Dergiler / Iğdır Üniversitesi Fen Bilimleri Enstitüsü Dergisi / 2017 / Cilt: 7 - Sayı: 1
Türkiye’deki Dibekli Sıcak Su Kaynağından Termoflik Geobacillus sp. DB2 Suşunun Fizyo-Biyokimyasal Karakterizasyonu ve 16S rRNA Sekanslaması
- Sayfa
- 63–71
- DOI
- —
Özet
Jeotermal kaynaklar termofllerin habitatlarındandır. Bu çalışmada aerobik, çubuk şeklinde, hareketlive Gram-pozitif termoflik DB2 suşu Türkiye’deki Diyadin ilçesi Dibekli sıcak su kaynağından izole edilerekmorfolojik, fzyolojik, biyokimyasal testler ve 16S rRNA gen sekanslamayla tanımlandı. Optimal kültivasyonpH 6.0–6.5’da, 60 oC’de elde edildi. DB2 suşunun katalaz, nitrat redükleme, Metil red testi ve nişasta hidrolizipozitif, oksidaz, üreaz aktivitesi, jelatin ve kazein hidrolizi negatif olarak belirlendi. 16S rRNA gen sekansına bağlıflogenetik analizler DB2 suşunun %98.97 sekans benzerliği ile Geobacillus subterraneus subsp. aromaticivoransGe1(T)’e oldukça yakın olduğunu göstermektedir. Bu yeni tür, biyoteknolojik uygulamalarda kullanılabilirözelliktedir
Abstract
Geothermal sites are habitat for thermophilic microorganisms. In this study, a novel aerobic, rodshaped, motile and Gram-positive thermophilic bacterium DB2 was isolated from the hot water in Dibekli inthe town of Diyadin in Turkey and it was identifed by morphological, physiological, biochemical tests and 16SrRNA gene sequencing. Optimal cultivation was obtained at pH 6.0–6.5 and 60 oC. Strain DB2 was positive forcatalase activity, nitrate reduction, Methyl red test and starch hydrolysis, while it was negative for oxidase, urease,gelatine and casein hydrolysis. Phylogenetic analysis based on 16S rRNA gene sequences showed that isolate DB2was most closely related to Geobacillus subterraneus subsp. aromaticivorans Ge1(T) with a 98.97% sequencesimilarity. This novel strain can be used in biotechnological application.