KaydedilenlerDerginizi ekleyin

Dergiler / Adnan Menderes Üniversitesi Ziraat Fakültesi Dergisi / 2023 / Cilt: 20 Sayı: 1

Liriomyza sativae Blanchard, 1938 (Diptera: Agromyzidae)’nin DNA Barkodlaması

DNA Barcoding of Liriomyza Sativae Blanchard Agromyzidae, 1938 (Diptera: Agromyzidae

Cem DAYAN
Eyüp Mennan YILDIRIM
Sayfa
167–172
Yayın Tarihi
2023-06-30
DOI
—
🏛️Bu makalenin bibliyografik verileri ve tam metin bağlantısı DergiPark üzerinden sağlanmıştır.
DergiPark Kaydı ↗
✨

Yapay Zeka Hızlı Bakış & Çıkarımlar

AI Insight
⚡ TL;DR(1 Cümlede Hızlı Çıkarım)

Çalışma sonucunda genetik çeşitlilik düşük bulunmuştur.

📌 3 Maddede Bu Makale

🎯
Amaç & Hipotez:Bu çalışmada İncirliova ve Koçarlı ilçelerinde (Aydın) sebze alanlarından toplanmış Liriomyza sativae’ nin DNA barkodlaması 2020-2022 yılları arasında yapılmıştır.
📊
Temel Bulgular & Veri:Morfolojik olarak tür teşhisi yapıldıktan sonra; örneklerin COI gen bölgesinin çoğaltılması için HCO/ LCO evrensel primerler kullanılmış ve 612 bç COI bölgesi elde edilmiştir.
💡
Sonuç & Katkı:Çalışma sonucunda genetik çeşitlilik düşük bulunmuştur.
🔬Tür:Araştırma Makalesi
📍Kapsam:2020-2022 Verileri
⚙️Değişkenler:COI · DNA barkodlama · Liriomyza sativae

Özet

Bu çalışmada İncirliova ve Koçarlı ilçelerinde (Aydın) sebze alanlarından toplanmış Liriomyza sativae’ nin DNA barkodlaması 2020-2022 yılları arasında yapılmıştır. Morfolojik olarak tür teşhisi yapıldıktan sonra; örneklerin COI gen bölgesinin çoğaltılması için HCO/ LCO evrensel primerler kullanılmış ve 612 bç COI bölgesi elde edilmiştir. Örneklerin sekans analizi Triogen Biyoteknoloji (İstanbul-Türkiye) tarafından yapılmıştır. Örnekler NCBI’da bulunan BLAST aracılığıyla kontrol edildiğinde türlerin L. sativae (% 99-100) ve L. trifolii (%97-99) olduğu görülmüştür. Örnekler Genbank’a kaydedilmiştir. Çalışma sonucunda genetik çeşitlilik düşük bulunmuştur.

Abstract

In this study, DNA barcoding of Liriomyza sativae collected from vegetable areas in Incirliova and Koçarlı districts (Aydın) was performed between 2020-2022. After the morphological diagnosis of L. sativae, HCO/LCO universal primers were used to reproduce the COI gene region of the samples and 612 bp COI regions were obtained. The sequence analysis of the samples was performed by Triogen Biotechnology (Istanbul, Türkiye). When the samples were checked through the BLAST located at NCBI, it was found that the species were L. sativae (99-100%) and L. trifolii (97-99%). The samples were registered to Genbank. As a result of the study, genetic diversity was found to be low.

🔖

Bu Makaleye Atıf Yap

DAYAN, C., YILDIRIM, E. M. (2023). Liriomyza sativae Blanchard, 1938 (Diptera: Agromyzidae)’nin DNA Barkodlaması. Adnan Menderes Üniversitesi Ziraat Fakültesi Dergisi, Cilt: 20 Sayı: 1, 167–172. https://ajindex.com/articles/953542

📄 Tam Metin PDF Okuyucu

📄

PDF görüntüleyici hazırlanıyor...

Kaynakça (14)

  1. Amin S, Scheffer SJ, Lewis ML, Pasha MK, Bhuiya BA (2014) DNA barcoding of the vegetableleafminer Liriomyza sativae Blanchard (Diptera: Agromyzidae) in Bangladesh. DNA Barcodes, 2: 29-33.
  2. Andersen A, Nordhus E, Vu TTA, Ha QH, Hofsvang T (2002) Polyphagaous Liriomyza species (Diptera: Agromyzidae) in vegetables in Vietnam. Tropical Agriculture, 79: 241-246.
  3. Bhuiya BA, Amin S, Mazumdar S (2011) First report of vegetable Leafminer Liriomyza sativae Blanchard (Diptera: Agromyzidae) through DNA barcoding. From Bangladesh. Journal of Taxonomy & Biodiversity Research, 5: 15-17.
  4. Civelek HS, Önder F (1997) Bitki hastalık etmenlerinin taşınmasında galerisineklerinin (Diptera: Agromyzidae) rolü üzerinde bir inceleme. Türkiye Entomoloji Dergisi, 3: 233-241.
  5. Civelek HS, Ulusoy MR (2000) Türkiye galerisinekleri (Diptera: Agromyzidae) için yeni bir kayıt: Ophiomyia phaseoli (Tryon, 1895). Türkiye Entomoloji Dergisi, 24: 163-166.
  6. Civelek HS, Tonguç A, Özgül O, Dursun O (2007) Contributions to The Turkish (Diptera: Agromyzidae) Fauna from Anatolian Part of Turkey, with sixteen New Records Mitteilungen Des Internationalen Entomologischen Vereins, 32(3-4): 151- 160. Civelek HS (2002) New records for the Turkish (Diptera: Agromyzidae) from Mugla Province, Western Turkey. Insecta Mundi, 16: 49-55
  7. Civelek HS (2003) Checklist of Agromyzidae (Diptera) Family of Turkey, with a New Record. Phytoparasitica. 31:132-138.
  8. Civelek HS (2004) Two new records for the Turkish Agromyzidae (Diptera) fauna. Türkiye Entomoloji Dergisi, 28: 1-10.
  9. Costa AS, Silva DM, Duffus JE (1988) Plant virus transmission by leafminer fly.Virology, 5(1): 145- 149 Çıkman E, Uygun N (2003) The determination of leafminers (Diptera:Agromyzidae) from Turkey, with four new records. Phytoparasitica, 33(4): 391-396.
  10. Çıkman E, Civelek HS (2005) Contributions to the Leafminer Fauna (Diptera: Agromyzidae) from Turkey, with Four New Records. Phytoparasitica, 33(4): 391-396.
  11. Çıkman E, Civelek HS (2007) Does Liriomyza cicerina Affect the Yield of Chickpeas (Cicer arietinum), Phytoparasitica, 35(2): 116-118.
  12. Deeming JC, Civelek HS (1997) Türkiye Agromyzidae (Diptera) familyası için yeni kayıtlar. Türkiye 3. Entomoloji Kongresi Bildirileri, Türkiye, Ankara, 526-533.
  13. Felsenstein J (1985) Confidence limits on the phylogenies an approach using the bootstrap. Evolution, 39(4): 783-791.
  14. Ferreira ECB, Freitas MTDS, Sombra KDDS, Siqueira HÁAD, Araujo ELD, Balbino VDQ (2017) Molecular Identification of Liriomyza sp. in the Northeast