Dergiler / Mikrobiyoloji Bülteni / 2012 / Cilt: 46 - Sayı: 2
Koagülaz-negatif stafilokoklarda makrolid-linkozamid-streptogramin B grubu antibiyotiklere karşı nadir direnç genlerinin araştırılması
- Sayfa
- 170–179
- DOI
- —
Özet
Stafilokok enfeksiyonlarının tedavisinde makrolid, linkozamid ve streptogramin B (MLS B) grubu anti-biyotikler ilk seçenek olarak önerilmektedir. Bu gruptaki antibiyotiklerin hepsi bakteri ribozomunun 50S alt ünitesine bağlandıkları için çapraz direnç gelişimi önemli bir sorundur. Dirençten sorumlu mekaniz-malar arasında; (a)erm genlerinin kodladığı metilazlar yoluyla ribozomal hedefin modifikasyonu, (b) msrA, msrB, vga, vgb genlerinin sorumlu olduğu ilacın hücre dışına atılması ve (c) linA,vat,vatB genleri-nin sorumlu olduğu ilacın enzimatik inaktivasyonu yer almaktadır. En sık görülen direnç genleri erm ve msr iken, çeşitli çalışmalarda linA,vga,vgb,vat ve vatB genlerinin varlığından da söz edilmektedir. Bu çalışmada çeşitli klinik örneklerden izole edilen 454 koagülaz-negatif stafilokok (KNS) suşunda nadir bildirilen MLS B direnç genleri incelenmiş ve erm,msr genleriyle birlikte bulunma sıklıkları araştırılmıştır. KNS izolatlarının %46.5 (n= 211)i Staphylococcus hominis , %30.8 (n= 140)i Staphylococcus epidermidis, %12.1 (n= 55)i Staphylococcus haemolyticus, %3.5 (n= 16)i Staphylococcus warnerii ve %7 (n= 32)si diğer türlerden oluşmaktadır. Suşların direnç fenotipleri, Clinical and Laboratory Standards Institute (CLSI) önerilerine göre D-test yöntemi uygulanarak belirlenmiştir. D-test ile suşların 107 (%23.6)si M (eritromisine dirençli ve D-test ile indüklenebilir klindamisin direnci tespit edilmeyen fenotip), 92 (%20.3)si iMLS B (D-test ile indüklenebilir klindamisin direnci tespit edilen fenotip) ve 110 (%24.2)u cMLS B (yapısal olarak eritromisin ve klindamisin direncinin görüldüğü fenotip) fenotipi olarak saptanmıştır. iMLS B (n= 92) ve cMLS B (n= 110) fenotipi gösteren suşların tamamı ile M fenotipi gösteren 107 suş arasından rastgele seçilen 46 suş,linA, vga,vgb, vat,vatB,ermA,ermB,ermC, msrA ve msrB genlerinin varlığı açısından polimeraz zincir reaksiyonu yöntemiyle incelenmiştir. Tek başına veya erm ve/veya msr genleriyle kombine olarak 91 (%20) suşta linA, 19 (%4.2) suşta vga gen varlığı saptanmıştır. linA geni; iMLS B,cMLS B ve M fenotipi gösteren suşların sırasıyla %52, %26 ve %13ünde tespit edilirken, vga geni sırasıyla %5.4, %12 ve %0.9 suşta gösterilmiştir. iMLS B ve cMLS B fenotipi gösteren suşlarda en sık görülen direnç geni ermC iken (sırasıyla; %32.6 ve %42.7), bunu ermC +linA gen kombinasyonu (sırasıyla; %31.5 ve %14.5) izlemiştir. M fenotipi gösteren suşlarda en sık görülen direnç msrA ve msrB gen kombinasyonu (%34.8) olmuş, ikinci sırayı msrA+msr B+linA (%19.1) kombinasyonu almıştır. Çalışmaya alınan hiçbir izolattavgb,vat ve vatB genleri belirlenmemiştir. Ülkemizde daha önce yapılmış MLS B grubu antibiyotiklere karşı nadir görülen direnç genleriyle ilgili çalışmaya rastlanmamıştır. Bu çalışma linA,vga,vgb,vat ve vatB genlerinin sıklığına ait ilk rapordur. Sonuç olarak, linA ve vga genlerinin yüksek sıklıkta görülmesi epidemiyolojik gen çalışmalarında bu genlerin de araştırılmaları gerektiğini göstermektedir.
Abstract
Macrolide-lincosamide-streptogramin B (MLS B) group antibiotics are recommended as first choice in the treatment of staphylococcal infections. All of those drugs bind to the 50S subunit of bacterial ribo-somes, thus cross-resistance is a major concern in this group of drugs. The mechanisms associated to re- sistance are (a) ribosomal methylation due to the methylases encoded by erm genes, (b) active drug eff-lux due to msrA, msrB, vga, vgb gene activity, (c) enzymatic inactivation of the drug due to the activity of linA, vat,vatB genes. While the most common resistance genes are ermA, ermB, ermC,msrA and msrB genes; linA, vga, vgb,vat and vatB genes have also been found in some studies. In this study it was ai-med to investigate the presence of the rare MLS B resistance genes and their coexistence with erm and msr genes in 454 clinical isolates of coagulase-negative staphylococci (CNS). Of them 46.5% (n= 211) were S.hominis, 30.8% (n= 140) were S.epidermidis, 12.1% (n= 55) were S.haemolyticus, 3.5% (n= 16) were S.warnerii and 7% (n= 32) were the other coagulase-negative staphylococcal species. Resistance phenotypes were determined by using D-test method according to the recommendation of Clinical and Laboratory Standards Institute (CLSI). With the D-test 107 (23.6%) strains were determined as M phe-notype (resistant to erythromycin and inducible clindamycin resistance was not detected), 92 (20.3%) were iMLS B phenotype (inducible clindamycin resistance was detected by the D-test) and 110 (24.2%) were cMLS B phenotype (constitutive erythromycin and clindamycin resistance was detected). linA, vga, vgb, vat, vatB, ermA, ermB,ermC,msrA, msrB genes were investigated by polymerase chain reaction in all strains showing iMLS B (n= 92) and cMLS B (n= 110) phenotypes and 46 randomly selected strains among 107 strains exhibiting the M phenotype. linA gene was found in 91 (20%) strains as single gene or in combination with erm or msr genes, and vga gene was found in 19 (4.2%) strains. linA gene was found in 52% of iMLS B phenotype, in 26% of cMLS B phenotype and 13% of M phenotype while vga gene was found in 5.4% of iMLS B phenotype, in 12% of cMLS B phenotype and in 0.9% of M phenoty-pe. The most common resistance gene among iMLS B and cMLS B phenotypes was ermC (32.6% and 42.7%, respectively), followed by ermC+ linA gene combination (31.5% and 14.5%, respectively). The most frequent gene combination was msrA and msrB in M phenotype (34.8%) and it was followed by a combination of msrA + msrB + linA genes (19.1%). None of the strains revealed presence of vgb, vat and vatB genes. There were no previous reports about the rarely detected resistance genes against MLS B an-tibiotics in our country. This was the first study which reported the frequency of linA, vga,vgb,vat and vatB genes in MLS B resistant CNS. In conclusion, since linA and vga genes were detected in high frequ- ency in MLS B resistant CNS in this study, it was thought that the investigation of these genes should be included in the further related epidemiologic gene research.