Dergiler / Journal of Research in Veterinary Medicine / 2018 / Cilt: 37 - Sayı: 1

Analysis of IGF1 C472T and TG C422T polymorphisms in Turkish Grey Steppe and Holstein Crossbred Bulls (Boz Irkı ve Holstein Melezi Erkek Sığırlarda IGF1 C472T ve TG C422T Polimorfizmlerinin Analizi)

Analysis of IGF1 C472T and TG C422T polymorphisms in Turkish Grey Steppe and Holstein Crossbred Bulls

Sayfa
21–28
Yayın Tarihi
2018-06-01
DOI
—
🏛️Bu makalenin bibliyografik verileri ve tam metin bağlantısı DergiPark üzerinden sağlanmıştır.
DergiPark Kaydı ↗
✨

Yapay Zeka Hızlı Bakış & Çıkarımlar

AI Insight
⚡ TL;DR(1 Cümlede Hızlı Çıkarım)

Bu çalışmadan elde edilen sonuçların insulin benzeri büyüme faktörü 1 ve tiroglobulin genleri kapsamında sığır genomunda yapılacak olan sonraki çalışmalara yararlı olabileceği düşünülmektedir.

📌 3 Maddede Bu Makale

🎯
Amaç & Hipotez:Bu çalışmanın amacı, Boz ırkı ve Holstein melezi erkek sığırlarda insulin benzeri büyüme faktörü 1 ve tiroglobulin genlerine ait genotipik dağılımın belirlenmesidir.
📊
Temel Bulgular & Veri:Çalışmada, akraba olmayan 30 baş Boz ırk ve 26 baş Holstein melez sığır kullanılmıştır.
💡
Sonuç & Katkı:Bu çalışmadan elde edilen sonuçların insulin benzeri büyüme faktörü 1 ve tiroglobulin genleri kapsamında sığır genomunda yapılacak olan sonraki çalışmalara yararlı olabileceği düşünülmektedir.
🔬Tür:Araştırma Makalesi
📍Kapsam:Genişletilmiş Akademik Örneklem
⚙️Değişkenler:sığır · Boz ırk · Holstein melezi

Özet

Bu çalışmanın amacı, Boz ırkı ve Holstein melezi erkek sığırlarda insulin benzeri büyüme faktörü 1 ve tiroglobulin genlerine ait genotipik dağılımın belirlenmesidir. Çalışmada, akraba olmayan 30 baş Boz ırk ve 26 baş Holstein melez sığır kullanılmıştır. Genomik DNA izolasyonu tam kandan standart fenol-kloroform yöntemi ile yapılmıştır. İnsulin benzeri büyüme faktörü 1 ve tiroglobulin genleri, C472T ve C422T polimorfizmlerine ait genotiplendirme işlemi için ise polimeraz zincir reaksiyonu- restriksiyon parçacık uzunluk polimorfizmi tekniği kullanılmıştır. Hardy-Weinberg eşitliğine uyum PopGene paket programı ile hesaplanmıştır. Bununla birlikte, heterozigotluk, efektif allel sayısı ve polimorfizm bilgi içeriğinden oluşan populasyon genetiği parametreleri allelik dağılım temel alınarak belirlenmiştir. İnsulin benzeri büyüme faktörü 1 geni için, A alleli frekansı iki ırk grubunda da yüksek bulunmuş ve BB genotipi gözlenmemiştir. Tiroglobulin geni için ise, TT genotipi gözlenmemiş, buna ek olarak, C allelinin ise hem Boz ırkta hem de Holstein melezlerinde neredeyse sabit olduğu belirlenmiştir. Bunun yanı sıra, oldukça düşük minör allel frekansları populasyon indekslerindeki düşük varyasyonlara sebep olmuştur. Bu çalışmadan elde edilen sonuçların insulin benzeri büyüme faktörü 1 ve tiroglobulin genleri kapsamında sığır genomunda yapılacak olan sonraki çalışmalara yararlı olabileceği düşünülmektedir.

