Dergiler / Türkiye Ormancılık Dergisi / 2023 / Cilt: 24 Sayı: 3

Türkiye’nin kuzeybatısındaki bir plantasyonda yerli ve egzotik çam türlerinin ibrelerinde görülen fungal endofitler

Fungal endophytes in the needles of native and exotic pine species in a planta-tion in Northwestern Türkiye

Sayfa
208–212
Yayın Tarihi
2023-09-30
DOI
—
🏛️Bu makalenin bibliyografik verileri ve tam metin bağlantısı DergiPark üzerinden sağlanmıştır.
DergiPark Kaydı ↗
✨

Yapay Zeka Hızlı Bakış & Çıkarımlar

AI Insight
⚡ TL;DR(1 Cümlede Hızlı Çıkarım)

En fazla oranda Pestalotiopsis funerea izole edilmiş, bunu Acremonium sp., Cladiosporum sp. ve Cyclaneusma minus takip etmiştir.

📌 3 Maddede Bu Makale

🎯
Amaç & Hipotez:İzmit Kerpe Araştırma Ormanı'nda 2016 yılında Pinus sylvestris, Pinus pinaster, Pinus nigra, Pinus taeda ve Pinus radiata ib-relerinde bulunan endofitik funguslar araştırılmıştır.
📊
Temel Bulgular & Veri:Her bir ibre yüzeysel olarak steril edilmiş ve 0,5 cm büyüklüğünde parçalara ayrılmış daha sonra Malt Ekstrakt Agar besi ortamına yerleştirilmiştir.
💡
Sonuç & Katkı:En fazla oranda Pestalotiopsis funerea izole edilmiş, bunu Acremonium sp., Cladiosporum sp. ve Cyclaneusma minus takip etmiştir.
🔬Tür:Araştırma Makalesi
📍Kapsam:2016 Verileri
⚙️Değişkenler:Fungal topluluk · Marmara Bölgesi · ITS bölgesi

Özet

İzmit Kerpe Araştırma Ormanı'nda 2016 yılında Pinus sylvestris, Pinus pinaster, Pinus nigra, Pinus taeda ve Pinus radiata ib-relerinde bulunan endofitik funguslar araştırılmıştır. Her çam türünden on ağacın tepe tacının alt kısmından sistematik olarak önceki yılın ibreleri örneklenmiştir. Her bir ibre yüzeysel olarak steril edilmiş ve 0,5 cm büyüklüğünde parçalara ayrılmış daha sonra Malt Ekstrakt Agar besi ortamına yerleştirilmiştir. Gelişen izolatlardan seçilen temsili 7 izolattan DNA ekstraksiyonu ya-pılarak, 5.8S rDNA, 18S ve 28S rDNA genleri arasında yer alan iki ITS bölgesini hedef alan ITS1 ve ITS4 primerleri kullanıla-rak amplifiye edilmiştir. Amplikonlar, evrensel fungus primerleri kullanılarak her iki yönde dizilenmiştir. Toplam 1000 ibreden (her çam türünden 200 ibre) yapılan izolasyonda 750 fungus izolatı elde edilmiştir. En fazla oranda Pestalotiopsis funerea izole edilmiş, bunu Acremonium sp., Cladiosporum sp. ve Cyclaneusma minus takip etmiştir.

Abstract

The endophytic fungi present in needles of Pinus sylvestris, Pinus pinaster, Pinus nigra, Pinus taeda and Pinus radiata were investigated in Kerpe Research Forest, İzmit in 2016. Ten trees of each pine species were sampled systematically. Previous years green needles were sampled from the lower part of the canopy, from two equally spaced positions around the tree. Each needle was surface sterilized and cut into 0.5 cm sections then individually placed onto malt extract agar plates. DNA was ex-tracted from reprensentative seven isolates and amplified using primers ITS1 and ITS4 targeting the nuclear 5.8S rDNA gene and the two ITS regions flanked between 18S and 28S rDNA genes. Amplicons sequenced in both directions using the univer-sal fungal primers ITS1 and ITS4. Isolations from a total of 1000 needles (200 from each pine species) yielded 750 fungal isolates. Pestalotiopsis funerea (Desm.) Steyaert was isolated at the highest frequency followed by Acremonium sp., Cladio-sporum sp. and Cyclaneusma minus.

