Üst ve alt solunum yolu enfeksiyonu olan hastalarda solunum virüslerinin multipleks PCR yöntemi ile eşzamanlı saptanması

Simultaneous detection of respiratory viruses using multiplex PCR method in patients with upper and lower respiratory tract infection

CANDAN ÇİÇEK,Ayşe Kübra KARABOĞA ARSLAN,EYLEM ULAŞ SAZ,HÜSNÜ PULLUKÇU,GÜRSEL ÇOK

Özet

Amaç: Bu çalışmada, üst ve alt solunum yolu enfeksiyonu olan hastalarda multipleks PCR tanı yöntemi ile kısa sürede solunum virüslerinin saptanması amaçlan dı . Gereç ve Yöntem : Bu çalışmay a, Ocak 2007-Ağustos 2013 tarihleri arasında, üst veya alt solunum yolu enfeksiyonu ön tanısı alan, toplam 1708 (1220 çocuk , 488 erişkin ) hasta (%45. 1 kadı n, %54. 9 erkek, yaş aralığı 5 gün -94 yaş ) dahil edildi. Hastaların solunum yolu örneklerindeki solunum virüsleri , mültipleks PCR yöntemi ile araştırıldı . Bulgular: Toplam 1708 hastanın, 620sinde (%36.3) bir veya birden fazla solunum virüsü pozitif, 1088 inde (%63.7) negatif bulundu. Bu hastaların 63ünde (%3.7) çoklu etken saptandı. Çoklu etken saptanan örneklerin %89.5i çocuk hastalardı. Solunum yolu örneklerinin 387si (%22.7) poliklinik hastalarından , 1321i (%77.3) yatan hastalardan elde edildi. Poli klinik hastalarının %48.5i, yatan hastaların %32.7sinde (p<0.000), çocuk hastaların %39.2si, erişkin hastaların %29.1inde (p<0. 000) bir veya daha fazla solunum virüsü saptandı. Örneklerin tümünde influenza A(H1N1 )pdm09 virüsü %12.1, RSV %9.0, rhinoviru s %3.7, influenza A virüs ü %3.0 oranında pozitif bulundu. Sonuç: Akut solunum yolu enfeksiyonu olan hastaların yaklaşık %40ında solunum virüsleri pozitif bulun du . Hastaların yaklaşık %4ünde çoklu virüs enfeksiyonları saptan dı ve bunların %90a yakının ın çocuk hastalar olduğu görül dü . İnfluenza A(H1N1)pdm09 virüsü salgın nedeniyle ayrı tutul duğunda, en sık rastlanan üç patojenin sırasıyla; RSV, rhinovirus ve influenza A virüs ü olduğu görül dü . Çocuk larda erişkin hastalara göre; poliklinik hastalarında, yatan hastalara göre daha fazla oranda solunum virüsü saptan dı .

Abstract

Aim: In this study, we aimed to determine the respiratory viruses in a short time by multiplex PCR method in patients with upper and lower respiratory tract infections. Materials and Methods: In this report, between January 2007 and August 2013, a total of 1708 patients (1220 children, 488 adult; 45,1% female, 54.9% male , age range: 5 days-94 years) prediagnosed as having upper or lower respiratory tract infections were enrolled in the study. Respiratory viruses were investigated by multiplex PCR method in respiratory samples of these patients.Results: In a total of 1708 patients, 620 (36.3%) of them were positive for one or more respiratory viruses and 1088 (63.7%) were negative. In 63 of the patients (3.7%) multiple viruses were detected. Most of the samples (89.5%) containing multiple agents were detected in children. Respiratory specimens were obtained from 387 (22. 7%) outpatients and 1321 (77.3%) inpatients. One or more respiratory viruses were detected in 39.2% of pediatric patients, 29.1% of adult patients (p<0. 000), 48.5% of outpatients and 32.7% of inpatients. In all samples, influenza A(H1N1)pdm09 virus, RSV, rhinovirus and influenza A virus were found be positive in 12.1%, 9.0%, 3.7% and 3.0%, respectively. Conclusion: Respiratory viruses were positive 40% in patients with acute respiratory tract infections. Multiple viral infections were detected in approximately 4% patients. Almost 90% of these patients were found to be of the pediatric patients. If influenza A(H1N1)pdm09 virus is kept separate, the three most common pathogen were RSV, rhinovirus and influenza A virus, respectively. Respiratory viruses were de tected more frequently in children compared to adult patients and in outpatient compared to hospitalized patients.