Abstract

The aim of the study was to determine genotypic distribution of bovine insulin-like growth factor 1 and thyroglobulin genes in Turkish Grey Steppe (Boz) and Holstein crossbred bulls. In the study, unrelated 30 Turkish Grey and 26 Holstein crossbred cattle were used. Genomic DNA was isolated from whole blood using standart phenol-chloroform extraction method. The polymerase chain reaction-restriction fragment length polymorphism technique was used for genotyping of C472T and C422T polymorphisms in insulin-like growth factor 1 and thyroglobulin genes, respectively. Hardy-Weinberg equilibrium was calculated by using PopGene software program. In addition the population indexes including heterozygosity, number of effective alleles and polymorphism information content were determined on the basis of allelic distribution. For insulin-like growth factor 1 gene, A allele frequency was higher and BB genotype was not present in both breed groups. For thyroglobulin gene, TT genotype was not present and moreover C allele was almost fixed in both Turkish Grey and Holstein crossbred bulls. In addition, extremely low minor allele frequencies in resulted in low genetic variabilities of population indexes. The present results may be useful for future studies conducted on bovine genome with respect to insulin-like growth factor 1 and thyroglobulin genes.

🔖

Bu Makaleye Atıf Yap

ARDİCLİ, S. (2018). Analysis of IGF1 C472T and TG C422T polymorphisms in Turkish Grey Steppe and Holstein Crossbred Bulls (Boz Irkı ve Holstein Melezi Erkek Sığırlarda IGF1 C472T ve TG C422T Polimorfizmlerinin Analizi). Journal of Research in Veterinary Medicine, Cilt: 37 - Sayı: 1, 21–28. https://ajindex.com/articles/778600

📄 Tam Metin PDF Okuyucu

📄

PDF görüntüleyici hazırlanıyor...

Kaynakça (13)

  1. Akis I, Oztabak K. Bos indicus associated alleles in Anatolian cattle breeds support zebu introgression into Near East. J of Biol Res-Thessaloniki 19: 131-138, 2013.
  2. Akis I, Oztabak K, Gonulalp I, Mengi A, Un C. IGF-1 and IGF-1R gene polymorphisms in East Anatolian Red and South Anatolian Red cattle breeds. Russ J Genet, 46: 439-442, 2010.
  3. Andrade P, Grossi D, Paz C, Alencar M, Regitano L, Munari D. Association of an insulin‐like growth factor 1 gene microsatellite with phenotypic variation and estimated breeding values of growth traits in Canchim cattle. Anim Genet, 39, 480-485, 2008.
  4. Anton I, Kovacs K, Fesus L, Varhegyi J, Lehel L, Hajda Z, Polgar J, Szabo F, Zsolnai A. Effect of DGAT1 and TG gene polymorphisms on intramuscular fat and on milk production traits in different cattle breeds in Hungary. Acta Vet Hung, 56: 181-186, 2008.
  5. Anton I, Kovacs K, Hollo G, Farkas V, Szabo F, Egerszegi I, Ratky J, Zsolnai A, Brussow KP. Effect of DGAT1, leptin and TG gene polymorphisms on some milk production traits in different dairy cattle breeds in Hungary. Arch Tierz, 4: 307-314, 2012.
  6. Botstein D, White RL, Skolnick M, Davis RW. Construction of a genetic linkage map in man using restriction fragment length polymorphisms. Am J Hum Genet, 32: 314-331, 1980.
  7. Casas E, White S, Riley D, Smith T, Brenneman R, Olson T, Johnson D, Coleman S, Bennett G, Chase C. Assessment of single nucleotide polymorphisms in genes residing on chromosomes 14 and 29 for association with carcass composition traits in Bos indicus cattle. J Anim Sci, 83: 13-19, 2005.
  8. Choudhary V, Kumar P, Bhattacharya TK, Bhushan B, Sharma A. DNA polymorphism of leptin gene in Bos indicus and Bos taurus cattle. Genet Mol Biol, 28: 740-742, 2005.
  9. Curi RA, De Oliveira H, Silveira AC, Lopes C. Association between IGF-I, IGF-IR and GHRH gene polymorphisms and growth and carcass traits in beef cattle. Livest Prod Sci, 94: 159-167, 2005.
  10. De la Rosa Reyna X, Montoya H, Castrellon V, Rincon A, Bracamonte M, Vera W. Polymorphisms in the IGF1 gene and their effect on growth traits in Mexican beef cattle. Genet Mol Res 9: 875-883, 2010.
  11. Falconer DS, Mackay TFC, Introduction to quantitative genetics, 4th Ed., Pearson Education Ltd, Harlow, England, 1996.
  12. Gan QF, Zhang LP, Li JY, Hou GY, Gao X, Ren HY, Chen JB, Xu SZ. Association analysis of thyroglobulin gene variants with carcass and meat quality traits in beef cattle. J Appl Genet, 49: 251-255, 2008.
  13. Ge W, Davis M, Hines H, Irvin K, Simmen R. Association of a genetic m