olarak elde edilen verilere göre, enterokokların antimikrobiyal duyarlılıklarının belirlenmesinde, Phoenix sistemi, “Clinical and Laboratory Standarts Institute (CLSI)”un önerdiği mikrodilüsyon yöntemi ile karşılaştırıldığında, güvenilir olduğu sonucuna varılmıştır. Ancak, vankomisine dirençli enterokok tanısının hasta ve hastane açısından ayrı bir öneme sahip olması nedeniyle, Phoenix sisteminde vankomisin direnci saptandığında mikrodilüsyon yöntemiyle doğrulanması önerilmektedir.

Abstract

Enterococcus spp. are important pathogens which are intrinsically resistant to most of the commonly used antimicrobial agents such as aminoglycosides and cephalosporins. Accurate determination of resistance is important to ensure appropriate antimicrobial therapy. This study was undertaken to compare the susceptibility results obtained by Phoenix system (Becton Dickinson, USA) with reference microdilution method. We included 1248 Enterococcus spp. (903 Enterococcus faecalis, 345 Enterococcus faecium) strains isolated from clinical samples between 2005-2007 in routine microbiology laboratory of Hacettepe University Hospital. The strains were identified and the antimicrobial susceptibilities were determined by the Phoenix system. Antimicrobial susceptibilities to ampicillin, teicoplanin, vancomycin, gentamicin and streptomycin were also studied by microdilution method according to Clinical and Laboratory Standards Institute (CLSI) guidelines. Evaluation revealed excellent agreement for all of the antibiotics with category agreement rates of > 97%. Among 1248 strains, 76 revealed discordant results. Very major error rates were 1.5% for ampicillin, 1.3% for gentamicin, and 0.9% for streptomycin. Major error rates were 1.4% for streptomycin, 0.6% for ampicillin and vancomycin and 0.3% for gentamicin. Minor error rates were found as 0.2% for vancomycin, and 0.1% for teicoplanin. Resistance rates obtained by microdilution were as follows; high level streptomycin 44%, high level gentamicin 29.7%, ampicillin 25.6%, vancomycin 2.2% and teicoplanin 2.2%. Resistance rates were higher in E.faecium than E.faecalis and 96.4% of the vancomycin resistant enterococcus isolates were identified as E.faecium. In conclusion, based on the data obtained, Phoenix system is reliable for testing susceptibilities of Enterococcus spp. to these antimicrobials. Since isolation of vancomycin resistant enterococci has an important impact in terms of hospital infection control, vancomycin resistance reported by the Phoenix system should be confirmed with an alternative susceptibility testing method.