🔖

Bu Makaleye Atıf Yap

KAYA, A. G. A., LEHTİJARVİ, T. D., LEHTİJARVİ, A. T. (2023). Türkiye’nin kuzeybatısındaki bir plantasyonda yerli ve egzotik çam türlerinin ibrelerinde görülen fungal endofitler. Türkiye Ormancılık Dergisi, Cilt: 24 Sayı: 3, 208–212. https://ajindex.com/articles/964802

📄 Tam Metin PDF Okuyucu

📄

PDF görüntüleyici hazırlanıyor...

Kaynakça (15)

  1. Agrios, G.N., 1988.
  2. Plant Pathology. Academic Press,
  3. New York, USA. Arnold, A.E., Henk, D.A., Eells, R.L., Lutzoni, F., Vilgalys, R., 2007. Diversity and phylogenetic affinities of foliar fungal endophytes in loblolly pine inferred by culturing and envi-ronmental PCR. Mycologia, 99: 185-206.
  4. Bills, G.F., 1996. Isolation and analysis of endophytic fungal communities from woody plants. See Reference, 124: 31–65.
  5. Brown, K.B., Hyde, K.D., Guest, D.I., 1998. Preliminary studies on endophytic fungal communities of Musa acuminata spe-cies complex in Hong Kong and Australia. Fungal Diversity, 1: 27-51.
  6. Botella, L., Dize, J.J., 2011. Phylogenic diversity of fungal endo-phytes in Spanish stands of Pinus halepensis. Fungal Diversity, 47:9-18.
  7. Collado, J., Platas, G., Peláez, F., González, I., Peláez, F., 1999. Geographical and seasonal influences on the distribution of fungal endophytes in Quercus ilex L. New Phytologist, 144: 525–532.
  8. Collado, J., Platas, G., Peláez, F., González, I., Peláez, F., 2000. Host specificity in fungal endophytic populations of Quercus ilex and Quercus faginea from Central Spain. Nova Hedwigia, 71: 42–430.
  9. Danti, R., Sieber, T.N., Sanguineti, G., 2002. Endophytic mycobi-ota in bark of European beech (Fagus sylvatica) in the Apen-nines. Mycological Research, 106: 1343-1348.
  10. El-Morsy, E.M., Dohlob, S.M., Hyde, K.D., 2006. Diversity of Alternaria alternata a common destructive pathogen of Eich-hornia crassipes in Egypt and its potential use in biological control. Fungal Diversity, 23: 139-158.
  11. Ercan, M., 2002. İzmit- Kerpe Araştırma Ormanı. Çevre ve Or-man BakanlığıTeknik Bülten 213 (15): 114s. Ganley, R.J., Brunsfeld, S.J., Newcombe, G., 2004. A community of unknown, endophytic fungi in western white pine. Pro-ceedings of the National Academy of Sciences, USA 101: 10107–10112.
  12. Giordano, L., Gonthier, P., Varese, G.C., Miserere, L., 2009. Mycobiota inhabiting sapwood of healthy and declining Scots pine (Pinus sylvestris L.) trees in the Alps. Fungal Diversity, 69-83.
  13. Gou, L.D., Huang, G.R., Wang, Y., 2008. Seasonal and tissue age influences on endophytic fungi of Pinus tabulaeformis (Pina-ceae) in the Dongling Mountains, Beijing. Journal of Integra-tive Plant Biology, 50(8): 997–1003.
  14. Göre, M.E., Bucak, C., 2007. Geographical and seasonal influ-ences on the distribution of fungal endophytes in Laurus no-bilis. Forest Pathology, 37: 281-288.
  15. Hata, K., Futai, K., Tsuda, M., 1998. Seasonal and needle age-dependent changes of the endophytic mycob