Polymerase chain reaction (PCR) technique in detection of actinomyces spp by using cervico-vaginal fluid samples

Actinomyces türlerinin serviko-vajinal sıvı örneklerinde polimeraz zincir reaksiyonu (PCR) yöntemiyle saptanması

Özet

AMAÇ: Serviko-vajinal sıvı örneklerinde, Polimeraz Zincir Re - ak siyonu (PCR) tekniği kullanılarak en yaygın Actinomyces türlerinin saptanması. GEREÇ VE YÖNTEM: Bu çalışmada 200 hastadan servikovajinal sıvı örneği alınmış ve her hastadan DNA izole edilmiştir. PCR yöntemi, iki amaç için kullanılmıştır. Bu amaçlardan birincisi, Actinomyces cinsinin dahil olduğu Actinomyce tales’in tanımlanması, ikincisi ise örneklerde bulunan Actino myces türlerinin tiplendirilmesidir. BULGULAR: Actinomycetales, 200 örneğin 16’sında (%8) PCR yöntemi ile tespit edilmiştir. Bu 16 örneğin ise 8’inde, A. meyeri (%25), A. viscosus (%1) ve A. israelii (%0,5) türlerinden en az birinin olduğu belirlenmiştir. A. odontolyticus türü hiçbir sıvı örneğinde tespit edilmemiştir. SONUÇ: PCR yönteminin, serviko-vajinal sıvı örneklerinden Actinomyces türlerinin tespit edilmesinde ve tiplendirilmesinde, basit, hızlı ve oldukça ayırt edici bir yöntem olduğu görülmüştür.

Abstract

OBJECTIVE: To detect the most common Actinomyces species correctly in cervico-vaginal fluid samples by using Polymerase Chain Reaction (PCR) technique. STUDY DESIGN: Cervico-vaginal fluid samples were obtained from 200 patients and bacterial genomic DNA was isolated directly from samples of each patient. The PCR technique was used for two purposes. First was applied for the detection of Actinomycetales including the genus Actinomyces and second was used for the differentiation of Actinomyces spp from each other. RESULTS: Actinomycetales was detected in 16 (8%) of 200 samples by PCR. In these 16 examined samples, 8 were positive for at least one of the following three species, namely A. meyeri (2.5%), A. viscosus (1%) and A. israelii (0.5%). No A. odontolyticus was detected in any of the fluid samples. CONCLUSION: PCR was shown to be a simple, rapid and highly discriminatory method for the identification and differentiation of Actinomyces spp in examining cervico-vaginal fluid samples.