KaydedilenlerDerginizi ekleyin

Dergiler / Selçuk Üniversitesi Fen Fakültesi Fen Dergisi / 2018 / Cilt: 44 - Sayı: 1

Yüzey Sularında Bulunan Klebsiella pneumoniae'nin Özgül Olarak BelirlenmesindeTaqman RTi-PCR Yönteminin Uygulanması

Application of Taqman RTi-PCR Assay in Specific Detection of Klebsiella pneumoniae from Surface Waters

Esen TUTAR
Kübra Sueda AKINCI
İsmail AKYOL
Sayfa
95–106
Yayın Tarihi
2018-04-30
DOI
—
🏛️Bu makalenin bibliyografik verileri ve tam metin bağlantısı DergiPark üzerinden sağlanmıştır.
DergiPark Kaydı ↗
✨

Yapay Zeka Hızlı Bakış & Çıkarımlar

AI Insight
⚡ TL;DR(1 Cümlede Hızlı Çıkarım)

RTi-PCR bulguları geleneksel PCR ile teyit edilmiştir.

📌 3 Maddede Bu Makale

🎯
Amaç & Hipotez:Klebsiella pneumoniae, nozokomiyal enfeksiyonlara neden olan fırsatçı bir patojendir.
📊
Temel Bulgular & Veri:Yüzey suları örnekleri farklı bölgelerden toplanmış ve PCR ve RTi-PCR deneyleri kullanılarak analiz edilmiştir.
💡
Sonuç & Katkı:RTi-PCR bulguları geleneksel PCR ile teyit edilmiştir.
🔬Tür:Araştırma Makalesi
📍Kapsam:Genişletilmiş Akademik Örneklem
⚙️Değişkenler:K. pneumoniae · Taqman assay · RTi-PCR

Özet

Klebsiella pneumoniae, nozokomiyal enfeksiyonlara neden olan fırsatçı bir patojendir. Klebsiella pneumoniae'nin normal habitatı insan bağırsaklarıdır ve bakteri normal florasında hiçbir enfeksiyona neden olmaz. Çoğu Klebsiella enfeksiyonu hastane kaynaklıdır ancak K. pneumoniae doğada yaygın olarak bulunmasından dolayı çevresel kaynaklardan da transfer edilebilir. Ayrıca, K. pneumoniae'nin çevresel izolatları, klinik izolatlar gibi insanlar için bir risk oluşturmaktadır. Bu çalışma ile PCR ve RTi-PCR analizlerini kullanarak yüzey sularında K. pneumoniae'nin potansiyelini araştırmak amaçlanmıştır. Klebsiella pneumoniae için yüksek hassasiyet ve özgüllük ile PCR ve RTi-PCR analizleri optimize edilmiştir. Yüzey suları örnekleri farklı bölgelerden toplanmış ve PCR ve RTi-PCR deneyleri kullanılarak analiz edilmiştir. Sonuçlar, test edilen su örneklerinin K. pneumoniae ile farklı seviyelerde kontamine olduğunu göstermiştir. RTi-PCR bulguları geleneksel PCR ile teyit edilmiştir.

Abstract

Klebsiella pneumoniae is an opportunistic pathogen causing nosocomial infections. The normal habitat of K. pneumoniae is the human intestines and the bacterium causes no infection in normal flora. Although, many Klebsiella infections are hospital-acquired infections, K. pneumoniae may also be transferred from environmental sources due to its widely distribution in nature. The environmental isolates of K. pneumoniae additionally pose a risk to humans as clinical isolates. The present study aims to investigate the potential of K. pneumoniae in surface waters by using PCR and RTi-PCR assays. We have optimized PCR and RTi-PCR assays with high sensitivity and specificity for K. pneumoniae. Surface waters samples were collected from different regions and analyzed by using PCR and RTi-PCR assays. The results indicated that all tested water samples are contaminated with K. pneumoniae at different levels. The RTi-PCR findings were confirmed by conventional PCR.

🔖

Bu Makaleye Atıf Yap

TUTAR, E., AKINCI, K. S., AKYOL, İ. (2018). Yüzey Sularında Bulunan Klebsiella pneumoniae'nin Özgül Olarak BelirlenmesindeTaqman RTi-PCR Yönteminin Uygulanması. Selçuk Üniversitesi Fen Fakültesi Fen Dergisi, Cilt: 44 - Sayı: 1, 95–106. https://ajindex.com/articles/800349

📄 Tam Metin PDF Okuyucu

📄

PDF görüntüleyici hazırlanıyor...

Kaynakça (2)

  1. Aboh EA, Giwa FJ, Giwa A (2015). Microbiological assessment of well waters in Samaru, Zaria, Kaduna, State, Nigeria. Annals of African Medicine, 14: 32‑38. Barati A, Ghaderpour A, Chew LL, Bong CW, Thong KL, Chong VC, Chai LC (2016). Isolation and characterization of aquatic-borne Klebsiella pneumoniae from tropical estuaries in Malaysia. International Journal of Environmental Research and Public Health, 13. Chen L, Chavda KD, Findlay J, Peirano G, Hopkins K, Pitout JDD, Kreiswirth BN (2014). Multiplex PCR for identification of two capsular types in epidemic KPC-producing Klebsiella pneumoniae sequence type 258 strains. Antimicrobial Agents and Chemotherapy, 58: 4196‑4199. Clegg S and Murphy CN (2016). Epidemiology and Virulence of Klebsiella pneumoniae. Microbiology spectrum, 4: 1‑17. Deleo FR, Chen L, Porcella SF, Martens CA, Kobayashi SD, Porter AR, Kreiswirth BN (2014). Molecular dissection of the evolution of carbapenem-resistant multilocus sequence type 258 Klebsiella pneumoniae. Proc Natl Acad Sci U S A, 111: 4988‑4993. Delibato E, Fiore A, Anniballi F, Auricchio B, Filetici E, Orefice L, De Medici D (2011). Comparison between two standardized cultural methods and 24 hour duplex SYBR green real-time PCR assay for Salmonella detectionin meat samples. The new microbiologica, 34: 299‑306. Ding T, Suo Y, Zhang Z, Liu D, Ye X, Chen S, Zhao Y (2017). A Multiplex RT-PCR Assay for S. aureus, L. monocytogenes, and Salmonella spp. Detection in Raw Milk with Pre-enrichment. Frontiers in Microbiology, 8: 1‑11. Dong D, Liu W, Li H, Wang Y, Li X, Zou D, Yuan J (2015). Survey and rapid detection of Klebsiella pneumoniae in clinical samples targeting the rcsA gene in Beijing, China. Frontiers in Microbiology, 6: 1‑6. Fukushima H, Kawase J, Etoh Y, Sugama K, Yashiro S, Iida N, Yamaguchi K (2010). Simultaneous Screening of 24 Target Genes of Foodborne Pathogens in 35 Foodborne Outbreaks Using Multiplex Real-Time SYBR Green PCR Analysis. International journal of microbiology, 2010.
  2. Gadsby NJ, McHugh MP, Russell CD, Mark H, Conway-Morris A, Laurenson IF, Templeton KE (2015). Development of two real-time multiplex PCR assays for the detection and quantification of eight key bacterial pathogens in lower respiratory tract infections. Clinical Microbiology and Infection, 21: e788. Gierczyński R, Jagielski M, Rastawicki W, Kałuzewski S (2007). Multiplex-PCR assay for identification of Klebsiella pneumoniae isolates carrying the cps loci for K1 and K2 capsule biosynthesis. P