Dergiler / Hacettepe Üniversitesi Eczacılık Fakültesi Dergisi / 2015 / Sayı: 2

Tek ve iki türlü biyofimlerde E.faecalis jelatinaz gen ekspresyon seviyelerinin belirlenmesi

Determination of Gelatinase gelE Expression Levels of Enterococcus faecalis in Mono and Dual Species Biofi lms

Sayfa
162–173
Yayın Tarihi
2015-06-01
DOI
—
🏛️Bu makalenin bibliyografik verileri ve tam metin bağlantısı DergiPark üzerinden sağlanmıştır.
DergiPark Kaydı ↗
✨

Yapay Zeka Hızlı Bakış & Çıkarımlar

AI Insight
⚡ TL;DR(1 Cümlede Hızlı Çıkarım)

İki türden oluşan biyofilm modelinde gözlenen bu gelE ekspresyon seviyesindeki artışı desteklemek amacıyla klinik izolatlar kullanılarak yapılacak çalışmalara ihtiyaç duyulmaktadır.

📌 3 Maddede Bu Makale

🎯
Amaç & Hipotez:Biyofilmler insan hayatını tehdit eden önemli bir problemdir.
📊
Temel Bulgular & Veri:E.faecalis’in bazı virulans faktörlerinin ekspresyon seviyelerinde, biyofilm oluşturabilen ve oluşturamayan izolatları arasında farklılıklar gözlenmiştir.
💡
Sonuç & Katkı:İki türden oluşan biyofilm modelinde gözlenen bu gelE ekspresyon seviyesindeki artışı desteklemek amacıyla klinik izolatlar kullanılarak yapılacak çalışmalara ihtiyaç duyulmaktadır.
🔬Tür:Modelleme & Sayısal Simülasyon
📍Kapsam:Genişletilmiş Akademik Örneklem
⚙️Değişkenler:Biyofilm · E.faecalis · Jelatinaz geni

Özet

Biyofilmler insan hayatını tehdit eden önemli bir problemdir. Son yıllarda, persistan enfeksiyonlara yol açan biyofilmlerin çoğunun polimikrobiyal olduğu gösterilmiştir. Enterococcus faecalis idrar yolu, yara enfeksiyonları vb. gibi hastane enfeksiyonlarından sıklıkla izole edilen fırsatçı bir patojendir. E.faecalis’in bazı virulans faktörlerinin ekspresyon seviyelerinde, biyofilm oluşturabilen ve oluşturamayan izolatları arasında farklılıklar gözlenmiştir. Jelatinaz, jelatini, kollajeni ve kazeini hidrolize eden metallo-proteaz enzimi olup, E.faecalis’in virulans faktörlerinden birisidir. Mutant suşlar kullanılarak yapılan bazı çalışmalarda bu enzimin biyofilm oluşumundaki rolü bulunmuştur. İlk amacımız, 11 E.faecalis idrar izolatının biyofilm oluşturabilme prevalansını belirlemektir. İkinci amacımız, tekrar edilebilirliği yüksek iki farklı mikrobiyal türden oluşan biyofilm modelini in vitro ortamda geliştirmek ve C.albicans’ın ortamdaki varlığının E.faecalis’in gelE gen ekspresyonu üzerindeki etkisinin kantitatif RT-PCR ile belirleyebilmektir. Çalışmamızda, test edilen her iki yöntemde de tüm izolatların biyofilm oluşturabildiği saptanmıştır. Ayrıca, E.faecalis ATCC 29212 suşu tarafından oluşturulan monomikrobiyal biyofilm modeline oranla, C.albicans ATCC 90028 ve E.faecalis ATCC 29212 tarafından oluşturulan ikili biyofilm modelinde gelE ekspresyon artışı olduğu sonuçlarımızda gösterilmiştir. İki türden oluşan biyofilm modelinde gözlenen bu gelE ekspresyon seviyesindeki artışı desteklemek amacıyla klinik izolatlar kullanılarak yapılacak çalışmalara ihtiyaç duyulmaktadır.

