Dergiler / Eskişehir Teknik Üniversitesi Bilim ve Teknoloji Dergisi - C Yaşam Bilimleri Ve Biyoteknoloji / 2017 / Cilt: 6 Sayı: 2

YENİDEN BİRLEŞTİRİLMİŞ PROTEİNLERİN PROTEAZ KULLANILMADAN SAFLAŞTIRILMASINDA İNTEİN ARACILI AYIRMA SÜREÇLERİNİN İNCELENMESİ ÜZERİNE BİR DERLEME

A REVIEW ON INTEIN MEDIATED RECOMBINANT PROTEIN PURIFICATION PROCESSES WITHOUT USE OF PROTEASE

Sayfa
95–102
Yayın Tarihi
2017-08-31
DOI
—
🏛️Bu makalenin bibliyografik verileri ve tam metin bağlantısı DergiPark üzerinden sağlanmıştır.
DergiPark Kaydı ↗
✨

Yapay Zeka Hızlı Bakış & Çıkarımlar

AI Insight
⚡ TL;DR(1 Cümlede Hızlı Çıkarım)

Çalışmalar amino asit eklenmesine daha yatkın olması nedeniyle C-inteinler üzerinde yoğunlaşmaktadır.

📌 3 Maddede Bu Makale

🎯
Amaç & Hipotez:Bu çalışmada, yapay proteinlerin proteaz kullanılmadan saflaştırılması süreçlerinde yararlanılan inteinlerin ayrılma aktivitelerinin artırılması için inteinler ve hedef proteinler üzerinde yapılan araştırmalar incelenmiştir.
📊
Temel Bulgular & Veri:İntein kullanımı ile protein ayrışması üzerinde yapılan araştırmalar, intein ve protein saflaştırma süreçlerinin daha verimli hale getirilmesini amaçlamaktadır.
💡
Sonuç & Katkı:Çalışmalar amino asit eklenmesine daha yatkın olması nedeniyle C-inteinler üzerinde yoğunlaşmaktadır.
🔬Tür:Araştırma Makalesi
📍Kapsam:Genişletilmiş Akademik Örneklem
⚙️Değişkenler:İntein · Rekombinant protein saflaştırma · Klonlama

Özet

Bu çalışmada, yapay proteinlerin proteaz kullanılmadan saflaştırılması süreçlerinde yararlanılan inteinlerin ayrılma aktivitelerinin artırılması için inteinler ve hedef proteinler üzerinde yapılan araştırmalar incelenmiştir. İntein kullanımı ile protein ayrışması üzerinde yapılan araştırmalar, intein ve protein saflaştırma süreçlerinin daha verimli hale getirilmesini amaçlamaktadır. In vivo ve in vitro olarak gerçekleşen süreçlerde, intein ve hedef protein içeren poliklonal PCR ürününün çoğaltılması ve ekspres plazmidlerin klonlanan suşlara taşınması işlemleri yapılmaktadır. İnteinin proteinden ayrılma aktivitesi ve ayrılma oranı sabiti kinetikleri, değişik pH, sıcaklık ve süzme sürelerinde belirlenmekte ve hedef proteinlere ilişkili olarak karşılaştırılmaları yapılmaktadır. Araştırmalarda değişik mikrobiyal doğal ve yapay inteinlerin protein ayrıştırma aktiviteleri incelenmiş ve yapay Nostoc punctiforme DnaE C-inteinlerinin ayrışma aktivitelerinin en yüksek olduğu belirlenmiştir. Çalışmalar amino asit eklenmesine daha yatkın olması nedeniyle C-inteinler üzerinde yoğunlaşmaktadır.

Abstract

In this study, researches on inteins and recombinant proteins to increase splitting activity of inteins that are utilised in recombinant protein purification processes without use of protease have been investigated. Researches on protein cleaving by use of inteins are aimed to make inteins and protein purification processes become more effective. The processes conducted in vivo ve in vitro, intein and target protein included polyclonal PCR products are cloned and the expressed plasmids are fused to cloned strains. Kinteics of activity of cleaving and activity of cleaving rates have been determined in different pH, temperature and filtration times. In the researches, protein cleaving activity of the different microbial natural and engineered inteins have been investigated and cleaving activity of recombinant Nostoc punctiforme DnaE C-inteins were found to be very high. The studies have been focused on the C-inteins due to recepient ability of the amino acid additions.

