Dergiler / Biyolojik Çeşitlilik ve Koruma / 2021 / Cilt: 14 Sayı: 2

Bor maden göletleri: bakteriyel çeşitliliğe metagenomik bakış

Boron mine ponds: metagenomic insight to bacterial diversity

Sayfa
229–235
Yayın Tarihi
2021-08-15
DOI
—
🏛️Bu makalenin bibliyografik verileri ve tam metin bağlantısı DergiPark üzerinden sağlanmıştır.
DergiPark Kaydı ↗
✨

Yapay Zeka Hızlı Bakış & Çıkarımlar

AI Insight
⚡ TL;DR(1 Cümlede Hızlı Çıkarım)

Ekim örneklerinde Sandarakinorhabdus, Pseudoanabena, Roseinatronobacter ve Pontimonas cinsine bağlı okumalar da tespit edilmiştir.

📌 3 Maddede Bu Makale

🎯
Amaç & Hipotez:Biyolojik potansiyeli olan yeni mikroorganizmaların kaynağı olabileceği için, bor içeriği yüksek ortamlarda bulunan mikroorganizmaların belirlenmesi ekolojik ve biyoteknolojik uygulama potansiyelleri açısından önemlidir.
📊
Temel Bulgular & Veri:Bu çalışmada, Balıkesir-Bigadiç ve Eskişehir-Kırka Bor Maden İşletmeleri atık madenciliği havuzlarındaki bakteri topluluğu, 16S rDNA gen hedefli Illumina MiSeq dizilimi kullanılarak incelenmiştir.
💡
Sonuç & Katkı:Ekim örneklerinde Sandarakinorhabdus, Pseudoanabena, Roseinatronobacter ve Pontimonas cinsine bağlı okumalar da tespit edilmiştir.
🔬Tür:Deneysel Tarla Denemesi
📍Kapsam:Genişletilmiş Akademik Örneklem
⚙️Değişkenler:bor · mikrobiyal çeşitlilik · yüksek verimli dizileme

Özet

Biyolojik potansiyeli olan yeni mikroorganizmaların kaynağı olabileceği için, bor içeriği yüksek ortamlarda bulunan mikroorganizmaların belirlenmesi ekolojik ve biyoteknolojik uygulama potansiyelleri açısından önemlidir. Bu bağlamda, bor madenciliği faaliyetlerinin gerçekleştirildiği çevrelerdeki birikinti suları boronofilik / boronotolerant mikroorganizmalar için önemli habitatlardır. Bu çalışmada, Balıkesir-Bigadiç ve Eskişehir-Kırka Bor Maden İşletmeleri atık madenciliği havuzlarındaki bakteri topluluğu, 16S rDNA gen hedefli Illumina MiSeq dizilimi kullanılarak incelenmiştir. Yüksek verimli dizilerin büyük kısımları Proteobacteria, Planctomycetes, Bacteriodetes, Verrucomicrobia ve Actinobacteria filumları ile ilişkili bulunmuştur. Cyanobacteria ve Parcubacteria, düşük miktara sahip diğer önemli gruplar arasındadır. Blastopirellula, Luteolibacter, Porhyrobacter ve Hydrogenophaga'ya ait cinsler tüm örneklerde en çok bulunan taksonlardır. Ekim örneklerinde Sandarakinorhabdus, Pseudoanabena, Roseinatronobacter ve Pontimonas cinsine bağlı okumalar da tespit edilmiştir. Mikrobiyal popülasyonların türü ve sayısı açısından örnekler arasında çarpıcı mevsimsel farklılıklar tespit edilmiştir.

Abstract

Since it can be a source of new microorganisms with biological potential, it is important to identify the microorganisms found in environments with high boron content in terms of ecological and biotechnological application potentials. In this context, deposit waters in environments where boron mining activities perform are important habitats for boronophilic/boronotolerant microorganisms. In this study, bacterial community in the waste mining ponds of Balıkesir-Bigadiç and Eskişehir-Kırka Boron Mining Operations were investigated by using 16S rDNA gene-targeted Illumina MiSeq sequencing. The greater parts of high-throughput sequences were related to Proteobacteria, Planctomycetes, Bacteriodetes, Verrucomicrobia and Actinobacteria phyla. Cyanobacteria and Parcubacteria were other notable groups with low abundance. Genera belonged to Blastopirellula, Luteolibacter, Porhyrobacter and Hydrogenophaga were the most abundant taxa for all the samples. Sandarakinorhabdus, Pseudoanabena, Roseinatronobacter and Pontimonas genera-affiliated reads were also detected at in the October samples. Striking seasonal variations were detected between samples in terms of the type and number of microbial populations.