Abstract

Biofilms are substantial problem threatening human health. Recently, it was shown that most of biofilms leading to persistent infections were polymicrobial. E. faecalis is an opportunistic pathogen frequently isolated from hospital infections such as urinary tract, wound infections etc. Differences on expression levels of some virulence factors of E.faecalis were determined between biofilm producing and nonproducing isolates. Gelatinase, a metallo protease enzyme hydrolyzing gelatin, collagen and caseine, is one of the virulence factors of E.faecalis. The role of gelatinase with biofilm formation was found in some studies using mutant strains. Our first aim is to determine the prevalence of biofilm forming ability of 11 E.faecalis urine isolates. Our second aim is to set up an in vitro dual biofilm model in a repeatable style and to find out the impact of the presence of C.albicans on the gelE gene expression of E.faecalis by using RT-qPCR. In the present study, all isolates were found as biofilm producer by both method. Moreover, our results showed increased gelE expression in dual species biofilm formed by C. albicans ATCC 90028 and E. faecalis ATCC 29212 when we compared with E. faecalis monomicrobial biofilm form. Further studies with clinical isolates will be needed to support this increased gelE expression level in the dual biofilm.

🔖

Bu Makaleye Atıf Yap

KART, D. (2015). Tek ve iki türlü biyofimlerde E.faecalis jelatinaz gen ekspresyon seviyelerinin belirlenmesi. Hacettepe Üniversitesi Eczacılık Fakültesi Dergisi, Sayı: 2, 162–173. https://ajindex.com/articles/762344

📄 Tam Metin PDF Okuyucu

📄

PDF görüntüleyici hazırlanıyor...

Kaynakça (13)

  1. Choe, H.S., Son, S.W., Choi, H.A., Kim, H.J., Ahn, S.G., Bang, J.H., Lee, S.J., Lee, J.Y., Cho, Y.H., Lee, S.S.: Analysis of the distribution of bacteria within urinary catheter biofilms using four different molecular techniques, Am J Infect Control, 40, e249-254 (2012)
  2. Kart, D., Tavernier, S., Van Acker, H., Nelis, H. J., Coenye, T.: Activity of disinfectants against multispecies biofilms formed by Staphylococcus aureus, Candida albicans and Pseudomonas aeruginosa, Biofouling, 30(3), 377-383 (2014)
  3. Yang, L., Liu, Y., Wu, H., Hİiby, N., Molin, S., Song, Z.J.: Current understanding of multi- species biofilms, IJOS, 3, 2, 74 (2011)
  4. Wolcott, R., Costerton, J.W., Raoult, D., Cutler, S.J.: The polymicrobial nature of biofilm infection. Clin Microbiol Infect, 19(2), 107-112 (2013)
  5. Weimer, K.E., Juneau, R.A., Murrah, K.A. et al.: Divergent mechanisms for passive pneumococcal resistance to beta-lactam antibiotics in the presence of Haemophilus influenzae, J Infect Dis, 203, 549–555 (2011)
  6. Elias, S., Banin, E.: Multi-species biofilms: living with friendly neighbors, FEMS Microbiol Rev, Doi: 10.1111/j.1574-6976.2012.00325.x. [Epub ahead of print] (2012)
  7. Fischbach, M.A., Sonnenburg, J.L.: Eating for two: how metabolism estab- lishes interspecies interactions in the gut, Cell Host Microbe, 10, 336–347 (2011)
  8. Carlsson, J.: Bacterial metabolism in dental biofilms, Adv Dent Res, 11, 75–80 (1997)
  9. Madsen, J.S., Burmolle, M., Hansen, L.H., Sorensen, S.J.: The interconnection between biofilm formation and horizontal gene transfer, FEMS Immunol Med Microbiol, 65, 183–195 (2012)
  10. Arciola, C.R., Baldassarri, L., Campoccia, D., Creti, R., Prini, V., Huebner, J., Montanaro, L.: Strong biofilm production, antibiotic multi-resistance and high gelE expression in epidemic clones of Enterococcus faecalis from orthopaedic implant infections, Biomaterials, 29, 580- 586 (2008)
  11. Ruoff, K.L., de la Maza, M.J. Murtagh J.D. Spargo, and M.J. Ferraro.: Species identifies of enterococci isolated from clinical specimens, J.Clin.Microbiol, 28, 435-437 (1990)
  12. Cruz, M.R., Graham, C.E., Gagliano, B.C., Lorenz, M.C., Garsin, D.A.: Enterococcus faecalis inhibits hyphal morphogenesis and virulence of Candida albicans, Infect Immun, 81(1), 189-200, (2013)
  13. Hidron, A.I., Edwards, J.R., Patel, J., Horan, T.C., Sievert, D.M., Pollock, D.A., Fridkin, S.K.: NHSN annual update: antimicrobial-resistant pathogens associated with healthcare- associated infections: annual summary of data reported to the National