🔖

Bu Makaleye Atıf Yap

Ermurat, Y. (2017). YENİDEN BİRLEŞTİRİLMİŞ PROTEİNLERİN PROTEAZ KULLANILMADAN SAFLAŞTIRILMASINDA İNTEİN ARACILI AYIRMA SÜREÇLERİNİN İNCELENMESİ ÜZERİNE BİR DERLEME. Eskişehir Teknik Üniversitesi Bilim ve Teknoloji Dergisi - C Yaşam Bilimleri Ve Biyoteknoloji, Cilt: 6 Sayı: 2, 95–102. https://ajindex.com/articles/905339

📄 Tam Metin PDF Okuyucu

📄

PDF görüntüleyici hazırlanıyor...

Kaynakça (12)

  1. Aranko AS, Züger S, Buchinger E, Iwaï H. In Vivo and In Vitro Protein Ligation by Naturally Occurring and Engineered Split DnaE Inteins. PLoS ONE, 4(4): e5185, 2009.
  2. Arnau J, Lauritzen C, Petersen GE, Pedersen J. Current strategies for the use of affinity tags and tag removal for the purification of recombinant proteins. Protein Expression and Purification. 48: 1-13, 2006. doi:10.1016/j.pep.2005.12.002
  3. Banki MR, Feng L, Wood DW. Simple bioseparations using self-cleaving elastin-like polypeptide tags. Nat Methods. 2: 659-661, 2005. doi:10.1038/nmeth787
  4. Banki MR, Gerngross TU, Wood DW. Novel and economical purification of recombinant proteins: intein-mediated protein purification using in vivo polyhydroxybutyrate (PHB) matrix association. Protein Sci. 14:1387–1395, 2005. doi: 10.1110/ps.041296305
  5. Belfort M, Derbyshire V, Stoddard BL, Wood DW. Homing endonucleases and inteins. Berlin Heidelberg, Springer. 2005. New York
  6. Caubin J, Martin H, Roa A, Cosano I, Pozuelo M, de La Fuente JM, Sanchez-Puelles JM, Molina M, Nombela C. Choline-binding domain as a novel affinity tag for purification of fusion proteins produced in Pichia pastoris. Biotechnology and Bioengineering. 74, 164-171, 2001
  7. Coolbaugh MJ, Wood DW. Purification of Escherichia coli proteins using a self-cleaving chitin-binding affinity tag. Methods in Molecular Biology. 1177: 47-58, 2014. doi:10.1007/978-1-4939-1034-2_4
  8. Coolbaugh MJ. Recent advances in self-cleaving ıntein tag technology, PhD Dissertation, The Graduate School of The Ohio State University Graduate Program in Chemical Engineering. The Ohio State University Columbus OH. 2015
  9. Chong S, Xu MQ. Protein splicing of the Saccharomyces cerevisiae VMA intein without the endonuclease motifs. J Biol Chem. 272: 15587–155890, 1997. doi: 10.1074/jbc.272.25.15587
  10. Chong S, Mersha FB, Comb DG, Scott ME, Landry D, Vence LM, Perler FB, Benner J, Kucera RB, Hirvonen CA. Single-column purification of free recombinant proteins using a self-cleavable affinity tag derived from a protein splicing element. Gene. 192: 271–281, 1997
  11. Elleuche S, Nolting N, Pöggeler S. Inteins, valuable genetic elements in molecular biology and biotechnology. Appl Microbiol Biotechnol. 87: 479–489, 2010
  12. Fong BA, Gillies AR, Ghazi I, LeRoy G, Lee KC, Westblade LF, Wood DW. Purification of Escherichia coli RNA polymerase using a self-cleaving elastin-like polypeptide tag. Protein sc