🔖

Bu Makaleye Atıf Yap

ÇELİK, P. A., MUTLU, M. B., KORKMAZ, F., YAMAN, B. N., GEDİKLİ, S., ÇABUK, D. D. A. (2021). Bor maden göletleri: bakteriyel çeşitliliğe metagenomik bakış. Biyolojik Çeşitlilik ve Koruma, Cilt: 14 Sayı: 2, 229–235. https://ajindex.com/articles/902994

📄 Tam Metin PDF Okuyucu

📄

PDF görüntüleyici hazırlanıyor...

Kaynakça (11)

  1. Böcük, H., Yakar, A. & Türker, O. C. (2013). Assessment of Lemna gibba L. (duckweed) as a potential ecological indicator for contaminated aquatic ecosystem by boron mine effluent. Ecological Indicators, 29, 538–548. https://doi.org/10.1016/j.ecolind.2013.01.029
  2. Kabu M., Kabu, M., Uyarlar, C., Zarczynska, K., Milewska, W. & Sobiech, P. (2015). The role of boron in animal health. Journal of Elementology, 20(2), 535–541. https://doi.org/10.5601/jelem.2014.19.3.706
  3. Poyraz, N. & Mutlu, M. B. (2017). Alkaliphilic bacterial diversity of Lake Van/Turkey. Biological Diversity and Conservation, 10(1), 92-103.
  4. Gürsu, B. Y., Aytar, P., İlhan, S., Kocabıyık, Y. E., Gedıkli, S. & Çabuk, A. (2017). Diversity of microfungi in acid mine drainages. Biological Diversity and Conservation, 10(3), 190-198.
  5. Nural Yaman, B., Deniz Sonmez, G., Aytar Celik, P., Korkmaz, F., Mutlu, M. B. & Cabuk, A. (2019). Culture‐dependent diversity of boron‐tolerant bacteria from boron mine tailings pond and solid wastes. Water and Environment Journal, 33(4), 574–581. https://doi.org/10.1111/wej.12429
  6. Miwa, H. & Fujiwara, T. (2009). Isolation and identification of boron-accumulating bacteria from contaminated soils and active sludge. Soil Science and Plant Nutrition, 55(5), 643–646. https://doi.org/10.1111/j.1747-0765.2009.00402.x
  7. Ahmed, I., Yokota, A. & Fujiwara, T. (2007a). Chimaereicella boritolerans sp. Nov., a boron-tolerant and alkaliphilic bacterium of the family Flavobacteriaceae isolated from soil. International Journal of Systematic and Evolutionary Microbiology, 57(5), 986–992. https://doi.org/10.1099/ijs.0.64728-0
  8. Ahmed, I., Yokota, A. & Fujiwara, T. (2007b). Gracilibacillus boraciitolerans sp. Nov., a highly boron-tolerant and moderately halotolerant bacterium isolated from soil. International Journal of Systematic and Evolutionary Microbiology, 57(4), 796–802. https://doi.org/10.1099/ijs.0.64284-0
  9. Aytar, P., Kay, C. M., Mutlu, M. B., Çabuk, A. & Johnson, D. B. (2015). Diversity of acidophilic prokaryotes at two acid mine drainage sites in Turkey. Environmental Science and Pollution Research, 22(8), 5995–6003. https://doi.org/10.1007/s11356-014-3789-4
  10. Çınar, S. & Mutlu, M. B. (2016). Comparative analysis of prokaryotic diversity in solar salterns in eastern Anatolia (Turkey). Extremophiles, 20(5), 589–601. https://doi.org/10.1007/s00792-016-0845-7.
  11. Mutlu, M. B., Martínez-García, M., Santos, F., Peña, A., Guven, K. & Antón, J. (2008). Prokaryotic diversity in Tuz Lake, a hypersaline e