Çocuklarda Covid-19 Hastalığının Mikrobiyolojik Tanısı

Özet

Son zamanlarda, Çin’de yeni bir koronavirüs hastalığı (COVID-19) ortaya çıkarak kısa sürede 185 ülkeye yayıldı ve sağlık sistemleri üzerinde önemli bir yük oluşturarak birçok insanın yaşamını kaybetmesine neden oldu. COVID-19 hastalığının kesin bir tedavi rejimi ya da aşısı yoktur. Fakat erken teşhis hastalığın ilerlemesini kontrol etmek ve popülasyondaki yayılımını sınırlamak için gereklidir. Bu nedenle, COVID-19’un gelecekte daha fazla yıkımını önlemek amacıyla hızlı ve doğru erken tanı yöntemleri yaşamsal öneme sahiptir. COVID-19’un tanısı, solunum yolu salgılarından rutin olarak kantitatif gerçek zamanlı ters transkriptaz‐polimeraz zincir reaksiyonu (rRT ‐ PCR) ile virüsün RNA’sının tespitine dayanır. RT-PCR, yüksek yanlış negatiflik oranları ve kit tedarikiyle ilgili sıkıntılar nedeniyle kuşkulu hastaların tanısı için memnun edici bir performans verememektedir. SARS‐CoV-2 enfeksiyonunun en iyi şekilde belirlenmesi için test kitinin kalitesinin ve standart çalışma prosedürünün hızlı bir şekilde optimize edilmesi gereklidir. Çocuklarda COVID-19’un tanı kriterleri; yetişkin hastaların temasına dayanarak, epidemiyolojisi ve klinik belirtileri ile formüle edilmiştir. Çocuklarda farklı klinik bulguların olması ve asemptomatik enfeksiyon oranlarının fazlalığı nedeniyle farklı tanı metodlarına gereksinim vardır. Bu derlemede, çocuklarda COVID-19 hastalığının moleküler testleri, serolojik yöntemleri, viral genomik sekanslama ve viral kültürü hakkındaki literatür bilgileri özetlenmiştir.

Abstract

Recently, a novel coronavirus (SARS-CoV-2) has emerged in Wuhan City of, China, rapidly spreading to 185 countries, and imposing a significant burden on global health systems which caused the death of many people. A definitively effective treatment regimen or a vaccine of COVID 19 infection does not exist. Early diagnosis of COVID-19 is vital in controlling progression of the disease and limiting viral spread within the population. Thus, rapid and accurate methods of early detection have vital importance to contain COVID-19 and prevent further spread in future. The diagnosis of COVID-19 is routinely based on the identification of the RNA of the virus obtained from respiratory secretions using quantitative real-time reverse transcriptase-polymerase chain reaction (rRT-PCR) assay. Limited by the high false negative rates and inadequate kit supply, RT-PCR cannot give a satisfactory performance for diagnosing suspicious patients. It is urgent to rapidly optimize the quality of testing kit and standard operating procedure for best testing of SARS-CoV-2 infection. The diagnostic criteria of COVID-19 in children were formulated based on the diagnosis of adult patients, combined with the characteristics of epidemiology and clinical manifestations of children. Different diagnostic methods are needed due to different clinical findings, and greater frequency of asymptomatic infection in children. In this review, molecular tests, serological methods, genomic sequencing and viral culture of COVİD-19 disease in children were summarized.